MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008258	GAT	2	6	1224426	1224431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_008258	TCA	2	6	1224436	1224441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_008258	GCG	2	6	1224485	1224490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_008258	TG	3	6	1224511	1224516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008258	TGA	2	6	1225999	1226004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_008258	ATCA	2	8	1226042	1226049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_008258	ACC	2	6	1226051	1226056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_008258	TTAT	2	8	1226066	1226073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_008258	GTGA	2	8	1226079	1226086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008258	AG	3	6	1226139	1226144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_008258	T	6	6	1226422	1226427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008258	ATCGTA	2	12	1226446	1226457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4513	NC_008258	GCT	2	6	1226485	1226490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_008258	TCAG	2	8	1226538	1226545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_008258	GCA	2	6	1227789	1227794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_008258	AGC	2	6	1227819	1227824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_008258	TATAA	2	10	1227894	1227903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_008258	T	6	6	1227964	1227969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_008258	G	6	6	1227973	1227978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008258	CAA	2	6	1228003	1228008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_008258	GCTG	2	8	1228025	1228032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_008258	CGG	2	6	1228400	1228405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_008258	GCC	2	6	1229131	1229136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_008258	GCG	2	6	1229142	1229147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008258	TTA	2	6	1229770	1229775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008258	A	6	6	1229799	1229804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008258	GA	3	6	1229850	1229855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_008258	T	7	7	1229938	1229944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_008258	GCT	2	6	1229949	1229954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008258	AAAG	2	8	1229961	1229968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008258	ATC	2	6	1229975	1229980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_008258	GTT	2	6	1230000	1230005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_008258	GGC	2	6	1230032	1230037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008258	GGT	2	6	1230044	1230049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008258	GGC	2	6	1230062	1230067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008258	GGT	2	6	1230107	1230112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_008258	TTC	2	6	1230141	1230146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_008258	GCA	2	6	1230180	1230185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_008258	CGA	2	6	1230220	1230225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_008258	CTTC	2	8	1230250	1230257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_008258	GCT	2	6	1230287	1230292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_008258	T	6	6	1230292	1230297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_008258	CAG	2	6	1230332	1230337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_008258	GTT	2	6	1230350	1230355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008258	CAG	2	6	1230374	1230379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008258	TTCA	2	8	1230392	1230399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_008258	TCT	2	6	1230446	1230451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_008258	TCA	2	6	1230460	1230465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_008258	ACACC	2	10	1230502	1230511	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4550	NC_008258	TAAG	2	8	1230560	1230567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_008258	TCA	2	6	1230643	1230648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_008258	TAT	2	6	1230683	1230688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008258	ACT	2	6	1230730	1230735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_008258	AT	3	6	1230786	1230791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008258	TAA	2	6	1230824	1230829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008258	CGGG	2	8	1230858	1230865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_008258	TTCTA	2	10	1230937	1230946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4558	NC_008258	T	7	7	1230947	1230953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_008258	CTG	2	6	1230975	1230980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_008258	CGT	2	6	1230987	1230992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008258	CAG	2	6	1231035	1231040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_008258	CTG	2	6	1231083	1231088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_008258	TA	3	6	1231106	1231111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008258	ATT	2	6	1231134	1231139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008258	A	6	6	1232841	1232846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008258	ATTC	2	8	1233447	1233454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_008258	CCA	2	6	1233461	1233466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_008258	GCA	2	6	1233471	1233476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_008258	GTT	2	6	1233542	1233547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_008258	CTTAC	2	10	1235101	1235110	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4571	NC_008258	ATG	2	6	1235120	1235125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_008258	CAGG	2	8	1235156	1235163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_008258	TCT	2	6	1235227	1235232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_008258	ATG	2	6	1235267	1235272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_008258	T	6	6	1236069	1236074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_008258	GTT	2	6	1236075	1236080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_008258	TTG	2	6	1237627	1237632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008258	CT	3	6	1237639	1237644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_008258	T	7	7	1237703	1237709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_008258	TTA	2	6	1237722	1237727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008258	CAG	2	6	1237785	1237790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_008258	A	6	6	1237849	1237854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_008258	AAT	2	6	1237866	1237871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_008258	ATT	3	9	1237903	1237911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_008258	TTG	2	6	1240324	1240329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_008258	TCT	2	6	1240351	1240356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_008258	A	6	6	1240364	1240369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_008258	CATC	2	8	1240371	1240378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_008258	GTT	2	6	1240398	1240403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_008258	CGC	2	6	1240475	1240480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_008258	ACGCTT	2	12	1240499	1240510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_008258	TTG	2	6	1240513	1240518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_008258	TTG	2	6	1240583	1240588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_008258	TGT	2	6	1240608	1240613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_008258	TCC	2	6	1240659	1240664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_008258	TCC	2	6	1240722	1240727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_008258	CTC	2	6	1240730	1240735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_008258	GCC	2	6	1241817	1241822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_008258	GGCG	2	8	1241825	1241832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_008258	AAAT	2	8	1241922	1241929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_008258	ACT	2	6	1242003	1242008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008258	TTA	2	6	1242129	1242134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_008258	TG	3	6	1242199	1242204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_008258	CAGG	2	8	1242254	1242261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4605	NC_008258	TTA	2	6	1242299	1242304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_008258	CTT	2	6	1242404	1242409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_008258	CAGGCT	2	12	1242458	1242469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_008258	GCATC	2	10	1242482	1242491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_008258	TGC	2	6	1242502	1242507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_008258	CGGT	2	8	1244252	1244259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_008258	TA	3	6	1244282	1244287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_008258	CTGA	2	8	1246720	1246727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_008258	T	6	6	1246786	1246791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_008258	TGT	2	6	1246795	1246800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_008258	CTT	2	6	1247250	1247255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_008258	CGG	2	6	1247370	1247375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_008258	CG	3	6	1247719	1247724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_008258	CTGA	2	8	1247929	1247936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4621	NC_008258	TTG	2	6	1247937	1247942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_008258	TGC	2	6	1247959	1247964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_008258	T	6	6	1247978	1247983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_008258	CGACAT	2	12	1248025	1248036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_008258	CAG	3	9	1248040	1248048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_008258	GCGA	2	8	1248066	1248073	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_008258	GCG	2	6	1248102	1248107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_008258	GCG	2	6	1248109	1248114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4630	NC_008258	AAT	2	6	1248223	1248228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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