MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008258	CGT	2	6	699134	699139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_008258	CCA	2	6	699142	699147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_008258	T	7	7	699150	699156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_008258	TCT	2	6	699340	699345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_008258	GAA	2	6	699451	699456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_008258	ATG	2	6	699502	699507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_008258	CGT	2	6	699527	699532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_008258	CCA	2	6	699535	699540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_008258	TTG	2	6	699585	699590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_008258	A	6	6	699780	699785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008258	TTCA	2	8	699818	699825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_008258	TGT	2	6	699919	699924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_008258	ATC	2	6	701110	701115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_008258	GCA	2	6	701189	701194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_008258	CTA	2	6	701226	701231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_008258	T	6	6	702705	702710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008258	CT	3	6	702711	702716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_008258	AAT	2	6	702764	702769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_008258	CGG	2	6	702800	702805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_008258	CCG	2	6	704361	704366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_008258	ACG	2	6	704377	704382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_008258	TAAC	2	8	704393	704400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_008258	ACG	2	6	704413	704418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_008258	GATA	2	8	705311	705318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008258	CTT	2	6	706866	706871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_008258	CAC	2	6	707025	707030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_008258	GGTGC	2	10	707085	707094	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2528	NC_008258	ACAA	2	8	707106	707113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_008258	AAC	2	6	707195	707200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_008258	AGA	2	6	707239	707244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_008258	GCT	2	6	708306	708311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_008258	T	6	6	708318	708323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_008258	GC	3	6	710501	710506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_008258	CA	3	6	710575	710580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_008258	CAC	2	6	711550	711555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_008258	GGT	2	6	711566	711571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008258	TTTC	2	8	711591	711598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_008258	GCG	2	6	713299	713304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_008258	TGC	2	6	713309	713314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_008258	A	6	6	713330	713335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_008258	AAT	2	6	715504	715509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_008258	ACT	2	6	715529	715534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_008258	T	6	6	715534	715539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_008258	ATT	2	6	715540	715545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_008258	CATT	2	8	718312	718319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2546	NC_008258	AATG	2	8	718321	718328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_008258	TTAT	2	8	718351	718358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_008258	ATA	2	6	718375	718380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_008258	ATATA	2	10	718421	718430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_008258	TAA	2	6	720019	720024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_008258	TTGCT	2	10	720042	720051	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2552	NC_008258	AAT	2	6	720085	720090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_008258	CAT	2	6	720096	720101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_008258	GGA	2	6	722811	722816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_008258	T	7	7	725719	725725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_008258	GCG	2	6	725844	725849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_008258	GAT	2	6	725858	725863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_008258	A	7	7	732306	732312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_008258	TTACG	2	10	732344	732353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2560	NC_008258	CTC	2	6	732671	732676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_008258	ATA	2	6	733412	733417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_008258	CGTTC	2	10	733551	733560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2563	NC_008258	ATT	2	6	733575	733580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_008258	T	6	6	733585	733590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_008258	ATT	2	6	733595	733600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_008258	CAA	3	9	734635	734643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_008258	GCT	2	6	734668	734673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_008258	ACA	2	6	734731	734736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_008258	ATTGA	2	10	734741	734750	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_008258	ACGC	2	8	734782	734789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_008258	TAA	2	6	735762	735767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_008258	TTAC	2	8	735768	735775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_008258	TCTG	2	8	735777	735784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_008258	A	6	6	735787	735792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_008258	T	6	6	735811	735816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_008258	CTT	2	6	736067	736072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_008258	CG	3	6	736132	736137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2578	NC_008258	CA	3	6	736138	736143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_008258	A	7	7	736180	736186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008258	CCT	2	6	736983	736988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_008258	ACG	2	6	737011	737016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_008258	ATT	2	6	737017	737022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_008258	CAAAT	2	10	737046	737055	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2584	NC_008258	A	8	8	737459	737466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_008258	GTT	2	6	737852	737857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_008258	AAG	2	6	737865	737870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_008258	CTA	3	9	738480	738488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2589	NC_008258	GCT	2	6	738550	738555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2591	NC_008258	GAT	2	6	738605	738610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_008258	CGT	2	6	738612	738617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_008258	ATC	2	6	738718	738723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_008258	TA	3	6	738733	738738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008258	AT	4	8	738739	738746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008258	T	6	6	738773	738778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_008258	CCA	2	6	738829	738834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_008258	AC	3	6	738842	738847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_008258	ATT	2	6	738848	738853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_008258	T	6	6	738978	738983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_008258	TAT	2	6	739005	739010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_008258	TCC	2	6	740448	740453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_008258	AAT	2	6	740523	740528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_008258	GGC	2	6	740534	740539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_008258	GTG	2	6	740569	740574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_008258	TCA	2	6	740725	740730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_008258	CTGG	2	8	740739	740746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_008258	A	6	6	740831	740836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_008258	ATT	2	6	740852	740857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2618	NC_008258	A	6	6	740967	740972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_008258	AAAAAC	2	12	740975	740986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2620	NC_008258	A	6	6	741014	741019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_008258	AAC	2	6	741034	741039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_008258	TG	3	6	741099	741104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_008258	TA	3	6	741678	741683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_008258	GGTTT	2	10	741729	741738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_008258	ATT	2	6	741773	741778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_008258	TGGT	2	8	741809	741816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_008258	A	7	7	741868	741874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2631	NC_008258	ACA	2	6	744049	744054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_008258	TTA	2	6	744103	744108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_008258	CAGA	2	8	744132	744139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2634	NC_008258	TGA	2	6	744148	744153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_008258	T	6	6	744944	744949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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