MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 8728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007775	GCA	2	6	2236789	2236794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_007775	T	6	6	2236904	2236909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_007775	GCC	2	6	2236918	2236923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_007775	CGC	2	6	2236926	2236931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_007775	TGC	2	6	2236992	2236997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_007775	TTTG	2	8	2237044	2237051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_007775	ATA	2	6	2237069	2237074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_007775	CGT	2	6	2237182	2237187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_007775	GCC	2	6	2237194	2237199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_007775	CAA	2	6	2237201	2237206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_007775	TCA	2	6	2237221	2237226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_007775	CTC	2	6	2241090	2241095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_007775	C	7	7	2241097	2241103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6514	NC_007775	A	6	6	2241105	2241110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_007775	CCT	2	6	2241142	2241147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_007775	CTGG	2	8	2241167	2241174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6517	NC_007775	GGA	2	6	2241191	2241196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_007775	CAGG	2	8	2241208	2241215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_007775	CTG	2	6	2241436	2241441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_007775	CAA	2	6	2241465	2241470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_007775	CATC	2	8	2242599	2242606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_007775	T	6	6	2242617	2242622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_007775	CTT	2	6	2242694	2242699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_007775	GGTT	2	8	2242745	2242752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_007775	C	6	6	2242766	2242771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6526	NC_007775	CGC	2	6	2243798	2243803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_007775	G	6	6	2243852	2243857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_007775	GGCAC	2	10	2243976	2243985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6529	NC_007775	CGA	2	6	2244019	2244024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_007775	CAA	2	6	2244062	2244067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_007775	TTC	2	6	2244128	2244133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_007775	TTC	2	6	2244149	2244154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_007775	TGG	2	6	2245483	2245488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_007775	CGG	2	6	2245529	2245534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_007775	AG	3	6	2248080	2248085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_007775	C	6	6	2248116	2248121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6537	NC_007775	AAC	2	6	2248133	2248138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_007775	CCT	2	6	2248216	2248221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_007775	TGT	2	6	2248872	2248877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_007775	GAA	2	6	2251881	2251886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_007775	CGA	2	6	2252009	2252014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_007775	ACGA	2	8	2253070	2253077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_007775	AGA	2	6	2253082	2253087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_007775	GCT	2	6	2253095	2253100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_007775	GCTAA	2	10	2253105	2253114	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6546	NC_007775	CTT	3	9	2253127	2253135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_007775	TCG	2	6	2254855	2254860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_007775	GCG	2	6	2254898	2254903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_007775	TGC	2	6	2255559	2255564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_007775	TC	3	6	2255584	2255589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_007775	GA	3	6	2255595	2255600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_007775	AGC	2	6	2260484	2260489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_007775	ATT	2	6	2260509	2260514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_007775	AGG	2	6	2262469	2262474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_007775	GCC	2	6	2262513	2262518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_007775	AGC	2	6	2262599	2262604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_007775	CAGCC	2	10	2262669	2262678	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6558	NC_007775	G	6	6	2263444	2263449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_007775	GCAGGT	2	12	2264311	2264322	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6560	NC_007775	CAC	2	6	2267035	2267040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_007775	AAGGG	2	10	2268201	2268210	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_007775	CAC	2	6	2268235	2268240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_007775	AGG	2	6	2269078	2269083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_007775	CTG	2	6	2269108	2269113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_007775	GCT	2	6	2269120	2269125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_007775	GGGA	2	8	2269138	2269145	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_007775	CT	3	6	2272210	2272215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_007775	CGC	2	6	2272234	2272239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_007775	ACC	2	6	2272247	2272252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_007775	C	6	6	2272270	2272275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6571	NC_007775	GCC	2	6	2272329	2272334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_007775	T	6	6	2272366	2272371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_007775	T	7	7	2272400	2272406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_007775	A	6	6	2272427	2272432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_007775	GAT	2	6	2272490	2272495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_007775	CAG	2	6	2273577	2273582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_007775	TGCC	2	8	2274878	2274885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_007775	TGC	2	6	2276135	2276140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_007775	CCA	2	6	2276197	2276202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_007775	AAAG	2	8	2276206	2276213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_007775	GCC	2	6	2276264	2276269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_007775	GCAA	2	8	2276303	2276310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6583	NC_007775	AGGT	2	8	2276373	2276380	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_007775	AG	4	8	2276399	2276406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_007775	TTC	2	6	2276492	2276497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_007775	CTG	2	6	2276520	2276525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_007775	AGA	2	6	2277650	2277655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_007775	CTC	2	6	2277735	2277740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_007775	CTC	2	6	2277756	2277761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6590	NC_007775	TTCTCC	2	12	2277825	2277836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_007775	GAG	2	6	2277859	2277864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_007775	C	6	6	2279858	2279863	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6593	NC_007775	CTT	2	6	2281242	2281247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_007775	TGA	2	6	2281261	2281266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_007775	ATT	2	6	2281283	2281288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_007775	CTC	3	9	2282548	2282556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_007775	CTT	2	6	2282593	2282598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_007775	TC	3	6	2282979	2282984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_007775	GCC	2	6	2283069	2283074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_007775	TGGGC	2	10	2285283	2285292	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6601	NC_007775	TGC	2	6	2285753	2285758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_007775	TAGC	2	8	2285864	2285871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6603	NC_007775	GGC	2	6	2285902	2285907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_007775	GCTT	2	8	2285914	2285921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6605	NC_007775	T	7	7	2285926	2285932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_007775	GAG	2	6	2285969	2285974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_007775	GTT	2	6	2286488	2286493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_007775	GTC	2	6	2286501	2286506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_007775	GGA	2	6	2287891	2287896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_007775	TGTT	2	8	2289960	2289967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_007775	TC	3	6	2289968	2289973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_007775	AGGC	2	8	2290008	2290015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_007775	AAG	2	6	2290101	2290106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_007775	GAA	2	6	2290999	2291004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_007775	AG	3	6	2291055	2291060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_007775	C	7	7	2291069	2291075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6617	NC_007775	TAG	2	6	2291245	2291250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_007775	G	6	6	2291318	2291323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_007775	CTT	2	6	2291384	2291389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_007775	GGT	2	6	2291493	2291498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_007775	TGA	2	6	2291565	2291570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_007775	GAC	3	9	2291625	2291633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_007775	CCT	2	6	2291654	2291659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_007775	GAA	2	6	2293076	2293081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_007775	TCC	2	6	2293119	2293124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_007775	GCCA	2	8	2293691	2293698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_007775	TTC	2	6	2293725	2293730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_007775	TGT	2	6	2295924	2295929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_007775	AGG	2	6	2297086	2297091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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