MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 12393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007795	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007795	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007795	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007795	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007795	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007795	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007795	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007795	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007795	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007795	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007795	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007795	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007795	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007795	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007795	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007795	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007795	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007795	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007795	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007795	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007795	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007795	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007795	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007795	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007795	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007795	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007795	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007795	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007795	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007795	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007795	A	6	6	9670	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007795	CAC	2	6	10462	10467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007795	CCA	2	6	10482	10487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007795	TAA	2	6	10490	10495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007795	TCT	2	6	10524	10529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007795	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007795	TAT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007795	ATT	3	9	10666	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007795	ATT	2	6	10732	10737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007795	ACA	2	6	10748	10753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007795	ATA	2	6	10791	10796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007795	AAG	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007795	TAA	2	6	12477	12482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007795	AT	3	6	12505	12510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007795	AG	3	6	12524	12529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007795	AT	4	8	12558	12565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007795	CTAC	2	8	12570	12577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007795	T	7	7	12709	12715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007795	A	6	6	12723	12728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007795	ACGT	2	8	12734	12741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007795	ATA	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007795	ATT	2	6	12761	12766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007795	TA	3	6	14099	14104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007795	ATA	2	6	14141	14146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007795	GTG	2	6	14156	14161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007795	T	7	7	14178	14184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007795	ATA	2	6	14198	14203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007795	AAC	2	6	14220	14225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007795	CAA	2	6	14273	14278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007795	ATG	2	6	14291	14296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007795	AGGAA	2	10	14342	14351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007795	GTA	2	6	14379	14384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007795	GTAGG	2	10	14402	14411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007795	GAT	2	6	14419	14424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007795	TCA	3	9	14460	14468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007795	AAC	2	6	14500	14505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007795	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007795	A	6	6	14542	14547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007795	TAT	2	6	14670	14675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007795	T	6	6	14675	14680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007795	TA	3	6	14687	14692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007795	AGG	2	6	14708	14713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007795	AAC	2	6	15882	15887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007795	TCA	2	6	15909	15914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007795	CTT	2	6	16053	16058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007795	T	7	7	16080	16086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007795	AGG	2	6	16092	16097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007795	AT	4	8	17077	17084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007795	TAAATC	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007795	AAT	2	6	17201	17206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007795	CA	3	6	17224	17229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007795	TTA	2	6	17275	17280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007795	ATA	2	6	17344	17349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007795	AAT	2	6	22183	22188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007795	GAT	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007795	AT	3	6	22238	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007795	TA	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007795	AGG	2	6	23787	23792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007795	TGCT	2	8	23802	23809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007795	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007795	A	6	6	23835	23840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007795	AGA	2	6	23877	23882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007795	GAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007795	AAG	2	6	23926	23931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007795	ATT	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007795	ATA	2	6	24024	24029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007795	TTC	2	6	24069	24074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007795	A	6	6	24075	24080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007795	A	6	6	24098	24103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007795	ATCT	2	8	24136	24143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007795	CGG	2	6	24194	24199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007795	T	6	6	24232	24237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007795	GCCT	2	8	24264	24271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007795	T	7	7	24340	24346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007795	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007795	AT	3	6	24372	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007795	TTA	2	6	24489	24494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007795	TTC	2	6	24526	24531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007795	CCA	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007795	TCC	2	6	24550	24555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007795	AAT	2	6	24587	24592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007795	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007795	TAT	2	6	24648	24653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007795	TCA	2	6	24667	24672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007795	CCG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007795	TAA	2	6	24712	24717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007795	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007795	AT	3	6	24727	24732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007795	TA	3	6	24778	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007795	T	6	6	24852	24857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007795	A	6	6	24882	24887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007795	ATA	2	6	24895	24900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007795	ACT	2	6	27502	27507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007795	TAA	2	6	29597	29602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007795	TCA	2	6	29618	29623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007795	T	6	6	29645	29650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007795	TAT	2	6	29663	29668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007795	TAA	2	6	29785	29790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007795	ATA	2	6	29859	29864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007795	AG	3	6	29949	29954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007795	GAC	2	6	30814	30819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007795	T	6	6	30832	30837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007795	TGT	2	6	30839	30844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007795	TGG	2	6	30845	30850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007795	TGT	2	6	30859	30864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007795	TTGA	2	8	30879	30886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007795	AAT	2	6	30896	30901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007795	AAT	2	6	30924	30929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007795	ATCA	2	8	30939	30946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007795	ATA	2	6	30966	30971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007795	AT	3	6	33325	33330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007795	ATA	2	6	33336	33341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007795	T	7	7	33376	33382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007795	A	7	7	33386	33392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007795	TAA	2	6	33436	33441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007795	A	6	6	34175	34180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007795	GAG	2	6	34189	34194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007795	ATA	2	6	34195	34200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007795	TGG	2	6	34218	34223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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