MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007606	TGA	2	6	162874	162879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007606	CTG	2	6	162887	162892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_007606	CAA	2	6	162926	162931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007606	CGT	2	6	162949	162954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007606	TGC	2	6	163053	163058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007606	AAC	2	6	163122	163127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007606	GTG	2	6	163235	163240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007606	ATC	2	6	163271	163276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007606	TGG	3	9	163290	163298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007606	GC	3	6	163399	163404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_007606	CTGC	2	8	163426	163433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
512	NC_007606	CGC	2	6	163462	163467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007606	GCTG	2	8	163560	163567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_007606	A	6	6	163659	163664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007606	CGA	3	9	163720	163728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_007606	GCT	2	6	163730	163735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007606	GCC	2	6	163751	163756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_007606	GCC	2	6	163768	163773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_007606	GGCGT	2	10	163796	163805	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
520	NC_007606	GCA	2	6	163828	163833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007606	CGG	2	6	163870	163875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007606	CGC	2	6	163899	163904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_007606	CGC	2	6	163937	163942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_007606	GCC	2	6	164013	164018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_007606	TTA	2	6	164039	164044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007606	TGA	2	6	164101	164106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007606	GCA	2	6	164134	164139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_007606	AGA	2	6	164245	164250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007606	CGG	2	6	164313	164318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007606	TGA	3	9	164389	164397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007606	TTG	2	6	164402	164407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007606	GCT	2	6	164425	164430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007606	GCA	2	6	164518	164523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_007606	CCCG	2	8	164602	164609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
535	NC_007606	CCA	2	6	164646	164651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_007606	CGA	2	6	164655	164660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007606	GAC	2	6	164813	164818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007606	CGACG	2	10	164835	164844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
539	NC_007606	GGTT	2	8	164864	164871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007606	TCTCCC	2	12	164873	164884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_007606	GC	3	6	164914	164919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007606	TCACCC	2	12	164924	164935	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_007606	GA	3	6	164982	164987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007606	TCT	3	9	164990	164998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_007606	AGA	2	6	165009	165014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007606	CCCA	2	8	167645	167652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
547	NC_007606	CTTT	2	8	167664	167671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_007606	GTT	2	6	167679	167684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007606	ATT	2	6	167746	167751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007606	GCT	2	6	175121	175126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_007606	GCT	2	6	175171	175176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007606	ATT	3	9	176764	176772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007606	TGT	2	6	177163	177168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007606	TCT	2	6	177197	177202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_007606	CT	3	6	177201	177206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_007606	GATT	2	8	179451	179458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007606	A	8	8	179463	179470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007606	TCG	2	6	179481	179486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007606	ATC	2	6	179557	179562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_007606	TCG	2	6	179577	179582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_007606	CAA	2	6	179587	179592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007606	GCC	2	6	179623	179628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_007606	CAG	2	6	179662	179667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_007606	TTG	2	6	179768	179773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007606	CCG	2	6	179806	179811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_007606	GCG	2	6	179830	179835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_007606	AGCC	2	8	179881	179888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_007606	CTGA	2	8	179890	179897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_007606	GGC	2	6	179913	179918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_007606	ACGGG	2	10	179928	179937	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
571	NC_007606	GAA	2	6	179938	179943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007606	GCG	2	6	179958	179963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_007606	GTG	2	6	180090	180095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007606	TTA	2	6	180144	180149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007606	GAA	2	6	180157	180162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007606	GCT	2	6	180238	180243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_007606	GAC	2	6	180244	180249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007606	TG	3	6	180259	180264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007606	AGC	2	6	180308	180313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007606	ATC	2	6	180317	180322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007606	GGT	2	6	180372	180377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007606	CATT	2	8	180512	180519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_007606	CACTTA	2	12	180617	180628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_007606	A	6	6	180746	180751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007606	T	6	6	181210	181215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007606	TAAA	2	8	181238	181245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007606	CTGC	2	8	181282	181289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_007606	ATT	2	6	181317	181322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007606	TCT	2	6	181347	181352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007606	TA	3	6	181358	181363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007606	AGC	2	6	181406	181411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007606	ATT	2	6	181443	181448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007606	TTA	2	6	181465	181470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007606	ATT	2	6	181637	181642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007606	GCC	2	6	181649	181654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_007606	TGC	2	6	181655	181660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_007606	GACC	2	8	181680	181687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_007606	GAA	2	6	181817	181822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_007606	CAC	2	6	183346	183351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_007606	TCA	2	6	183366	183371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_007606	TACGT	2	10	183397	183406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_007606	GGA	2	6	183434	183439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007606	TGGC	2	8	183444	183451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_007606	GGC	2	6	184615	184620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_007606	TGGCC	2	10	185118	185127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
606	NC_007606	TTC	2	6	185161	185166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007606	A	6	6	185193	185198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007606	GGAT	2	8	185229	185236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007606	GAA	2	6	185312	185317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007606	ATT	2	6	185330	185335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007606	CGT	2	6	185360	185365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_007606	A	6	6	188946	188951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007606	AT	4	8	189802	189809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007606	CAA	2	6	189929	189934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007606	GC	3	6	189968	189973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_007606	AAC	2	6	190034	190039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_007606	AC	4	8	190038	190045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_007606	TA	3	6	190118	190123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_007606	GGC	2	6	190904	190909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_007606	GAGC	2	8	190955	190962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_007606	GCG	2	6	190978	190983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_007606	GTA	2	6	191018	191023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007606	GCC	2	6	191984	191989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_007606	CTT	2	6	191999	192004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_007606	GAAA	2	8	192108	192115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007606	GATA	2	8	192850	192857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007606	TTG	2	6	192917	192922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007606	GC	3	6	192944	192949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_007606	AAATA	2	10	193010	193019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007606	TAA	2	6	193023	193028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007606	TG	4	8	193084	193091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007606	GTCTG	2	10	193095	193104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
633	NC_007606	CGC	2	6	193710	193715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_007606	GGC	2	6	193740	193745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_007606	AG	3	6	194995	195000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_007606	T	8	8	195102	195109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_007606	GGC	2	6	256626	256631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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