MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 8728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007775	GGAG	2	8	2052829	2052836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_007775	G	6	6	2052838	2052843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_007775	TCAAA	2	10	2052850	2052859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6004	NC_007775	TGGA	2	8	2052889	2052896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007775	CTT	2	6	2052937	2052942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007775	CTG	2	6	2052943	2052948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_007775	GAA	2	6	2056155	2056160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_007775	GGC	2	6	2056163	2056168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_007775	AG	3	6	2056191	2056196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_007775	TC	3	6	2056234	2056239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_007775	AGAA	2	8	2056246	2056253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_007775	CTG	2	6	2056299	2056304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_007775	GCC	2	6	2056332	2056337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_007775	CTC	2	6	2056340	2056345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_007775	A	6	6	2056395	2056400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_007775	AGG	2	6	2056449	2056454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_007775	TAA	3	9	2056501	2056509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_007775	TC	4	8	2056549	2056556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_007775	CCT	2	6	2056571	2056576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_007775	GAG	3	9	2056607	2056615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_007775	TGCC	2	8	2056618	2056625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_007775	TCC	2	6	2056685	2056690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_007775	TGCC	2	8	2056710	2056717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_007775	CCG	2	6	2059500	2059505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_007775	C	6	6	2059575	2059580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6026	NC_007775	GCA	2	6	2059596	2059601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_007775	GGAG	2	8	2059629	2059636	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_007775	GCG	2	6	2060039	2060044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_007775	GAA	2	6	2060062	2060067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_007775	TTG	2	6	2060088	2060093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_007775	ACA	2	6	2060105	2060110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007775	GTC	2	6	2060208	2060213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_007775	ATG	2	6	2061958	2061963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_007775	CTGG	2	8	2061967	2061974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_007775	A	6	6	2061985	2061990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_007775	GCT	2	6	2062001	2062006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_007775	CTCAA	2	10	2062018	2062027	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6038	NC_007775	CAG	2	6	2062035	2062040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_007775	GCG	2	6	2062071	2062076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_007775	GA	3	6	2062092	2062097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_007775	TTC	2	6	2062157	2062162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_007775	A	6	6	2062781	2062786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_007775	TCT	2	6	2062792	2062797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_007775	CGG	2	6	2062831	2062836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_007775	GCCA	2	8	2063482	2063489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_007775	GCA	2	6	2063495	2063500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007775	CTT	2	6	2063674	2063679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_007775	AAAG	2	8	2063680	2063687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_007775	TCC	2	6	2063689	2063694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_007775	A	6	6	2063787	2063792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_007775	TC	3	6	2063859	2063864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_007775	A	7	7	2063892	2063898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_007775	GAA	2	6	2063925	2063930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_007775	CCT	2	6	2064031	2064036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_007775	GCAGA	2	10	2064039	2064048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6056	NC_007775	GAT	2	6	2064788	2064793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_007775	GCT	2	6	2064852	2064857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_007775	TGG	2	6	2066213	2066218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_007775	AGA	2	6	2066219	2066224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_007775	T	7	7	2066366	2066372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_007775	CAGGC	2	10	2066378	2066387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6062	NC_007775	GCT	2	6	2067842	2067847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_007775	TGT	2	6	2069637	2069642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_007775	AGA	2	6	2069652	2069657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_007775	GGC	2	6	2069684	2069689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6067	NC_007775	CTATC	2	10	2069759	2069768	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6068	NC_007775	CTT	2	6	2069769	2069774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_007775	CCG	2	6	2069797	2069802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_007775	AAT	2	6	2069845	2069850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_007775	CA	3	6	2071392	2071397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_007775	GGATTG	2	12	2071398	2071409	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_007775	C	6	6	2071424	2071429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6074	NC_007775	CCAG	2	8	2071485	2071492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_007775	CCT	2	6	2071784	2071789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_007775	GTC	2	6	2071800	2071805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6078	NC_007775	GCC	2	6	2075378	2075383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_007775	TAT	2	6	2075384	2075389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_007775	GAG	2	6	2075452	2075457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_007775	AAGCG	2	10	2078836	2078845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6088	NC_007775	CAA	2	6	2083910	2083915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_007775	CAA	2	6	2083918	2083923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_007775	GTC	2	6	2083937	2083942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_007775	GGTT	2	8	2085867	2085874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_007775	A	6	6	2086200	2086205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_007775	CTC	2	6	2086222	2086227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_007775	CGGC	2	8	2086275	2086282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_007775	CAA	2	6	2086297	2086302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_007775	GCA	2	6	2086407	2086412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_007775	G	6	6	2086416	2086421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_007775	AAC	2	6	2088312	2088317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_007775	CTT	2	6	2088424	2088429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_007775	CT	3	6	2088949	2088954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_007775	GCC	2	6	2089497	2089502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_007775	GCAGC	2	10	2089517	2089526	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_007775	AAGG	2	8	2089555	2089562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_007775	GAA	2	6	2089636	2089641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_007775	TCT	2	6	2091267	2091272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_007775	ACT	2	6	2092973	2092978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_007775	C	7	7	2092990	2092996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6113	NC_007775	GCA	2	6	2093027	2093032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_007775	GC	3	6	2093036	2093041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_007775	TTC	2	6	2093054	2093059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6118	NC_007775	TTG	2	6	2093138	2093143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_007775	CCCTG	2	10	2093161	2093170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6121	NC_007775	GAC	2	6	2095007	2095012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_007775	AGA	2	6	2095041	2095046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_007775	CCAG	2	8	2095047	2095054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_007775	G	6	6	2095133	2095138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_007775	T	6	6	2095149	2095154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_007775	CAG	2	6	2095209	2095214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6128	NC_007775	ATT	2	6	2095356	2095361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_007775	CTG	2	6	2095392	2095397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_007775	TATC	2	8	2095399	2095406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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