MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 5563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008021	TAGG	2	8	83741	83748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008021	TAC	2	6	83795	83800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008021	CCT	2	6	83883	83888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008021	TTGG	2	8	83924	83931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008021	AATC	2	8	83933	83940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_008021	GGT	2	6	84019	84024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008021	TCG	2	6	84134	84139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008021	CGT	2	6	84214	84219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008021	AGGGA	2	10	84352	84361	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008021	C	6	6	84390	84395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
511	NC_008021	GA	3	6	84438	84443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008021	AGTGTA	2	12	84465	84476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008021	ACTAAT	2	12	84493	84504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_008021	CAG	2	6	84655	84660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008021	GCTTA	2	10	84718	84727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
516	NC_008021	AC	3	6	84731	84736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_008021	TGT	2	6	84859	84864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008021	GGT	2	6	84939	84944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008021	GGT	2	6	84974	84979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008021	ATTAT	2	10	85008	85017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008021	CGG	2	6	85058	85063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008021	TATAT	2	10	85091	85100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008021	GGA	2	6	85103	85108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008021	GCGT	2	8	85162	85169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_008021	TCC	2	6	85186	85191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_008021	TCG	2	6	85226	85231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008021	GTT	2	6	85290	85295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008021	CGG	2	6	85343	85348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008021	CGG	2	6	85413	85418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008021	TTCGGG	2	12	85435	85446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
531	NC_008021	CT	3	6	85458	85463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008021	GTG	2	6	85563	85568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008021	GCC	2	6	85803	85808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008021	T	6	6	85842	85847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008021	GTA	2	6	85872	85877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008021	ATG	2	6	85928	85933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008021	ACT	2	6	85994	85999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008021	T	6	6	86006	86011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008021	TGG	2	6	86066	86071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008021	TGG	2	6	86269	86274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008021	GAT	2	6	86385	86390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008021	TGA	2	6	86396	86401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008021	GAA	2	6	86454	86459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008021	TGAT	2	8	86503	86510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008021	GTTC	2	8	86515	86522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_008021	AAAT	2	8	86542	86549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008021	TAA	2	6	86598	86603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008021	T	6	6	86612	86617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008021	AAG	2	6	86653	86658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008021	ATG	2	6	86670	86675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008021	CAAT	2	8	86677	86684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_008021	GA	3	6	86685	86690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008021	ATG	2	6	86869	86874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008021	T	6	6	87207	87212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008021	TGT	2	6	87504	87509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008021	TTG	2	6	87516	87521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008021	CTT	2	6	87528	87533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008021	A	6	6	89995	90000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008021	A	6	6	91326	91331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008021	GTC	2	6	93733	93738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_008021	GAA	2	6	93767	93772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008021	CAG	2	6	93773	93778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008021	GCT	2	6	93807	93812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008021	AGA	2	6	93933	93938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008021	CAAT	2	8	97546	97553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_008021	TTA	2	6	97556	97561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008021	AAT	2	6	97562	97567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008021	TCA	2	6	97609	97614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008021	TTG	2	6	101299	101304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008021	TAA	2	6	101378	101383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008021	T	7	7	101832	101838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008021	AGG	2	6	101858	101863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008021	TTG	2	6	105492	105497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008021	AT	3	6	105521	105526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008021	T	6	6	106541	106546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008021	TAA	2	6	106551	106556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_008021	AG	3	6	106582	106587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008021	T	6	6	107842	107847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008021	GTTA	2	8	107861	107868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008021	TTG	2	6	108338	108343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008021	TAAG	2	8	110323	110330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008021	AGAAA	2	10	110343	110352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008021	TAA	3	9	110582	110590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008021	TTTAG	2	10	110612	110621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008021	GAA	2	6	111326	111331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008021	A	7	7	112004	112010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008021	T	6	6	112031	112036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008021	AAT	2	6	112090	112095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008021	AGG	2	6	112102	112107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008021	TCA	2	6	112525	112530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008021	AT	3	6	112551	112556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008021	CAA	2	6	112575	112580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008021	ATAAAA	2	12	112602	112613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008021	A	7	7	112610	112616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008021	TCA	2	6	112667	112672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008021	TAG	2	6	112679	112684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008021	T	6	6	112689	112694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008021	CTT	2	6	112704	112709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008021	TTG	2	6	112711	112716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008021	A	6	6	115339	115344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008021	TTAAG	2	10	115365	115374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008021	A	6	6	117067	117072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008021	A	7	7	117111	117117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008021	TCTT	2	8	117120	117127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_008021	AAT	2	6	119254	119259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008021	TAC	2	6	119320	119325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008021	CGT	2	6	119372	119377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008021	AATC	2	8	119403	119410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_008021	CTT	2	6	120318	120323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008021	AAT	2	6	120352	120357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008021	TGA	2	6	120378	120383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008021	TCA	2	6	120398	120403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008021	ATT	2	6	120444	120449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008021	T	6	6	120448	120453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008021	ATA	2	6	120461	120466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008021	A	7	7	120470	120476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008021	GAT	2	6	120477	120482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008021	AAC	2	6	120486	120491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008021	AAAT	2	8	120505	120512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008021	TAG	2	6	120517	120522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008021	CA	3	6	125788	125793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_008021	CTTG	2	8	125843	125850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_008021	TGAT	2	8	125901	125908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008021	C	6	6	127146	127151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
626	NC_008021	CT	4	8	127257	127264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_008021	CAT	2	6	127266	127271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008021	AGATAA	2	12	127305	127316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008021	AAAG	2	8	127342	127349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008021	A	6	6	127368	127373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008021	A	6	6	127378	127383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008021	AAAT	2	8	127390	127397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008021	GA	4	8	127505	127512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008021	TTA	2	6	131042	131047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008021	ATCG	2	8	131067	131074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_008021	AGT	2	6	131102	131107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008021	TTG	2	6	131150	131155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008021	ATA	2	6	131189	131194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008021	TGT	2	6	131216	131221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008021	TAT	2	6	131237	131242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008021	GAT	2	6	131249	131254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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941	NC_008021	ATA	2	6	217473	217478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_008021	TAA	2	6	221382	221387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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