MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007607	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007607	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007607	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007607	TGAA	2	8	135	142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007607	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007607	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007607	GTAG	2	8	842	849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007607	AATT	2	8	854	861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007607	AAT	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007607	AAGA	2	8	896	903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007607	T	7	7	950	956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007607	AAG	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007607	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007607	AT	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007607	ATA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007607	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007607	TCA	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007607	AGC	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007607	T	7	7	1183	1189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007607	GA	3	6	1192	1197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007607	ATG	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007607	TCTA	2	8	1223	1230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007607	TAG	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007607	ATC	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007607	ATA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007607	CAT	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007607	ATT	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007607	TTA	2	6	2104	2109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007607	T	6	6	2126	2131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007607	T	6	6	2174	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007607	T	6	6	2193	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007607	ATC	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007607	AATT	2	8	2218	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007607	AAAT	2	8	2235	2242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007607	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007607	CAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007607	GCAGAA	2	12	3111	3122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007607	TTA	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007607	TGC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007607	GAT	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007607	CAC	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007607	AT	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007607	T	6	6	3359	3364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007607	A	8	8	3368	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007607	CATTG	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007607	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007607	ATT	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007607	TAAG	2	8	3518	3525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007607	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007607	TTG	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007607	AAATT	2	10	3598	3607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007607	TAAA	2	8	3615	3622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007607	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007607	TGA	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007607	T	7	7	3677	3683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007607	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007607	AT	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007607	T	19	19	3761	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007607	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007607	TAA	3	9	3965	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007607	AAGT	2	8	3978	3985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007607	GAA	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007607	TAT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007607	TCAG	2	8	4027	4034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007607	ATG	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007607	GCT	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007607	AGA	3	9	4240	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007607	AT	3	6	4266	4271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007607	T	6	6	4271	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007607	TTG	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007607	ATTCGG	2	12	4296	4307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007607	CATT	2	8	4378	4385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007607	CACTTA	2	12	4483	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007607	A	6	6	4612	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007607	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007607	ATT	2	6	5103	5108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007607	AT	3	6	5192	5197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007607	TG	3	6	5218	5223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007607	TAT	2	6	5224	5229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007607	TGT	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007607	CCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007607	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007607	TAT	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007607	AT	4	8	5343	5350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007607	GATA	2	8	5386	5393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007607	CAGAG	2	10	5405	5414	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007607	CAT	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007607	AAT	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007607	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007607	CAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007607	AG	3	6	5487	5492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007607	TCC	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007607	CCG	2	6	5937	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007607	TTG	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007607	AGGA	2	8	6765	6772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007607	CTGGT	2	10	6815	6824	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007607	GGA	3	9	6952	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007607	GAC	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007607	CTC	2	6	7013	7018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007607	CAA	2	6	7028	7033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007607	GCC	2	6	7040	7045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007607	ACC	2	6	7091	7096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007607	GAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007607	CGA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007607	GAA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007607	ATC	2	6	7258	7263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007607	GGT	2	6	7330	7335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007607	TTG	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007607	CCT	2	6	9192	9197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007607	AGG	2	6	9202	9207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007607	GAT	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007607	CAG	2	6	9442	9447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007607	GGT	2	6	10879	10884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007607	TCT	2	6	10895	10900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007607	AT	3	6	11644	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007607	ATTG	2	8	11658	11665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007607	ATC	2	6	11669	11674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007607	ATGTA	2	10	11696	11705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007607	ATGT	2	8	11710	11717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007607	ATGT	2	8	11719	11726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007607	ATGT	2	8	11728	11735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007607	ATGT	2	8	11737	11744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007607	ATGT	2	8	11746	11753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007607	ATGT	2	8	11755	11762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007607	ATGT	2	8	11764	11771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007607	ATGT	2	8	11773	11780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007607	ATGT	2	8	11782	11789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007607	TCT	2	6	11801	11806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007607	TGG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007607	TGC	2	6	12217	12222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007607	GAC	3	9	12248	12256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007607	CCA	2	6	12299	12304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007607	GTT	2	6	12314	12319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007607	GCT	2	6	12379	12384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007607	TGA	2	6	12574	12579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007607	ATC	2	6	12593	12598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007607	ACC	3	9	12618	12626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007607	CTG	2	6	12679	12684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007607	TTG	2	6	12708	12713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007607	AT	5	10	13351	13360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007607	GCA	2	6	13434	13439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007607	CATT	2	8	13469	13476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007607	ACT	2	6	13501	13506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007607	CTG	2	6	13510	13515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007607	TAACA	2	10	13532	13541	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007607	CCT	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_007607	CCA	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_007607	TCA	3	9	13772	13780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007607	CT	3	6	13841	13846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007607	AGC	2	6	13866	13871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007607	TTTG	2	8	13934	13941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007607	ATG	2	6	13950	13955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007607	A	6	6	14010	14015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007607	GAA	2	6	14021	14026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007607	ATC	2	6	14051	14056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007607	ATTG	2	8	14090	14097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007607	T	6	6	14118	14123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007607	CAC	2	6	14175	14180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_007607	CAT	2	6	14204	14209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007607	CAT	2	6	14967	14972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_007607	GAA	2	6	15038	15043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007607	CTGT	2	8	15093	15100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_007607	CTT	2	6	15179	15184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_007607	TACT	2	8	15213	15220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_007607	TGGTG	2	10	17355	17364	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007607	CT	3	6	17524	17529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_007607	TTGA	2	8	17550	17557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007607	ATGAA	2	10	17578	17587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_007607	TAT	2	6	17665	17670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007607	CAT	2	6	17710	17715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007607	CAC	2	6	17716	17721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_007607	CAAC	2	8	17728	17735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_007607	A	6	6	17739	17744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007607	TAG	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_007607	TTC	2	6	17787	17792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_007607	ATGA	2	8	17988	17995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_007607	TAA	2	6	18011	18016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_007607	CTG	2	6	18356	18361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_007607	ATC	2	6	18402	18407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_007607	A	6	6	18434	18439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_007607	GCA	2	6	18563	18568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_007607	ATT	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_007607	AT	3	6	18719	18724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007607	T	7	7	18793	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_007607	T	9	9	18848	18856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_007607	TC	3	6	19593	19598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_007607	TG	3	6	19606	19611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_007607	CAT	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_007607	GAC	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_007607	CCG	2	6	34704	34709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_007607	GTT	3	9	34731	34739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_007607	TTATGC	2	12	34790	34801	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_007607	AATA	2	8	36535	36542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007607	TGT	2	6	36629	36634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007607	ATTT	2	8	36636	36643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_007607	T	7	7	36666	36672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007607	AAT	2	6	36688	36693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007607	AGTA	2	8	36737	36744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007607	CAT	2	6	36756	36761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_007607	TAT	2	6	36786	36791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_007607	AAATTA	2	12	36800	36811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007607	A	7	7	36816	36822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007607	GAGG	2	8	36840	36847	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007607	TG	3	6	36884	36889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007607	GTA	2	6	37016	37021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_007607	GCA	2	6	67030	67035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_007607	TTG	2	6	67119	67124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_007607	CTG	2	6	67530	67535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_007607	ACA	3	9	74411	74419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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