MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_008258	TTA	2	6	2207286	2207291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_008258	A	8	8	2207341	2207348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_008258	TGA	2	6	2207384	2207389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_008258	TGA	2	6	2207438	2207443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_008258	GCA	2	6	2207496	2207501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_008258	ACT	2	6	2207533	2207538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_008258	ATCA	2	8	2207559	2207566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9008	NC_008258	CTGCG	2	10	2207639	2207648	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9009	NC_008258	GCA	2	6	2207658	2207663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_008258	GCA	2	6	2207667	2207672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_008258	AGA	2	6	2207696	2207701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_008258	AAT	2	6	2207703	2207708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_008258	GCCA	2	8	2207858	2207865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9014	NC_008258	TAG	2	6	2207866	2207871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_008258	CCA	2	6	2207877	2207882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_008258	GAAAAA	2	12	2207891	2207902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_008258	AGA	2	6	2207963	2207968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_008258	AT	3	6	2207993	2207998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_008258	GAA	2	6	2208030	2208035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_008258	TAC	2	6	2208038	2208043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_008258	ACG	2	6	2208071	2208076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_008258	AT	3	6	2208089	2208094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_008258	ATT	2	6	2208136	2208141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_008258	TTCA	2	8	2208169	2208176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9025	NC_008258	ATT	2	6	2208187	2208192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_008258	ACA	2	6	2208210	2208215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_008258	ATACCG	2	12	2208275	2208286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_008258	TAAA	2	8	2212543	2212550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_008258	CGG	2	6	2213030	2213035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_008258	GCC	2	6	2213050	2213055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9031	NC_008258	CTG	2	6	2215945	2215950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_008258	AGC	3	9	2215952	2215960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_008258	ACAT	2	8	2216017	2216024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_008258	CTTT	2	8	2216038	2216045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_008258	AAAAT	2	10	2216102	2216111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_008258	A	6	6	2217565	2217570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_008258	CG	3	6	2217702	2217707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_008258	CGA	2	6	2217729	2217734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_008258	ATT	2	6	2217773	2217778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_008258	CGA	2	6	2217791	2217796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_008258	CGA	2	6	2217801	2217806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_008258	AGG	2	6	2217924	2217929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_008258	GCA	2	6	2218254	2218259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_008258	CGT	2	6	2218271	2218276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_008258	TTTTTC	2	12	2218285	2218296	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9046	NC_008258	GCA	2	6	2219303	2219308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_008258	TAAC	2	8	2219417	2219424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9048	NC_008258	T	7	7	2219480	2219486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_008258	TTA	2	6	2219557	2219562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_008258	GACT	2	8	2221277	2221284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_008258	GCCC	2	8	2221299	2221306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9052	NC_008258	TCT	2	6	2221399	2221404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_008258	TAAAT	2	10	2223436	2223445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_008258	GAA	2	6	2223449	2223454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_008258	TCG	2	6	2223575	2223580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_008258	ATG	2	6	2224419	2224424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_008258	TTCCAT	2	12	2224449	2224460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_008258	TCCT	2	8	2224467	2224474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9059	NC_008258	GTG	2	6	2224492	2224497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_008258	TA	3	6	2225167	2225172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_008258	ATTT	2	8	2225181	2225188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_008258	ATT	2	6	2225316	2225321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_008258	TTA	3	9	2225323	2225331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_008258	CAC	2	6	2226487	2226492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_008258	AGGA	2	8	2226510	2226517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_008258	ATGGAA	2	12	2226524	2226535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_008258	CAT	2	6	2226560	2226565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_008258	TCA	2	6	2228721	2228726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_008258	TCTG	2	8	2228735	2228742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9070	NC_008258	TAA	2	6	2228766	2228771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_008258	TTG	2	6	2228819	2228824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_008258	GGC	2	6	2228998	2229003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_008258	ATT	2	6	2229167	2229172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_008258	AGGA	2	8	2229199	2229206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_008258	CG	3	6	2230055	2230060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9076	NC_008258	CGG	2	6	2230102	2230107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_008258	CAC	2	6	2231655	2231660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9078	NC_008258	CAA	2	6	2231698	2231703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_008258	GCT	2	6	2231718	2231723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_008258	A	6	6	2231782	2231787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_008258	TGG	2	6	2231804	2231809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_008258	ACC	2	6	2231830	2231835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_008258	CAA	2	6	2231866	2231871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_008258	CTCG	2	8	2231890	2231897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9085	NC_008258	TCAA	2	8	2231907	2231914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9086	NC_008258	TGGTG	2	10	2231949	2231958	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_008258	CAG	2	6	2231984	2231989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_008258	TGT	2	6	2235950	2235955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_008258	GCG	2	6	2236078	2236083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_008258	TTC	2	6	2238485	2238490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9091	NC_008258	TTG	2	6	2238493	2238498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_008258	ATG	2	6	2238547	2238552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_008258	GA	4	8	2238553	2238560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_008258	T	6	6	2238645	2238650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_008258	CCA	2	6	2238653	2238658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9096	NC_008258	CCG	2	6	2241399	2241404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9097	NC_008258	CAT	2	6	2241434	2241439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_008258	TGC	2	6	2241483	2241488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_008258	TTG	2	6	2242128	2242133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_008258	ATT	2	6	2242176	2242181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_008258	T	6	6	2242180	2242185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_008258	ATGT	2	8	2242213	2242220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_008258	GCC	2	6	2243019	2243024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_008258	CAC	2	6	2243079	2243084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9105	NC_008258	ATC	2	6	2243160	2243165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_008258	CCG	2	6	2243260	2243265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_008258	GCG	2	6	2243306	2243311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_008258	TGA	2	6	2243336	2243341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_008258	GCCCT	2	10	2243349	2243358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9110	NC_008258	CATCAA	3	18	2243405	2243422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_008258	TCA	2	6	2243443	2243448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_008258	ATT	2	6	2243490	2243495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_008258	ACC	2	6	2243608	2243613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_008258	CG	3	6	2243617	2243622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9115	NC_008258	CTT	2	6	2243636	2243641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_008258	CTG	2	6	2243676	2243681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_008258	TAA	2	6	2243688	2243693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_008258	T	6	6	2245419	2245424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_008258	ATT	2	6	2245490	2245495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_008258	TGG	2	6	2245512	2245517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_008258	GAT	2	6	2245534	2245539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_008258	ATTA	2	8	2245548	2245555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_008258	TCA	2	6	2245559	2245564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_008258	TC	3	6	2245592	2245597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_008258	CGC	3	9	2245672	2245680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_008258	C	7	7	2245687	2245693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9127	NC_008258	CGC	2	6	2245713	2245718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9128	NC_008258	CCA	2	6	2245851	2245856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9130	NC_008258	ATC	2	6	2246865	2246870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9258	NC_008258	ATAAA	2	10	2295376	2295385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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