MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008319	TGG	2	6	1612020	1612025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_008319	ATT	3	9	1612031	1612039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_008319	A	6	6	1612173	1612178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008319	A	6	6	1612187	1612192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008319	ATG	2	6	1612348	1612353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_008319	GTC	2	6	1612374	1612379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_008319	AAC	2	6	1612645	1612650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_008319	AG	3	6	1612702	1612707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_008319	CTC	2	6	1612915	1612920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_008319	GAA	2	6	1612926	1612931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_008319	ATCA	2	8	1612966	1612973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_008319	TAA	2	6	1613012	1613017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_008319	TACT	2	8	1613022	1613029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_008319	A	6	6	1613042	1613047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_008319	CT	3	6	1613076	1613081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_008319	AAC	2	6	1613105	1613110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_008319	ACA	2	6	1613111	1613116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_008319	T	8	8	1613148	1613155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_008319	ATCT	2	8	1613171	1613178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_008319	TA	3	6	1613902	1613907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008319	ACC	2	6	1613945	1613950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_008319	GAT	2	6	1613980	1613985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008319	TCA	2	6	1614028	1614033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_008319	ACG	2	6	1614052	1614057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008319	TCG	2	6	1614066	1614071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_008319	AAC	2	6	1614084	1614089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_008319	C	6	6	1614107	1614112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4528	NC_008319	CAG	2	6	1614218	1614223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_008319	CAAA	2	8	1614515	1614522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_008319	CATGA	2	10	1614554	1614563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4531	NC_008319	CA	3	6	1614683	1614688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_008319	TCAGC	2	10	1614708	1614717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4533	NC_008319	TGCAC	2	10	1614727	1614736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4534	NC_008319	CAG	2	6	1616112	1616117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008319	CAA	2	6	1616134	1616139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008319	CACT	2	8	1616152	1616159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_008319	ATT	2	6	1616474	1616479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_008319	CGAA	2	8	1616499	1616506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_008319	GCT	2	6	1616910	1616915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_008319	CTGC	2	8	1616952	1616959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_008319	AAC	2	6	1617061	1617066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_008319	GCT	2	6	1617086	1617091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008319	GAT	2	6	1617125	1617130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008319	ATGCA	2	10	1617191	1617200	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4545	NC_008319	TGA	3	9	1617216	1617224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_008319	AAC	2	6	1617445	1617450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_008319	AAG	2	6	1617456	1617461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008319	GAT	2	6	1617476	1617481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_008319	AATC	2	8	1617630	1617637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_008319	ATCA	2	8	1617697	1617704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_008319	A	6	6	1617827	1617832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_008319	TGT	2	6	1618653	1618658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008319	GCA	2	6	1618838	1618843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_008319	TGA	2	6	1618861	1618866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008319	AGT	2	6	1618888	1618893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008319	CAG	2	6	1618899	1618904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_008319	TAA	2	6	1619261	1619266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008319	AAT	2	6	1619474	1619479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_008319	AGC	2	6	1619489	1619494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_008319	CAA	2	6	1619501	1619506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008319	GAA	2	6	1619508	1619513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008319	CAA	2	6	1619599	1619604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_008319	ACC	2	6	1621871	1621876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_008319	CAA	2	6	1622232	1622237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_008319	TAC	2	6	1622244	1622249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_008319	AGT	2	6	1622252	1622257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008319	AAT	2	6	1622269	1622274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008319	TACC	2	8	1622508	1622515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_008319	CAA	2	6	1622579	1622584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_008319	GCA	2	6	1622644	1622649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_008319	ACC	2	6	1623588	1623593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_008319	AATC	2	8	1623594	1623601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_008319	ACA	2	6	1623620	1623625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_008319	ATT	2	6	1623640	1623645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_008319	AGA	2	6	1623649	1623654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_008319	GAA	2	6	1623706	1623711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_008319	TCA	2	6	1623803	1623808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_008319	AG	3	6	1623892	1623897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_008319	CAAC	2	8	1624090	1624097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_008319	A	6	6	1624130	1624135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008319	AAC	2	6	1624166	1624171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_008319	A	6	6	1624172	1624177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_008319	CAT	2	6	1624205	1624210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_008319	CAA	2	6	1624275	1624280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_008319	AGT	2	6	1624320	1624325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_008319	A	6	6	1624607	1624612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_008319	TCA	2	6	1625231	1625236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_008319	AGC	2	6	1625250	1625255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_008319	ATG	2	6	1625296	1625301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_008319	CGA	2	6	1625317	1625322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_008319	CATC	2	8	1626054	1626061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_008319	GTC	2	6	1626126	1626131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_008319	ATT	2	6	1626404	1626409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_008319	CAG	2	6	1626422	1626427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_008319	CCAA	2	8	1627318	1627325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_008319	TTA	2	6	1628313	1628318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_008319	AATA	2	8	1628321	1628328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_008319	CTCA	2	8	1628329	1628336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_008319	GAGC	2	8	1628342	1628349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_008319	GCA	2	6	1628429	1628434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_008319	TTC	2	6	1628485	1628490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008319	AAG	2	6	1629000	1629005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_008319	TTG	2	6	1629035	1629040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_008319	ATCA	2	8	1629444	1629451	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4605	NC_008319	TCAC	2	8	1629468	1629475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_008319	AAC	2	6	1629485	1629490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_008319	CAA	2	6	1629553	1629558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_008319	ATC	2	6	1629594	1629599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_008319	CTC	2	6	1631214	1631219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_008319	AGA	2	6	1631542	1631547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_008319	AGC	2	6	1631792	1631797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_008319	CAT	2	6	1633501	1633506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_008319	CAAT	2	8	1633605	1633612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_008319	CAA	2	6	1633689	1633694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_008319	CTGG	2	8	1633964	1633971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_008319	ACC	2	6	1633981	1633986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_008319	GGGC	2	8	1634009	1634016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_008319	GAT	2	6	1634048	1634053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_008319	CCAT	2	8	1634057	1634064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_008319	GCA	2	6	1634069	1634074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_008319	TCA	2	6	1634726	1634731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_008319	GAC	2	6	1636676	1636681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_008319	TCG	2	6	1636686	1636691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_008319	CGTGA	2	10	1636702	1636711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4625	NC_008319	ACCGA	2	10	1636720	1636729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4626	NC_008319	GC	3	6	1636769	1636774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_008319	GAA	2	6	1636782	1636787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_008319	TGC	2	6	1636798	1636803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_008319	TG	3	6	1637288	1637293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_008319	ATTC	2	8	1637458	1637465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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