MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008258	TAA	2	6	1810096	1810101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_008258	TTA	2	6	1810183	1810188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_008258	AAT	2	6	1812561	1812566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_008258	GCC	3	9	1812583	1812591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_008258	CTG	2	6	1812615	1812620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_008258	GGA	2	6	1812652	1812657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_008258	GTGA	2	8	1812691	1812698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_008258	GCA	2	6	1812743	1812748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_008258	CAA	2	6	1812801	1812806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_008258	CGG	2	6	1812810	1812815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_008258	GCC	2	6	1812829	1812834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_008258	ATC	2	6	1812847	1812852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_008258	GGT	2	6	1812931	1812936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008258	CGTAAA	2	12	1812961	1812972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7015	NC_008258	TG	3	6	1813018	1813023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_008258	CCG	2	6	1813040	1813045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_008258	GAA	2	6	1813076	1813081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008258	CG	3	6	1813085	1813090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_008258	CTG	2	6	1813101	1813106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_008258	A	6	6	1813161	1813166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_008258	A	6	6	1814585	1814590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_008258	AATC	2	8	1814608	1814615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7023	NC_008258	ACC	2	6	1815577	1815582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_008258	A	6	6	1815647	1815652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_008258	ACTT	2	8	1815767	1815774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_008258	ATGT	2	8	1815780	1815787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_008258	ATGG	2	8	1815815	1815822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_008258	TTAA	2	8	1815845	1815852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_008258	CGA	2	6	1815920	1815925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_008258	TAC	2	6	1815953	1815958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_008258	AAC	2	6	1816038	1816043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_008258	GAT	2	6	1816836	1816841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_008258	A	7	7	1816890	1816896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_008258	AAAT	2	8	1816907	1816914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_008258	GAC	2	6	1816932	1816937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7037	NC_008258	AGT	2	6	1816974	1816979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_008258	GCT	2	6	1816998	1817003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_008258	A	6	6	1817004	1817009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008258	ACT	2	6	1817015	1817020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_008258	A	6	6	1817046	1817051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_008258	AGA	2	6	1817066	1817071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008258	ATC	2	6	1817079	1817084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_008258	TGT	2	6	1820364	1820369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_008258	A	6	6	1820371	1820376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_008258	GCC	2	6	1820377	1820382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_008258	TGGC	2	8	1820383	1820390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7048	NC_008258	AC	3	6	1820669	1820674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7049	NC_008258	GAA	2	6	1820743	1820748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_008258	GAA	2	6	1820755	1820760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_008258	A	6	6	1820759	1820764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_008258	TAA	2	6	1822402	1822407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_008258	TTAT	2	8	1822493	1822500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_008258	TAA	2	6	1822527	1822532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008258	TTG	2	6	1822538	1822543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_008258	GA	3	6	1822548	1822553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_008258	T	8	8	1822571	1822578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_008258	GAA	2	6	1824051	1824056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_008258	CCT	2	6	1825154	1825159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_008258	TC	3	6	1826818	1826823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_008258	ACA	2	6	1826906	1826911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_008258	ATT	2	6	1826912	1826917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_008258	AG	3	6	1826946	1826951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_008258	ATT	2	6	1827023	1827028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_008258	CCGA	2	8	1827117	1827124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_008258	TTG	2	6	1827153	1827158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_008258	TCA	2	6	1828400	1828405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_008258	TCTG	2	8	1828414	1828421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7069	NC_008258	TAA	2	6	1828445	1828450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_008258	TTG	2	6	1828498	1828503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7072	NC_008258	A	6	6	1828884	1828889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_008258	AT	3	6	1828998	1829003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_008258	TAC	2	6	1829008	1829013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7078	NC_008258	TGC	2	6	1829314	1829319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7081	NC_008258	ATA	2	6	1829750	1829755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_008258	TTC	2	6	1829779	1829784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_008258	TACGT	2	10	1830449	1830458	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7088	NC_008258	TTAA	2	8	1833081	1833088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_008258	ATCA	2	8	1833090	1833097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7090	NC_008258	AG	3	6	1833100	1833105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_008258	TAACG	2	10	1833233	1833242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7092	NC_008258	CAT	2	6	1833273	1833278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_008258	CATG	2	8	1833293	1833300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_008258	TCTGC	2	10	1833740	1833749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7095	NC_008258	GTG	2	6	1833752	1833757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_008258	TCCT	2	8	1833789	1833796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7099	NC_008258	A	6	6	1835116	1835121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_008258	TTA	2	6	1835153	1835158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_008258	TGT	2	6	1838945	1838950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_008258	CTT	2	6	1838968	1838973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_008258	GCA	2	6	1839012	1839017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7105	NC_008258	AGT	2	6	1839089	1839094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7107	NC_008258	GTT	2	6	1839156	1839161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_008258	AGCA	2	8	1839229	1839236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7109	NC_008258	TCA	2	6	1840023	1840028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7114	NC_008258	CAG	2	6	1840315	1840320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7116	NC_008258	ATAG	2	8	1840362	1840369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_008258	CGG	2	6	1840408	1840413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7119	NC_008258	AAT	2	6	1840478	1840483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_008258	ATA	2	6	1840492	1840497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_008258	ACC	2	6	1840519	1840524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_008258	CAT	3	9	1840535	1840543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_008258	TCCT	2	8	1840606	1840613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7124	NC_008258	ACA	2	6	1840960	1840965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_008258	TTA	2	6	1841014	1841019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_008258	CAGA	2	8	1841043	1841050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7127	NC_008258	TGA	2	6	1841059	1841064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7129	NC_008258	TCAA	2	8	1841920	1841927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7131	NC_008258	TGA	2	6	1841948	1841953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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