MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 7053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008048	CGA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008048	GGC	2	6	75	80	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008048	GC	3	6	95	100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008048	GGC	2	6	114	119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008048	AG	3	6	130	135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008048	GTCC	2	8	1542	1549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008048	GC	3	6	1577	1582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008048	GCT	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008048	TCC	3	9	2359	2367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008048	CGC	2	6	2453	2458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008048	CGG	2	6	2463	2468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008048	TC	3	6	4969	4974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008048	GC	3	6	5290	5295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008048	GTT	2	6	5337	5342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008048	CTC	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008048	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008048	GCG	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008048	CCCGGC	2	12	6230	6241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008048	CGA	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008048	CAG	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008048	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008048	CG	3	6	7523	7528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008048	G	6	6	9213	9218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008048	G	6	6	9222	9227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008048	CTT	2	6	10033	10038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008048	TCC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008048	TC	4	8	11818	11825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008048	TC	3	6	12525	12530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008048	GC	3	6	13831	13836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008048	G	6	6	14304	14309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008048	GC	3	6	14328	14333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008048	CCG	2	6	15142	15147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008048	AAG	2	6	15156	15161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008048	CGC	2	6	17028	17033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008048	TGG	2	6	17060	17065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008048	GCG	2	6	17072	17077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008048	TTGT	2	8	20472	20479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008048	GC	3	6	20506	20511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008048	CG	3	6	20575	20580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008048	CGG	2	6	20597	20602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008048	CGG	2	6	20638	20643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008048	GCTT	2	8	20656	20663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008048	TCC	2	6	22110	22115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008048	ATC	2	6	22138	22143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008048	GTAG	2	8	24504	24511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008048	CCG	2	6	24521	24526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008048	CGC	2	6	24539	24544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008048	GCGCC	2	10	24560	24569	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008048	CGT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008048	CAG	2	6	24584	24589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008048	TGC	2	6	24601	24606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008048	GCG	2	6	24638	24643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008048	TCC	2	6	24653	24658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008048	CGC	2	6	24689	24694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008048	GGT	2	6	24700	24705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008048	G	6	6	24711	24716	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008048	CGC	2	6	24734	24739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008048	CCAAC	2	10	24755	24764	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_008048	CGC	2	6	28121	28126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008048	CGC	2	6	28189	28194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008048	GC	3	6	28193	28198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008048	GCG	2	6	30536	30541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008048	TGGT	2	8	30627	30634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008048	GCG	2	6	30668	30673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008048	ACGA	2	8	30749	30756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008048	CGC	2	6	30792	30797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008048	GC	3	6	31579	31584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008048	GCGCG	2	10	31665	31674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008048	GCG	2	6	31678	31683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008048	CGG	2	6	31710	31715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008048	GCG	2	6	31724	31729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008048	CCG	2	6	31730	31735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008048	CGC	3	9	31756	31764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008048	CCCG	2	8	31798	31805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_008048	T	6	6	31879	31884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008048	CGA	2	6	31959	31964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008048	TGC	2	6	32341	32346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008048	GAAA	2	8	32374	32381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008048	CTT	2	6	32409	32414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008048	TCA	2	6	32418	32423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008048	GAAA	2	8	32438	32445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008048	GACC	2	8	32791	32798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008048	GATC	2	8	32811	32818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008048	CG	3	6	32834	32839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008048	GC	4	8	32921	32928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008048	AAAG	2	8	32969	32976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008048	ATG	2	6	32983	32988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008048	AGGGG	2	10	36005	36014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008048	CTGTCC	2	12	36015	36026	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008048	GCC	2	6	36033	36038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008048	GGGAG	2	10	36080	36089	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008048	AG	3	6	36091	36096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008048	GC	3	6	38749	38754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008048	CCG	2	6	38802	38807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008048	TCA	2	6	40267	40272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008048	GC	3	6	40298	40303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008048	GCC	2	6	40368	40373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008048	GCC	2	6	40390	40395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008048	CGA	2	6	40431	40436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008048	TCG	2	6	40771	40776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008048	GCG	2	6	41395	41400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008048	GAG	2	6	42167	42172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008048	CGA	2	6	42178	42183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008048	GAC	2	6	42247	42252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008048	GGC	2	6	44371	44376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008048	TCG	2	6	44379	44384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008048	CCCG	2	8	44406	44413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_008048	CGC	2	6	46957	46962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008048	CAA	2	6	47535	47540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008048	CG	3	6	48639	48644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008048	GCC	2	6	48758	48763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008048	CCAG	2	8	48764	48771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008048	GTGG	2	8	48864	48871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008048	GCT	2	6	51018	51023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008048	GCC	2	6	51071	51076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008048	GTTC	2	8	51077	51084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008048	CAT	2	6	51123	51128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008048	TC	3	6	51136	51141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008048	CTT	2	6	55904	55909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008048	ATC	2	6	55928	55933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008048	CAA	2	6	58800	58805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008048	GAG	2	6	63586	63591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008048	TA	3	6	63611	63616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008048	CAT	2	6	63618	63623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008048	CG	3	6	63640	63645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008048	CTA	2	6	63649	63654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008048	CGC	2	6	63733	63738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008048	CG	3	6	63871	63876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008048	GCG	2	6	63906	63911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008048	CGG	2	6	63925	63930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008048	GAT	2	6	63957	63962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008048	TCG	2	6	64891	64896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008048	TTCG	2	8	64983	64990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008048	CTGA	2	8	65025	65032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008048	CCAT	2	8	65190	65197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008048	CCA	2	6	65199	65204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_008048	GCT	2	6	65239	65244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008048	CG	3	6	67808	67813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008048	AGC	2	6	67821	67826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008048	GCC	2	6	67837	67842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008048	CTG	2	6	67954	67959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008048	ACC	2	6	67985	67990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008048	GTC	2	6	67992	67997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008048	GCA	2	6	68012	68017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008048	CA	3	6	69172	69177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008048	AGG	2	6	70497	70502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008048	GGC	2	6	70523	70528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008048	TCG	2	6	70545	70550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008048	CGG	2	6	70551	70556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008048	ACG	2	6	71281	71286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008048	ATA	2	6	71316	71321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008048	TTA	2	6	71390	71395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_008048	TTCA	2	8	71418	71425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008048	CCGG	2	8	72245	72252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_008048	GCG	2	6	72820	72825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_008048	CGC	2	6	72847	72852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_008048	GCC	2	6	78132	78137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_008048	AAG	2	6	78192	78197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_008048	GAT	2	6	79415	79420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008048	AAG	2	6	79438	79443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_008048	AG	3	6	79589	79594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008048	TGCCG	2	10	79614	79623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_008048	CGC	2	6	79624	79629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_008048	C	6	6	79939	79944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
184	NC_008048	GCG	2	6	79992	79997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_008048	GGC	2	6	80044	80049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_008048	TGC	2	6	83114	83119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_008048	GA	3	6	83178	83183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_008048	TGAC	2	8	83769	83776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_008048	GC	3	6	83817	83822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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274	NC_008048	CGG	2	6	101874	101879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_008048	GGTGTT	2	12	104755	104766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_008048	CTT	2	6	106715	106720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_008048	GCG	2	6	106791	106796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_008048	ATC	2	6	107040	107045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_008048	TGAAG	2	10	107119	107128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008048	ATA	2	6	108552	108557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008048	GC	3	6	111947	111952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
294	NC_008048	GC	4	8	111971	111978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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420	NC_008048	GC	3	6	143547	143552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
421	NC_008048	AAG	2	6	144085	144090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008048	GC	3	6	145606	145611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
423	NC_008048	CCG	2	6	145634	145639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_008048	CGG	2	6	145644	145649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_008048	G	7	7	146153	146159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
426	NC_008048	CGTAC	2	10	147121	147130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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428	NC_008048	CCTGAT	2	12	147203	147214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_008048	CGC	2	6	147215	147220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_008048	CCG	2	6	147232	147237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_008048	CG	3	6	147289	147294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
432	NC_008048	AAG	2	6	147295	147300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008048	CGG	2	6	147323	147328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_008048	CCCG	2	8	147372	147379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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450	NC_008048	GC	3	6	163661	163666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
451	NC_008048	GC	3	6	163682	163687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_008048	AAGCGG	2	12	163714	163725	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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461	NC_008048	GC	3	6	165533	165538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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465	NC_008048	CCCT	2	8	166887	166894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
466	NC_008048	AGGGG	2	10	167480	167489	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
467	NC_008048	CGC	2	6	167498	167503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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478	NC_008048	GCGG	2	8	175891	175898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
479	NC_008048	CG	3	6	175915	175920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
480	NC_008048	GAAG	2	8	175944	175951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_008048	CGG	2	6	178283	178288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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