MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 7053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008048	CAG	2	6	3314282	3314287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_008048	GC	3	6	3314305	3314310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_008048	CG	5	10	3314340	3314349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_008048	CGC	2	6	3314360	3314365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_008048	CGG	2	6	3314374	3314379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_008048	TCG	2	6	3314433	3314438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_008048	AAT	2	6	3314449	3314454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_008048	GCA	2	6	3314458	3314463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_008048	CGC	2	6	3314537	3314542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_008048	GCG	2	6	3314559	3314564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_008048	CGG	2	6	3314565	3314570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_008048	CG	3	6	3314584	3314589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_008048	TGT	2	6	3314614	3314619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008048	C	6	6	3321114	3321119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7015	NC_008048	GCGCG	2	10	3321153	3321162	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7016	NC_008048	TCG	2	6	3321177	3321182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_008048	G	6	6	3321249	3321254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008048	CGC	2	6	3323224	3323229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_008048	TGC	2	6	3324842	3324847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_008048	GCTT	2	8	3324880	3324887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_008048	CGC	2	6	3326301	3326306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_008048	CTT	2	6	3326308	3326313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_008048	CG	3	6	3326318	3326323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_008048	GC	4	8	3326365	3326372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_008048	TCGG	2	8	3326418	3326425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_008048	A	6	6	3329078	3329083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_008048	CGG	2	6	3329112	3329117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_008048	GGC	2	6	3329153	3329158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_008048	GCGG	2	8	3329280	3329287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_008048	GGGC	2	8	3329291	3329298	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_008048	GGC	2	6	3329341	3329346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_008048	AGG	2	6	3330600	3330605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_008048	GC	3	6	3333014	3333019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_008048	CCG	2	6	3333021	3333026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_008048	CGC	2	6	3335590	3335595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_008048	GC	3	6	3335594	3335599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7037	NC_008048	TTCG	2	8	3335601	3335608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7038	NC_008048	GGC	2	6	3337551	3337556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_008048	GGC	2	6	3337573	3337578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_008048	CGA	2	6	3337596	3337601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_008048	GCC	2	6	3342623	3342628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_008048	CGC	2	6	3342640	3342645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_008048	GCAA	2	8	3343545	3343552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7044	NC_008048	CGC	2	6	3344401	3344406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_008048	GC	3	6	3344440	3344445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_008048	GCT	2	6	3344500	3344505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_008048	CG	4	8	3344507	3344514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_008048	GCT	2	6	3344520	3344525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_008048	T	6	6	3344900	3344905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_008048	A	6	6	3345024	3345029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_008048	GC	3	6	3345114	3345119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_008048	CGT	2	6	3345136	3345141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_008048	CGG	2	6	3345152	3345157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.