MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 6045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008022	TAG	2	6	83560	83565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008022	GA	3	6	83673	83678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008022	CT	3	6	83788	83793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_008022	GAT	2	6	83806	83811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008022	AGG	2	6	83851	83856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008022	CGG	2	6	83897	83902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008022	GA	3	6	83995	84000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008022	TAGG	2	8	84113	84120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008022	GTT	2	6	84157	84162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008022	TAC	2	6	84167	84172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008022	CCT	2	6	84255	84260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_008022	TTGG	2	8	84296	84303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008022	AATC	2	8	84305	84312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_008022	GGT	2	6	84391	84396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008022	TCG	2	6	84506	84511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008022	CGT	2	6	84586	84591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008022	AGGGA	2	10	84724	84733	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008022	C	6	6	84762	84767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
519	NC_008022	GA	3	6	84810	84815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008022	AGTGTA	2	12	84837	84848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008022	ACTAAT	2	12	84865	84876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
522	NC_008022	CAG	2	6	85027	85032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008022	GCTTA	2	10	85090	85099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
524	NC_008022	AC	3	6	85103	85108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_008022	TGT	2	6	85231	85236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008022	GGT	2	6	85311	85316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008022	GGT	2	6	85346	85351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008022	ATTAT	2	10	85380	85389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008022	CGG	2	6	85430	85435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008022	TATAT	2	10	85463	85472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008022	GGA	2	6	85475	85480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008022	GCGT	2	8	85534	85541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_008022	TCC	2	6	85558	85563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008022	TCG	2	6	85598	85603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008022	GTT	2	6	85662	85667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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537	NC_008022	CGG	2	6	85785	85790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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539	NC_008022	CT	3	6	85830	85835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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542	NC_008022	T	6	6	86214	86219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008022	GTA	2	6	86244	86249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008022	ATG	2	6	86300	86305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008022	ACT	2	6	86366	86371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008022	T	6	6	86378	86383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008022	TGG	2	6	86438	86443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_008022	GAA	2	6	86697	86702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008022	GAT	2	6	86757	86762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008022	TGA	2	6	86768	86773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008022	GAA	2	6	86826	86831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008022	TGAT	2	8	86875	86882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008022	GTTC	2	8	86887	86894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_008022	AAAT	2	8	86914	86921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008022	TCA	2	6	86954	86959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008022	TAA	2	6	86970	86975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008022	T	6	6	86984	86989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008022	AAG	2	6	87025	87030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008022	ATG	2	6	87042	87047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008022	CAAT	2	8	87049	87056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_008022	GA	3	6	87057	87062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008022	ATG	2	6	87138	87143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008022	TG	3	6	87154	87159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008022	ATG	2	6	87241	87246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008022	T	6	6	87579	87584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008022	TGT	2	6	87876	87881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_008022	A	6	6	91697	91702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008022	GTC	2	6	94104	94109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008022	GAA	2	6	94138	94143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008022	CAG	2	6	94144	94149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008022	GCT	2	6	94178	94183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008022	AGA	2	6	94304	94309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_008022	TCA	2	6	97954	97959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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604	NC_008022	AT	3	6	112828	112833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008022	CAA	2	6	112852	112857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008022	ATAAAA	2	12	112879	112890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008022	A	7	7	112887	112893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_008022	TTG	2	6	112982	112987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008022	A	6	6	115610	115615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008022	TTAAG	2	10	115636	115645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008022	T	7	7	117371	117377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_008022	GA	3	6	117444	117449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008022	CTT	2	6	119205	119210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008022	TCG	2	6	119255	119260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008022	GAT	2	6	121934	121939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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622	NC_008022	AG	3	6	124868	124873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008022	CAG	2	6	126204	126209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008022	AG	4	8	126213	126220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008022	TTG	2	6	131448	131453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008022	ATA	2	6	131487	131492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008022	TGT	2	6	131512	131517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008022	GAT	2	6	131546	131551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008022	CTTT	2	8	132246	132253	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_008022	AT	3	6	132262	132267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008022	A	7	7	132274	132280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008022	ATT	2	6	132292	132297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008022	T	6	6	132296	132301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008022	T	6	6	132304	132309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008022	ATT	2	6	132316	132321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008022	ATT	2	6	132324	132329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008022	TTG	2	6	132347	132352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008022	A	7	7	132403	132409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008022	GTT	2	6	132415	132420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008022	ATA	2	6	132440	132445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_008022	TTA	2	6	132512	132517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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784	NC_008022	A	6	6	180355	180360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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967	NC_008022	A	7	7	232012	232018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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