MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 5791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_008023	TAT	2	6	1796205	1796210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008023	AC	3	6	1796212	1796217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_008023	TAA	2	6	1796219	1796224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008023	TTTTCA	2	12	1796289	1796300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5506	NC_008023	TCT	2	6	1798889	1798894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_008023	ATCAC	2	10	1798916	1798925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5508	NC_008023	ATC	2	6	1798951	1798956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_008023	TAA	2	6	1798960	1798965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008023	TGA	2	6	1798970	1798975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008023	TCT	2	6	1798985	1798990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_008023	T	9	9	1799040	1799048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_008023	TTG	2	6	1799064	1799069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_008023	CTT	2	6	1799132	1799137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_008023	AT	3	6	1799644	1799649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008023	A	7	7	1799686	1799692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008023	TAT	2	6	1799696	1799701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008023	T	6	6	1799730	1799735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008023	ACA	2	6	1799813	1799818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_008023	TCCTC	2	10	1799865	1799874	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5521	NC_008023	ACAA	2	8	1799908	1799915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_008023	TAA	2	6	1801626	1801631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008023	T	6	6	1801667	1801672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008023	TAA	2	6	1801679	1801684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008023	TAT	2	6	1801980	1801985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008023	AAAATA	2	12	1802013	1802024	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5529	NC_008023	AATT	2	8	1806613	1806620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5533	NC_008023	AATC	2	8	1806756	1806763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_008023	AAAC	2	8	1806774	1806781	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5539	NC_008023	TAAAAA	2	12	1808272	1808283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008023	ACTTT	2	10	1808297	1808306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5550	NC_008023	TAC	2	6	1809994	1809999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5588	NC_008023	AATTTA	3	18	1819639	1819656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008023	A	7	7	1819663	1819669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_008023	TATC	2	8	1821209	1821216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_008023	TGA	2	6	1821220	1821225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5604	NC_008023	TGA	2	6	1821268	1821273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008023	AAG	2	6	1821277	1821282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_008023	A	6	6	1821334	1821339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008023	T	7	7	1821379	1821385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008023	CT	3	6	1821391	1821396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_008023	T	6	6	1821475	1821480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008023	ATTA	2	8	1821520	1821527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008023	T	6	6	1821608	1821613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008023	T	6	6	1821652	1821657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_008023	ATTTC	2	10	1825935	1825944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5620	NC_008023	TTTAG	2	10	1827893	1827902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008023	TTGA	2	8	1827983	1827990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008023	TCT	2	6	1828046	1828051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5624	NC_008023	CAT	2	6	1828094	1828099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5627	NC_008023	CAT	2	6	1828438	1828443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008023	CTAT	2	8	1828455	1828462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_008023	A	7	7	1828466	1828472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_008023	TCA	2	6	1828498	1828503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_008023	GCGAG	2	10	1828598	1828607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5632	NC_008023	TCA	2	6	1828619	1828624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5768	NC_008023	T	7	7	1856247	1856253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5769	NC_008023	A	8	8	1856254	1856261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5770	NC_008023	T	8	8	1856267	1856274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5771	NC_008023	GTCAA	2	10	1856287	1856296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5772	NC_008023	T	6	6	1857206	1857211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5773	NC_008023	T	6	6	1857256	1857261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5774	NC_008023	AAAT	2	8	1857264	1857271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5775	NC_008023	ATG	2	6	1857301	1857306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5776	NC_008023	CTG	2	6	1857376	1857381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5777	NC_008023	A	6	6	1857393	1857398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5778	NC_008023	T	8	8	1857414	1857421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5779	NC_008023	T	7	7	1857464	1857470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5780	NC_008023	TAT	2	6	1857497	1857502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5781	NC_008023	TAA	2	6	1857504	1857509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5782	NC_008023	AGTT	2	8	1857519	1857526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5783	NC_008023	ACT	2	6	1858088	1858093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5784	NC_008023	TTA	2	6	1858119	1858124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5785	NC_008023	AAAAG	2	10	1858128	1858137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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