MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008258	TCC	2	6	1929671	1929676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_008258	GCT	2	6	1929774	1929779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_008258	TGC	2	6	1929815	1929820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_008258	GCTG	2	8	1929849	1929856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7505	NC_008258	T	8	8	1929870	1929877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_008258	CTGT	2	8	1929894	1929901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7507	NC_008258	CTG	2	6	1929913	1929918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_008258	CAG	2	6	1929928	1929933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_008258	GCT	2	6	1930020	1930025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_008258	CTG	2	6	1930077	1930082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_008258	GCA	3	9	1930091	1930099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_008258	CTG	3	9	1930120	1930128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_008258	GCA	2	6	1930137	1930142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_008258	TCA	2	6	1930157	1930162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_008258	CGC	2	6	1930225	1930230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7516	NC_008258	TCAT	2	8	1930307	1930314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7517	NC_008258	CTGC	2	8	1930374	1930381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7518	NC_008258	T	6	6	1930411	1930416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_008258	GCT	2	6	1930437	1930442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_008258	TG	3	6	1930457	1930462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_008258	T	6	6	1930483	1930488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_008258	CG	3	6	1930489	1930494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7523	NC_008258	T	6	6	1930500	1930505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_008258	CCA	2	6	1930579	1930584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_008258	TAC	2	6	1930605	1930610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_008258	ATT	2	6	1930624	1930629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_008258	A	6	6	1930751	1930756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_008258	ATC	2	6	1930795	1930800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_008258	CCA	2	6	1930878	1930883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7530	NC_008258	CAC	2	6	1930918	1930923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7531	NC_008258	CCT	2	6	1931059	1931064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_008258	ACCCAG	2	12	1931087	1931098	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_008258	CCG	2	6	1931101	1931106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_008258	CGC	2	6	1931125	1931130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_008258	TCA	2	6	1931134	1931139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_008258	CG	3	6	1931224	1931229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_008258	CTGA	2	8	1931234	1931241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_008258	CCG	2	6	1931258	1931263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7539	NC_008258	TG	3	6	1931292	1931297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_008258	GCA	2	6	1931337	1931342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_008258	GCC	2	6	1931361	1931366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_008258	AGA	2	6	1931384	1931389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_008258	CGC	2	6	1931435	1931440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7544	NC_008258	CTGC	2	8	1931464	1931471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7545	NC_008258	CTG	2	6	1931522	1931527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_008258	CTG	3	9	1931561	1931569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_008258	GGC	2	6	1931633	1931638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_008258	TTC	2	6	1931769	1931774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_008258	TGC	2	6	1931798	1931803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_008258	GAA	2	6	1931814	1931819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_008258	GCC	2	6	1931820	1931825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7552	NC_008258	GCC	2	6	1931841	1931846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7553	NC_008258	AGA	2	6	1931882	1931887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_008258	GCTG	2	8	1931900	1931907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7555	NC_008258	ATG	2	6	1932738	1932743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7557	NC_008258	A	6	6	1935282	1935287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_008258	CCG	2	6	1935295	1935300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7559	NC_008258	AGCC	2	8	1935334	1935341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7560	NC_008258	GTC	2	6	1935367	1935372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_008258	G	6	6	1935381	1935386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_008258	TGG	2	6	1935402	1935407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_008258	GTCAG	2	10	1935431	1935440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7564	NC_008258	C	7	7	1936747	1936753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7565	NC_008258	GAAA	2	8	1936772	1936779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_008258	A	6	6	1936777	1936782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_008258	TGA	2	6	1936800	1936805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7569	NC_008258	CACG	2	8	1936840	1936847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7571	NC_008258	A	6	6	1936877	1936882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_008258	T	6	6	1936977	1936982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_008258	TCC	3	9	1936989	1936997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7574	NC_008258	G	6	6	1937003	1937008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_008258	ATT	2	6	1937015	1937020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7579	NC_008258	A	6	6	1937140	1937145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_008258	GCCA	2	8	1937148	1937155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7588	NC_008258	CA	3	6	1937373	1937378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7589	NC_008258	AAC	2	6	1937398	1937403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7600	NC_008258	A	7	7	1937820	1937826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_008258	CGG	3	9	1937832	1937840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_008258	AT	3	6	1937897	1937902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_008258	GCT	2	6	1938561	1938566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7605	NC_008258	TTA	2	6	1939527	1939532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7612	NC_008258	GA	3	6	1944164	1944169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_008258	TTTA	2	8	1944203	1944210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_008258	TTGT	2	8	1944241	1944248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_008258	TC	3	6	1944510	1944515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7620	NC_008258	CCAA	2	8	1944530	1944537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7621	NC_008258	TG	3	6	1944672	1944677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7627	NC_008258	GA	3	6	1944925	1944930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_008258	TTC	2	6	1944999	1945004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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