MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008258	TCT	2	6	1675574	1675579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_008258	GAG	2	6	1675613	1675618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_008258	AT	3	6	1677226	1677231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_008258	A	6	6	1678418	1678423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_008258	ATGG	2	8	1679511	1679518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_008258	CCAT	2	8	1679530	1679537	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_008258	ATG	2	6	1680537	1680542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_008258	TAA	2	6	1680580	1680585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_008258	TGT	2	6	1680604	1680609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_008258	A	7	7	1680622	1680628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_008258	TAT	2	6	1680693	1680698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_008258	ATCA	2	8	1680732	1680739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_008258	AG	3	6	1680740	1680745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_008258	TTC	2	6	1680810	1680815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_008258	TGGCG	2	10	1680817	1680826	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6516	NC_008258	ACA	2	6	1680871	1680876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_008258	TGC	2	6	1680906	1680911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_008258	TAT	2	6	1680958	1680963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_008258	TGT	2	6	1680973	1680978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_008258	TTA	2	6	1681060	1681065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_008258	TAA	2	6	1681069	1681074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_008258	ATC	2	6	1681103	1681108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_008258	TAA	2	6	1681111	1681116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_008258	TACC	2	8	1681117	1681124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_008258	ATTA	2	8	1681133	1681140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_008258	TAA	2	6	1681402	1681407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_008258	TGT	2	6	1681915	1681920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_008258	ATA	2	6	1681941	1681946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_008258	GGC	2	6	1681947	1681952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_008258	T	6	6	1681953	1681958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_008258	CTTT	2	8	1688401	1688408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_008258	ATG	2	6	1688439	1688444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_008258	ATC	2	6	1688460	1688465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_008258	T	7	7	1688507	1688513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_008258	ATTC	2	8	1688530	1688537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6536	NC_008258	AC	3	6	1688607	1688612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_008258	CAA	2	6	1688614	1688619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_008258	CGC	2	6	1688704	1688709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_008258	CAT	2	6	1688715	1688720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_008258	A	6	6	1688739	1688744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_008258	T	6	6	1688757	1688762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_008258	ATT	2	6	1688830	1688835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_008258	T	6	6	1688914	1688919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_008258	A	7	7	1688960	1688966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_008258	T	8	8	1690525	1690532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_008258	TA	3	6	1693442	1693447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_008258	GCC	2	6	1694254	1694259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_008258	GA	3	6	1695891	1695896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_008258	T	6	6	1695923	1695928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_008258	CCT	2	6	1695973	1695978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_008258	A	6	6	1696012	1696017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_008258	CAC	2	6	1697175	1697180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_008258	GTA	2	6	1697234	1697239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_008258	AAT	2	6	1697258	1697263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_008258	CAT	2	6	1697264	1697269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_008258	TGTTT	2	10	1697273	1697282	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_008258	GCA	2	6	1698422	1698427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_008258	TGC	2	6	1698452	1698457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_008258	TTA	2	6	1698522	1698527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_008258	AT	3	6	1698538	1698543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_008258	CAT	2	6	1700052	1700057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_008258	GCCA	2	8	1700086	1700093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_008258	GC	3	6	1700113	1700118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_008258	GCG	2	6	1700147	1700152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_008258	CGG	2	6	1702256	1702261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_008258	GAG	2	6	1703200	1703205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_008258	T	6	6	1704171	1704176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_008258	GAC	2	6	1704184	1704189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_008258	GCG	2	6	1705312	1705317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_008258	GCC	2	6	1705322	1705327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_008258	ACA	2	6	1705339	1705344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_008258	GC	3	6	1705855	1705860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_008258	TGA	2	6	1706550	1706555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_008258	TCC	2	6	1711094	1711099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_008258	ACC	2	6	1712295	1712300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_008258	A	6	6	1712365	1712370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_008258	ATGC	2	8	1712410	1712417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_008258	ACTT	2	8	1712485	1712492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6579	NC_008258	ATGT	2	8	1712498	1712505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_008258	ATGG	2	8	1712533	1712540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_008258	TTAA	2	8	1712563	1712570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_008258	TCC	2	6	1712574	1712579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_008258	AAAC	2	8	1712604	1712611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_008258	CGA	2	6	1712642	1712647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_008258	TAC	2	6	1712675	1712680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_008258	AAC	2	6	1712760	1712765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_008258	CTT	2	6	1713255	1713260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_008258	TCA	2	6	1713316	1713321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_008258	TTG	2	6	1713352	1713357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_008258	TCT	2	6	1713375	1713380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_008258	CTG	2	6	1713427	1713432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_008258	T	7	7	1713435	1713441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_008258	T	6	6	1713462	1713467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_008258	TCT	3	9	1713491	1713499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_008258	ATC	2	6	1713510	1713515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_008258	TGT	2	6	1714410	1714415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_008258	TAA	3	9	1714506	1714514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_008258	GCA	2	6	1715124	1715129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_008258	A	7	7	1716493	1716499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_008258	AACA	2	8	1716540	1716547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6601	NC_008258	GTT	2	6	1716644	1716649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_008258	TCA	2	6	1716675	1716680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_008258	T	6	6	1716691	1716696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_008258	CA	3	6	1716702	1716707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_008258	AC	3	6	1716730	1716735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_008258	TGA	2	6	1716738	1716743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_008258	A	6	6	1716743	1716748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_008258	TGT	2	6	1716896	1716901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_008258	GT	3	6	1716909	1716914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_008258	CTGC	2	8	1718935	1718942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6611	NC_008258	TCA	2	6	1718960	1718965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_008258	GCG	2	6	1719008	1719013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_008258	GA	3	6	1719024	1719029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_008258	ATACTT	2	12	1720267	1720278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6615	NC_008258	GCT	2	6	1720281	1720286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_008258	TGT	2	6	1720297	1720302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_008258	GTT	2	6	1720336	1720341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_008258	ATGG	2	8	1720396	1720403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_008258	TCC	2	6	1720420	1720425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_008258	T	6	6	1720462	1720467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_008258	T	6	6	1722466	1722471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_008258	TAA	2	6	1722483	1722488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_008258	CTT	3	9	1722520	1722528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_008258	TGC	2	6	1722531	1722536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_008258	GGC	2	6	1722544	1722549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_008258	TC	3	6	1722557	1722562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_008258	TGC	2	6	1725273	1725278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_008258	TG	3	6	1725282	1725287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_008258	GGA	2	6	1725318	1725323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_008258	TGG	2	6	1725346	1725351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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