MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008319	GA	3	6	2502828	2502833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_008319	ATTGC	2	10	2502845	2502854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6503	NC_008319	GA	4	8	2502869	2502876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_008319	CT	3	6	2502971	2502976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6505	NC_008319	CAGC	2	8	2502990	2502997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6506	NC_008319	AAC	2	6	2502998	2503003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_008319	CAA	2	6	2503101	2503106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_008319	AACA	2	8	2503113	2503120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6509	NC_008319	CAA	2	6	2503145	2503150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_008319	ACTG	2	8	2505266	2505273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_008319	AAT	2	6	2505305	2505310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_008319	A	6	6	2505335	2505340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_008319	CAA	2	6	2505457	2505462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_008319	GAC	2	6	2505498	2505503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_008319	GTG	2	6	2505511	2505516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_008319	GTC	2	6	2505555	2505560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_008319	ACC	2	6	2505570	2505575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_008319	TCACA	2	10	2505633	2505642	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6519	NC_008319	CTG	2	6	2505644	2505649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_008319	GCA	2	6	2508798	2508803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_008319	TCA	2	6	2513647	2513652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_008319	G	6	6	2527478	2527483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_008319	ATGG	2	8	2527547	2527554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_008319	CAAC	2	8	2530724	2530731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_008319	CAT	2	6	2530767	2530772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_008319	GAG	2	6	2530796	2530801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_008319	GCGT	2	8	2530814	2530821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_008319	CTT	2	6	2532083	2532088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_008319	CAA	2	6	2534905	2534910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_008319	A	6	6	2534988	2534993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_008319	CAG	2	6	2535057	2535062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_008319	ACA	2	6	2535084	2535089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_008319	AAC	2	6	2535130	2535135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_008319	TAG	2	6	2538987	2538992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_008319	CAT	2	6	2540691	2540696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_008319	T	6	6	2540862	2540867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_008319	T	6	6	2540882	2540887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_008319	TTA	2	6	2540912	2540917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_008319	AGA	2	6	2545324	2545329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_008319	CTT	3	9	2545378	2545386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_008319	CT	3	6	2545389	2545394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_008319	TTC	2	6	2545528	2545533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_008319	CTC	2	6	2548368	2548373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_008319	CCG	2	6	2548385	2548390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_008319	AAC	2	6	2548426	2548431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_008319	TCA	2	6	2548448	2548453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_008319	TGA	2	6	2548478	2548483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_008319	TCAG	2	8	2548507	2548514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_008319	GTC	2	6	2548918	2548923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_008319	GCAT	2	8	2550418	2550425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_008319	ACTA	2	8	2550427	2550434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_008319	GCA	2	6	2550476	2550481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_008319	GCC	2	6	2550590	2550595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_008319	AGG	2	6	2550622	2550627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_008319	CTT	2	6	2550654	2550659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_008319	CAAA	2	8	2550670	2550677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_008319	CAC	2	6	2550728	2550733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_008319	A	6	6	2552435	2552440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_008319	CAAAGA	2	12	2552519	2552530	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6560	NC_008319	TCT	2	6	2552563	2552568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_008319	TAA	2	6	2554263	2554268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_008319	A	6	6	2554267	2554272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_008319	TCAA	2	8	2554299	2554306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_008319	ACT	2	6	2554811	2554816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_008319	CAG	2	6	2554845	2554850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_008319	ATC	2	6	2554858	2554863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_008319	AGC	2	6	2554926	2554931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_008319	ACG	2	6	2554944	2554949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_008319	CAT	2	6	2554963	2554968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_008319	TTG	2	6	2554973	2554978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_008319	CCG	2	6	2555252	2555257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_008319	TCGA	2	8	2556388	2556395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_008319	GAAA	2	8	2559846	2559853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_008319	AAT	2	6	2559894	2559899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_008319	CATC	2	8	2559925	2559932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_008319	AGG	2	6	2559972	2559977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_008319	ATTCA	2	10	2562760	2562769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6578	NC_008319	CCA	2	6	2562786	2562791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6579	NC_008319	CAA	2	6	2562792	2562797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_008319	ACA	2	6	2562798	2562803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_008319	CAA	3	9	2562819	2562827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_008319	GT	3	6	2562830	2562835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_008319	GCC	2	6	2562848	2562853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_008319	GCG	2	6	2565444	2565449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_008319	AGA	2	6	2567052	2567057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_008319	AAG	2	6	2567067	2567072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_008319	A	8	8	2567088	2567095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_008319	CGAC	2	8	2567102	2567109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_008319	AGA	2	6	2567218	2567223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_008319	GGCA	2	8	2567267	2567274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6591	NC_008319	GAA	2	6	2567275	2567280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_008319	CAA	2	6	2567328	2567333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_008319	ATA	2	6	2567360	2567365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_008319	TGAG	2	8	2567513	2567520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_008319	GCA	2	6	2567522	2567527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_008319	CGA	4	12	2567590	2567601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_008319	ACAG	2	8	2567633	2567640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_008319	AAG	2	6	2567641	2567646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_008319	CAAT	2	8	2567679	2567686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_008319	TGC	2	6	2567687	2567692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_008319	AT	3	6	2567736	2567741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_008319	ACA	2	6	2567745	2567750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_008319	ATTTT	2	10	2572996	2573005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_008319	T	6	6	2573002	2573007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_008319	TC	3	6	2576819	2576824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_008319	A	6	6	2579584	2579589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_008319	T	6	6	2579607	2579612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_008319	GGA	2	6	2579652	2579657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_008319	TGA	2	6	2579775	2579780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_008319	TCA	2	6	2579845	2579850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_008319	A	7	7	2579854	2579860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_008319	TAA	2	6	2579883	2579888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_008319	CTGC	2	8	2580041	2580048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_008319	AGA	2	6	2580076	2580081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_008319	CAAC	2	8	2580112	2580119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_008319	AAAT	2	8	2580120	2580127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_008319	TACT	2	8	2580148	2580155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_008319	CGAA	2	8	2580225	2580232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6619	NC_008319	T	7	7	2582829	2582835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_008319	ACC	2	6	2582888	2582893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_008319	TGTCT	2	10	2582914	2582923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6622	NC_008319	ACC	2	6	2582938	2582943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_008319	C	9	9	2582994	2583002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6624	NC_008319	CCT	2	6	2585049	2585054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_008319	A	6	6	2585063	2585068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_008319	CAAA	2	8	2585164	2585171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_008319	TGG	2	6	2586596	2586601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_008319	ATG	2	6	2588867	2588872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_008319	TTA	2	6	2590392	2590397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_008319	TTA	2	6	2590450	2590455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_008319	CT	3	6	2590506	2590511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6632	NC_008319	GAT	2	6	2592329	2592334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_008319	ATTTG	2	10	2592425	2592434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6634	NC_008319	CAT	2	6	2592442	2592447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6635	NC_008319	TGC	2	6	2592965	2592970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6636	NC_008319	TCC	2	6	2596202	2596207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6637	NC_008319	CGTCC	2	10	2596216	2596225	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6638	NC_008319	GAA	2	6	2596270	2596275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6639	NC_008319	TGA	2	6	2596515	2596520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6640	NC_008319	GAC	2	6	2596527	2596532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6641	NC_008319	GT	3	6	2601063	2601068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6642	NC_008319	CAA	2	6	2602809	2602814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6643	NC_008319	TGC	2	6	2605376	2605381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6644	NC_008319	CCG	2	6	2605411	2605416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6645	NC_008319	AGG	2	6	2606738	2606743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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