MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007606	ACA	2	6	2345446	2345451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_007606	ATG	2	6	2345467	2345472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_007606	ATAA	2	8	2345475	2345482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_007606	TGG	2	6	2345498	2345503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_007606	TGA	2	6	2345507	2345512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_007606	GATATT	2	12	2345550	2345561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_007606	A	6	6	2345604	2345609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_007606	CAT	2	6	2345621	2345626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_007606	TAG	2	6	2345638	2345643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_007606	AT	3	6	2345697	2345702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_007606	CA	3	6	2345737	2345742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_007606	A	6	6	2345823	2345828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_007606	CT	3	6	2345834	2345839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_007606	TAAAAA	2	12	2345852	2345863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_007606	TC	3	6	2345880	2345885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_007606	TAC	2	6	2345889	2345894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_007606	GTA	2	6	2345959	2345964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_007606	A	6	6	2345964	2345969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_007606	ATC	2	6	2346040	2346045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_007606	GA	3	6	2346077	2346082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_007606	GAT	2	6	2346138	2346143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_007606	A	6	6	2346220	2346225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_007606	TA	3	6	2346226	2346231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_007606	AAAAT	2	10	2346294	2346303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_007606	TGA	2	6	2346334	2346339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_007606	ATT	2	6	2346347	2346352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_007606	T	6	6	2346360	2346365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_007606	AAC	2	6	2346480	2346485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_007606	A	6	6	2346486	2346491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_007606	T	6	6	2346512	2346517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_007606	T	6	6	2347296	2347301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_007606	CCAT	2	8	2347319	2347326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_007606	CGC	2	6	2347432	2347437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_007606	A	6	6	2347525	2347530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_007606	AAGAG	2	10	2347562	2347571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_007606	CCT	2	6	2348613	2348618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_007606	GCA	2	6	2348706	2348711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_007606	TGA	2	6	2348777	2348782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_007606	GGGCG	2	10	2348795	2348804	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10040	NC_007606	CA	3	6	2348815	2348820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_007606	TGA	2	6	2348877	2348882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_007606	GAC	2	6	2348921	2348926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_007606	ATGA	2	8	2348987	2348994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_007606	ATT	2	6	2349012	2349017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_007606	TAT	3	9	2349038	2349046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_007606	ACA	2	6	2349075	2349080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_007606	CAT	2	6	2349841	2349846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_007606	GCA	2	6	2349866	2349871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_007606	T	6	6	2349921	2349926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_007606	GAA	2	6	2349933	2349938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_007606	GAA	2	6	2349981	2349986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_007606	AGC	2	6	2350036	2350041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_007606	TCG	2	6	2350085	2350090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_007606	AAT	2	6	2350185	2350190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_007606	GC	3	6	2350208	2350213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_007606	T	6	6	2350261	2350266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_007606	AAT	2	6	2350293	2350298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_007606	ACC	2	6	2350321	2350326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_007606	GTT	2	6	2350406	2350411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_007606	CAA	2	6	2350442	2350447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_007606	CATT	2	8	2350524	2350531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_007606	CACTTA	2	12	2350612	2350623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_007606	A	6	6	2350741	2350746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_007606	AATA	2	8	2351203	2351210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_007606	TCC	2	6	2351255	2351260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_007606	T	6	6	2351261	2351266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_007606	CCG	2	6	2351280	2351285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_007606	ATC	2	6	2351324	2351329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_007606	ACCA	2	8	2351354	2351361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_007606	A	6	6	2351386	2351391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_007606	ATAGC	2	10	2351414	2351423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10072	NC_007606	GC	4	8	2351438	2351445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_007606	T	6	6	2351478	2351483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_007606	A	6	6	2351530	2351535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_007606	CGGTC	2	10	2351605	2351614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10076	NC_007606	TTC	2	6	2351651	2351656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_007606	CAT	2	6	2351689	2351694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_007606	ACC	2	6	2351790	2351795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_007606	A	6	6	2351812	2351817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_007606	CCTG	2	8	2351886	2351893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_007606	A	6	6	2351899	2351904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_007606	TCG	2	6	2352042	2352047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_007606	TC	4	8	2352052	2352059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_007606	AACG	2	8	2352105	2352112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_007606	ACC	3	9	2352187	2352195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_007606	AT	3	6	2352254	2352259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_007606	TTC	3	9	2352297	2352305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_007606	GAC	2	6	2352315	2352320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_007606	CAG	2	6	2352533	2352538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_007606	GTC	2	6	2352548	2352553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_007606	A	7	7	2352557	2352563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_007606	ATC	2	6	2352721	2352726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_007606	CCGAC	2	10	2352728	2352737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10094	NC_007606	GC	3	6	2352792	2352797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_007606	GCC	2	6	2352816	2352821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_007606	CTA	2	6	2352843	2352848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_007606	T	7	7	2352882	2352888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_007606	GTTAAC	2	12	2352988	2352999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10099	NC_007606	GTTAAC	2	12	2353052	2353063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10100	NC_007606	GAT	2	6	2353088	2353093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_007606	ATA	2	6	2354533	2354538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_007606	CAATA	2	10	2355630	2355639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10103	NC_007606	A	6	6	2355639	2355644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_007606	AAT	2	6	2355649	2355654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_007606	AAGT	2	8	2355713	2355720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_007606	GAA	2	6	2355752	2355757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_007606	GCA	2	6	2357354	2357359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_007606	TGC	2	6	2357386	2357391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_007606	TC	3	6	2360156	2360161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_007606	TGAAT	2	10	2360183	2360192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_007606	TTC	2	6	2360207	2360212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_007606	A	8	8	2360281	2360288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_007606	ATC	2	6	2360379	2360384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_007606	AT	3	6	2360417	2360422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_007606	GAT	2	6	2360500	2360505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_007606	TAC	2	6	2360521	2360526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_007606	AAT	2	6	2360558	2360563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_007606	AAT	2	6	2360574	2360579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_007606	TGA	2	6	2360583	2360588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_007606	GCA	2	6	2360605	2360610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_007606	TCA	2	6	2360711	2360716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_007606	ATT	3	9	2360788	2360796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_007606	A	6	6	2360869	2360874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_007606	CATT	2	8	2360951	2360958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_007606	CACTTA	2	12	2361056	2361067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_007606	A	6	6	2361185	2361190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_007606	AAG	2	6	2361647	2361652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_007606	A	6	6	2361687	2361692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_007606	TC	4	8	2361713	2361720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10130	NC_007606	TTG	2	6	2361728	2361733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10142	NC_007606	GTT	2	6	2362165	2362170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_007606	CAA	3	9	2378618	2378626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_007606	GTT	2	6	2378652	2378657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10386	NC_007606	GTG	2	6	2394218	2394223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_007606	ATT	2	6	2398357	2398362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10497	NC_007606	CGG	3	9	2423708	2423716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10498	NC_007606	TGAAA	2	10	2425346	2425355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_007606	CGATA	2	10	2425398	2425407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10500	NC_007606	ATT	2	6	2425424	2425429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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