MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 5791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008023	CCTT	2	8	1113012	1113019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_008023	T	6	6	1113053	1113058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008023	TCT	2	6	1113390	1113395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_008023	TGC	2	6	1113405	1113410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_008023	CTGC	2	8	1113429	1113436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_008023	CATA	2	8	1113644	1113651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_008023	CTT	3	9	1113704	1113712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_008023	CCT	2	6	1117949	1117954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_008023	A	6	6	1117989	1117994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008023	GCC	2	6	1117995	1118000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_008023	TTTTC	2	10	1118018	1118027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3512	NC_008023	A	8	8	1118081	1118088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008023	C	6	6	1118095	1118100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3514	NC_008023	CAGA	2	8	1118104	1118111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_008023	TG	3	6	1118124	1118129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008023	TCC	2	6	1119854	1119859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_008023	TTTA	2	8	1119867	1119874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008023	GGC	2	6	1119889	1119894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_008023	CCT	2	6	1120308	1120313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_008023	TTC	2	6	1120331	1120336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_008023	TC	3	6	1120481	1120486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_008023	TA	3	6	1120516	1120521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008023	GAA	2	6	1120522	1120527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008023	GGGTA	2	10	1120529	1120538	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008023	A	6	6	1120559	1120564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008023	AATG	2	8	1120611	1120618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008023	AT	3	6	1120660	1120665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008023	A	6	6	1120669	1120674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008023	ACC	2	6	1120715	1120720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_008023	T	6	6	1120736	1120741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008023	A	6	6	1122218	1122223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008023	TCC	2	6	1122324	1122329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_008023	ATC	2	6	1123718	1123723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_008023	TAC	2	6	1123754	1123759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_008023	AAT	2	6	1123812	1123817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008023	ATT	2	6	1123822	1123827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008023	TAA	2	6	1123838	1123843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008023	AAG	2	6	1123858	1123863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_008023	A	6	6	1125743	1125748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008023	TTA	2	6	1125781	1125786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008023	T	6	6	1125789	1125794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008023	AGTCTT	2	12	1129541	1129552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3543	NC_008023	TATC	2	8	1129553	1129560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_008023	TTA	2	6	1129583	1129588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008023	TAT	2	6	1129631	1129636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008023	T	6	6	1130292	1130297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008023	TAAT	2	8	1130345	1130352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008023	TAT	2	6	1130365	1130370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008023	TAT	2	6	1130397	1130402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008023	TA	3	6	1130409	1130414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_008023	T	7	7	1130418	1130424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008023	A	6	6	1130425	1130430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008023	TAA	2	6	1130432	1130437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008023	TTTA	2	8	1130457	1130464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_008023	TAC	2	6	1130471	1130476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_008023	ATT	2	6	1130486	1130491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_008023	TAA	2	6	1130505	1130510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_008023	TTAG	2	8	1130513	1130520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008023	T	6	6	1130537	1130542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008023	CAA	2	6	1130568	1130573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_008023	A	6	6	1130615	1130620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008023	ATT	2	6	1131966	1131971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008023	ATC	2	6	1131988	1131993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_008023	TAA	2	6	1132011	1132016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008023	A	6	6	1132018	1132023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_008023	T	6	6	1132035	1132040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008023	T	6	6	1132053	1132058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008023	C	6	6	1133278	1133283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3569	NC_008023	TTC	2	6	1133295	1133300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_008023	AAG	2	6	1133328	1133333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008023	TTC	2	6	1133346	1133351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_008023	CAAGT	2	10	1133365	1133374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_008023	CTAG	2	8	1133423	1133430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_008023	TTG	2	6	1133509	1133514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_008023	CAA	2	6	1133591	1133596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008023	TAT	2	6	1133650	1133655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008023	TATT	2	8	1133701	1133708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008023	A	7	7	1133711	1133717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008023	CAA	2	6	1133751	1133756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_008023	CCT	2	6	1136189	1136194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_008023	TTTA	2	8	1136196	1136203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008023	ATCAC	2	10	1136217	1136226	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3585	NC_008023	GTT	2	6	1136263	1136268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008023	CAA	2	6	1136292	1136297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_008023	TGT	2	6	1136309	1136314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008023	TAG	2	6	1136315	1136320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008023	A	7	7	1136329	1136335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_008023	CTTTT	2	10	1136340	1136349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3591	NC_008023	ATCA	2	8	1137636	1137643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_008023	TAC	2	6	1138805	1138810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_008023	TGAT	2	8	1138813	1138820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008023	TTC	2	6	1138858	1138863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_008023	T	6	6	1138918	1138923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008023	CTA	2	6	1138934	1138939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_008023	A	7	7	1138980	1138986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008023	TAA	2	6	1139043	1139048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_008023	TCA	2	6	1140360	1140365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_008023	ATA	2	6	1140366	1140371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008023	TCA	2	6	1140432	1140437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_008023	ATT	2	6	1140443	1140448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008023	GCA	2	6	1140453	1140458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008023	TCT	2	6	1140474	1140479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008023	ATAA	2	8	1140613	1140620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008023	CTGC	2	8	1140646	1140653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_008023	CCA	2	6	1140682	1140687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_008023	TAT	2	6	1141240	1141245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008023	T	6	6	1141270	1141275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008023	TCAG	2	8	1141292	1141299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_008023	GTT	2	6	1141320	1141325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008023	ATT	2	6	1141344	1141349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_008023	AGG	2	6	1141367	1141372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008023	ATA	2	6	1142210	1142215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_008023	CAA	2	6	1142538	1142543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008023	AAT	2	6	1142560	1142565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008023	ACG	2	6	1142784	1142789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_008023	AAT	2	6	1142790	1142795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_008023	A	6	6	1144399	1144404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_008023	CTA	2	6	1144422	1144427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_008023	GAG	2	6	1145007	1145012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_008023	TCG	3	9	1145013	1145021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008023	CAT	2	6	1145031	1145036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_008023	A	6	6	1145810	1145815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_008023	A	7	7	1145820	1145826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_008023	AGTTA	2	10	1145836	1145845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008023	T	9	9	1145863	1145871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008023	ATT	2	6	1147394	1147399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008023	TAGC	2	8	1147442	1147449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3631	NC_008023	A	6	6	1147450	1147455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_008023	ACA	2	6	1149541	1149546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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