MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_008258	GCC	2	6	2350332	2350337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9502	NC_008258	CCG	2	6	2350353	2350358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9503	NC_008258	CCA	2	6	2350389	2350394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9504	NC_008258	CAT	2	6	2350412	2350417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_008258	GCC	2	6	2350431	2350436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NC_008258	GGC	2	6	2350572	2350577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_008258	CTT	2	6	2350582	2350587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_008258	GTT	2	6	2350607	2350612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_008258	GCCA	2	8	2350661	2350668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9510	NC_008258	ACC	2	6	2350770	2350775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9511	NC_008258	CAG	2	6	2350789	2350794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_008258	TCA	2	6	2350804	2350809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9513	NC_008258	TAG	2	6	2350856	2350861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_008258	CCG	3	9	2350866	2350874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9515	NC_008258	CGTCA	2	10	2350964	2350973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9516	NC_008258	AACG	2	8	2351195	2351202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9517	NC_008258	CTT	2	6	2351272	2351277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_008258	CCG	2	6	2351287	2351292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9519	NC_008258	TGC	2	6	2351367	2351372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9521	NC_008258	GC	3	6	2351442	2351447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9522	NC_008258	GTC	2	6	2351472	2351477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_008258	TGT	2	6	2351615	2351620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_008258	TAT	2	6	2351632	2351637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_008258	TCGC	2	8	2351661	2351668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9527	NC_008258	CGC	2	6	2351701	2351706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9528	NC_008258	GCT	2	6	2351768	2351773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9532	NC_008258	CCG	2	6	2351847	2351852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9533	NC_008258	GCACC	2	10	2351920	2351929	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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9537	NC_008258	TTG	2	6	2352125	2352130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9540	NC_008258	CGC	2	6	2352473	2352478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9541	NC_008258	CTG	2	6	2352502	2352507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_008258	CGC	2	6	2352532	2352537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9543	NC_008258	TCA	2	6	2352555	2352560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_008258	TA	3	6	2352601	2352606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_008258	TTAT	2	8	2352651	2352658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_008258	TGCT	2	8	2352678	2352685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9547	NC_008258	TAT	3	9	2352691	2352699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9551	NC_008258	ATT	2	6	2352794	2352799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_008258	CAT	2	6	2352826	2352831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9553	NC_008258	ATT	2	6	2352839	2352844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_008258	AGA	2	6	2352899	2352904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_008258	CCA	2	6	2352915	2352920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9556	NC_008258	GCC	2	6	2352923	2352928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9560	NC_008258	ATT	2	6	2353115	2353120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_008258	A	6	6	2353132	2353137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_008258	CTG	2	6	2354530	2354535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9564	NC_008258	GCC	2	6	2354581	2354586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9565	NC_008258	CAT	2	6	2354681	2354686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_008258	TA	3	6	2354689	2354694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_008258	TCTT	2	8	2354732	2354739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9568	NC_008258	TTA	2	6	2354776	2354781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9573	NC_008258	TATAA	2	10	2354877	2354886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_008258	AAC	2	6	2354933	2354938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9585	NC_008258	TTA	2	6	2359992	2359997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9591	NC_008258	AACC	2	8	2360278	2360285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9592	NC_008258	TAC	2	6	2360347	2360352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9594	NC_008258	GA	3	6	2362927	2362932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_008258	TAAAT	2	10	2362976	2362985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9596	NC_008258	CA	3	6	2362997	2363002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9597	NC_008258	TTA	2	6	2363003	2363008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9601	NC_008258	GCTC	2	8	2369300	2369307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9602	NC_008258	GTA	2	6	2370176	2370181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9605	NC_008258	AAT	2	6	2370875	2370880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9606	NC_008258	A	6	6	2370890	2370895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_008258	AC	3	6	2370899	2370904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9608	NC_008258	AC	3	6	2370914	2370919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9609	NC_008258	ATA	3	9	2370924	2370932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9611	NC_008258	A	6	6	2372247	2372252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_008258	GTTAA	2	10	2372295	2372304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_008258	ACA	2	6	2372346	2372351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9617	NC_008258	T	6	6	2379994	2379999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_008258	GCCA	2	8	2380002	2380009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9619	NC_008258	AATGG	2	10	2380086	2380095	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_008258	GC	3	6	2382427	2382432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9621	NC_008258	TAC	2	6	2387160	2387165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9623	NC_008258	ACTA	2	8	2387534	2387541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9624	NC_008258	GTT	2	6	2387551	2387556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9625	NC_008258	TTA	3	9	2389009	2389017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9626	NC_008258	AT	3	6	2389060	2389065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_008258	CCAC	2	8	2389066	2389073	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9628	NC_008258	ATG	2	6	2389190	2389195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9629	NC_008258	ATT	2	6	2389212	2389217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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