MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007606	TA	3	6	3015978	3015983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_007606	CTTTTT	2	12	3016010	3016021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13003	NC_007606	AT	3	6	3016022	3016027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_007606	AT	3	6	3016823	3016828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_007606	AAT	2	6	3016832	3016837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_007606	AATGAT	2	12	3016845	3016856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_007606	CAT	2	6	3016935	3016940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_007606	GCG	2	6	3016956	3016961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_007606	AT	3	6	3017053	3017058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_007606	AGG	2	6	3017072	3017077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_007606	GCG	2	6	3017723	3017728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_007606	GCATC	2	10	3017766	3017775	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13013	NC_007606	CCG	2	6	3017792	3017797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_007606	GTT	2	6	3019359	3019364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_007606	CTT	2	6	3019367	3019372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_007606	ATT	2	6	3019531	3019536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_007606	GCA	2	6	3019558	3019563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_007606	AAC	2	6	3019601	3019606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_007606	GAG	2	6	3019835	3019840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_007606	CCG	2	6	3019923	3019928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_007606	CCG	2	6	3020064	3020069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_007606	AAC	2	6	3020088	3020093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_007606	TGC	2	6	3020149	3020154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_007606	CTT	2	6	3020182	3020187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_007606	GCG	2	6	3020216	3020221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_007606	CGC	2	6	3020247	3020252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_007606	CCA	2	6	3020274	3020279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_007606	GCG	2	6	3020280	3020285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_007606	GC	3	6	3020307	3020312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_007606	CTG	2	6	3020357	3020362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_007606	A	7	7	3020426	3020432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_007606	TGA	2	6	3020437	3020442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_007606	GCC	3	9	3020494	3020502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_007606	CCG	2	6	3020514	3020519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_007606	TGA	2	6	3020550	3020555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_007606	CGG	3	9	3020656	3020664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_007606	ACC	3	9	3020738	3020746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_007606	GGC	2	6	3020750	3020755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_007606	GCG	3	9	3020771	3020779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_007606	TTG	2	6	3020934	3020939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_007606	TGG	2	6	3020991	3020996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_007606	CACTGA	2	12	3021039	3021050	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_007606	GCG	2	6	3021080	3021085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_007606	GGC	2	6	3021097	3021102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_007606	GAA	2	6	3021119	3021124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_007606	GTA	2	6	3021127	3021132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_007606	ACG	2	6	3021150	3021155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_007606	TCC	2	6	3021509	3021514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_007606	TTTA	2	8	3021642	3021649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_007606	A	6	6	3021710	3021715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_007606	AC	3	6	3022715	3022720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_007606	TGC	2	6	3022748	3022753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_007606	TC	3	6	3022869	3022874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_007606	T	7	7	3022949	3022955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_007606	AGC	2	6	3023000	3023005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_007606	T	6	6	3023042	3023047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_007606	CGA	2	6	3023161	3023166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_007606	TGT	2	6	3023403	3023408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_007606	GT	3	6	3023407	3023412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_007606	CTAC	2	8	3023436	3023443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13061	NC_007606	TGG	2	6	3023462	3023467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_007606	CGG	2	6	3023469	3023474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_007606	AAC	2	6	3023505	3023510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_007606	GTG	2	6	3023585	3023590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_007606	CGC	2	6	3023602	3023607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_007606	GTC	2	6	3023615	3023620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_007606	GTG	2	6	3023657	3023662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_007606	CAG	2	6	3023665	3023670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_007606	GCTTT	2	10	3023712	3023721	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13070	NC_007606	GCA	2	6	3023737	3023742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_007606	CAG	2	6	3023748	3023753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_007606	TAC	2	6	3023892	3023897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_007606	ATC	2	6	3023922	3023927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_007606	TGA	2	6	3023976	3023981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_007606	AGC	2	6	3023982	3023987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_007606	ACA	2	6	3023988	3023993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_007606	TG	3	6	3024046	3024051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_007606	TTGT	2	8	3024063	3024070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_007606	CGA	2	6	3024134	3024139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_007606	ATC	3	9	3024210	3024218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_007606	CG	3	6	3024258	3024263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13082	NC_007606	GAA	2	6	3024312	3024317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_007606	ATT	2	6	3024342	3024347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_007606	CCA	2	6	3024349	3024354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13085	NC_007606	TGA	2	6	3024373	3024378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_007606	CAT	2	6	3024413	3024418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_007606	CGGG	2	8	3024451	3024458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_007606	TCT	2	6	3024478	3024483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_007606	CGG	2	6	3024578	3024583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_007606	CAA	2	6	3024602	3024607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_007606	TGA	2	6	3024764	3024769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_007606	GC	3	6	3024791	3024796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_007606	GCA	2	6	3024818	3024823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_007606	AAT	2	6	3025023	3025028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_007606	GCT	2	6	3025148	3025153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_007606	CTT	2	6	3025175	3025180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_007606	ATC	2	6	3025302	3025307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_007606	CCG	2	6	3025326	3025331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_007606	CAT	2	6	3025433	3025438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_007606	GCCA	2	8	3025497	3025504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_007606	T	6	6	3025980	3025985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_007606	TAAGTG	2	12	3026103	3026114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_007606	AATG	2	8	3026212	3026219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_007606	TAA	2	6	3026299	3026304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_007606	A	6	6	3026303	3026308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_007606	GAG	2	6	3026337	3026342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_007606	GAA	2	6	3026498	3026503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_007606	GAC	2	6	3026522	3026527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_007606	TCT	2	6	3026556	3026561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_007606	TGG	2	6	3026594	3026599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_007606	AT	3	6	3026600	3026605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_007606	ACG	2	6	3026731	3026736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_007606	GGT	2	6	3026766	3026771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_007606	ATG	2	6	3026815	3026820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_007606	TGG	2	6	3026874	3026879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_007606	CAT	2	6	3027000	3027005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_007606	AAAGC	2	10	3027010	3027019	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13118	NC_007606	ACG	2	6	3027049	3027054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_007606	ATG	2	6	3027075	3027080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_007606	GAT	2	6	3027257	3027262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_007606	TC	3	6	3027299	3027304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13122	NC_007606	ACC	2	6	3027354	3027359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_007606	CGG	3	9	3027392	3027400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_007606	TAA	2	6	3027495	3027500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_007606	GCG	2	6	3029885	3029890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_007606	AC	3	6	3029931	3029936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_007606	TAA	2	6	3029985	3029990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_007606	AAT	2	6	3029991	3029996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_007606	GTTGA	2	10	3030066	3030075	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_007606	GCT	2	6	3030088	3030093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_007606	C	6	6	3030130	3030135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13132	NC_007606	GA	3	6	3030137	3030142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_007606	AATT	2	8	3030147	3030154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13135	NC_007606	AG	3	6	3031724	3031729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_007606	CT	3	6	3031739	3031744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13137	NC_007606	GTCA	2	8	3031762	3031769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13141	NC_007606	T	6	6	3034597	3034602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13142	NC_007606	ATG	2	6	3036469	3036474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13144	NC_007606	CACTTA	2	12	3036715	3036726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13153	NC_007606	GTG	2	6	3037722	3037727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13155	NC_007606	CTCG	2	8	3037894	3037901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13156	NC_007606	TCC	2	6	3037928	3037933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13157	NC_007606	AAT	2	6	3038006	3038011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13158	NC_007606	TGAC	2	8	3039117	3039124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13159	NC_007606	TG	3	6	3039194	3039199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13160	NC_007606	T	6	6	3039253	3039258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13163	NC_007606	ATTA	2	8	3040379	3040386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13243	NC_007606	TTTA	2	8	3055597	3055604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_007606	TA	3	6	3055622	3055627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_007606	A	6	6	3055638	3055643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_007606	AAAG	2	8	3055690	3055697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_007606	T	6	6	3056153	3056158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_007606	TAAGTG	2	12	3056276	3056287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13250	NC_007606	AAAG	2	8	3056464	3056471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_007606	TTAA	2	8	3056518	3056525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_007606	A	6	6	3056561	3056566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_007606	CGT	2	6	3056592	3056597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_007606	TCG	2	6	3056632	3056637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13256	NC_007606	TCA	2	6	3057405	3057410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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