MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 5136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007604	GGC	2	6	1776179	1776184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007604	TCT	2	6	1778238	1778243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_007604	CGT	2	6	1778252	1778257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_007604	CT	3	6	1778266	1778271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_007604	AGT	2	6	1778314	1778319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_007604	GTAGC	2	10	1779918	1779927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_007604	CAG	2	6	1781242	1781247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_007604	CAA	2	6	1781248	1781253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_007604	TCAG	2	8	1783238	1783245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_007604	CAG	2	6	1783910	1783915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_007604	CG	3	6	1790358	1790363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_007604	CAA	2	6	1791907	1791912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_007604	TGT	2	6	1792560	1792565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007604	ATC	2	6	1792575	1792580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_007604	ATGA	2	8	1792661	1792668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_007604	CAA	3	9	1792710	1792718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_007604	TTG	2	6	1792813	1792818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_007604	CAGA	2	8	1792825	1792832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_007604	TGA	2	6	1792904	1792909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_007604	GGT	2	6	1792940	1792945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_007604	TTTA	2	8	1792965	1792972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_007604	AGG	2	6	1793016	1793021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_007604	GA	3	6	1793059	1793064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_007604	TGT	2	6	1793134	1793139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_007604	CG	3	6	1793181	1793186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_007604	TTC	2	6	1793196	1793201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_007604	CTG	2	6	1793976	1793981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007604	A	6	6	1794075	1794080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_007604	GTG	2	6	1795272	1795277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_007604	CCG	2	6	1795296	1795301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_007604	ACA	2	6	1795415	1795420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_007604	AGCG	2	8	1797057	1797064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_007604	TGC	2	6	1797461	1797466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_007604	T	6	6	1797475	1797480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_007604	TGC	2	6	1797587	1797592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_007604	GCGATC	2	12	1799096	1799107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_007604	AGC	2	6	1800256	1800261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_007604	AGC	2	6	1800344	1800349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_007604	CAG	2	6	1802674	1802679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007604	GCA	2	6	1804268	1804273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_007604	ACA	2	6	1804298	1804303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007604	TGT	2	6	1804308	1804313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_007604	TGT	2	6	1804346	1804351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_007604	CTT	2	6	1804386	1804391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_007604	CGTC	2	8	1804767	1804774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_007604	TGC	2	6	1804775	1804780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_007604	GA	4	8	1804787	1804794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_007604	CTT	2	6	1806249	1806254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_007604	CTT	2	6	1809685	1809690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_007604	TGT	2	6	1809695	1809700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_007604	GAG	2	6	1810157	1810162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_007604	ACAA	2	8	1812596	1812603	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_007604	GGA	2	6	1812651	1812656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_007604	CCA	2	6	1812685	1812690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_007604	GGC	3	9	1812693	1812701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_007604	TTAGC	2	10	1812702	1812711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_007604	TTC	2	6	1812713	1812718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_007604	T	6	6	1813890	1813895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_007604	AG	3	6	1813903	1813908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_007604	CGC	2	6	1814086	1814091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_007604	TTC	2	6	1815294	1815299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_007604	TTC	2	6	1815357	1815362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_007604	GCT	2	6	1815391	1815396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_007604	TAT	2	6	1816398	1816403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_007604	ATC	2	6	1816483	1816488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007604	CAG	2	6	1816552	1816557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3568	NC_007604	AGGGA	2	10	1817573	1817582	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_007604	TGAC	2	8	1817617	1817624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_007604	TAGG	2	8	1817625	1817632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_007604	CTT	2	6	1817648	1817653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_007604	GGC	2	6	1818975	1818980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3574	NC_007604	CAG	2	6	1820916	1820921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_007604	CATC	2	8	1820955	1820962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_007604	CCCT	2	8	1821008	1821015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3577	NC_007604	A	6	6	1821771	1821776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_007604	ATCC	2	8	1821806	1821813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_007604	C	6	6	1821854	1821859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3582	NC_007604	AGC	2	6	1824610	1824615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_007604	AGCC	2	8	1824940	1824947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_007604	GGTT	2	8	1824951	1824958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_007604	TGGC	2	8	1825014	1825021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_007604	GCA	3	9	1825109	1825117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_007604	CTCG	2	8	1825162	1825169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_007604	CAA	2	6	1826458	1826463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_007604	GGA	2	6	1827635	1827640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_007604	CAC	2	6	1827661	1827666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_007604	CCTTG	2	10	1827707	1827716	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3592	NC_007604	TGCC	2	8	1829531	1829538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_007604	TTG	2	6	1829566	1829571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007604	TGA	2	6	1832263	1832268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_007604	AGAC	2	8	1832840	1832847	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_007604	CGG	2	6	1832892	1832897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_007604	TAA	2	6	1834043	1834048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_007604	GCCA	2	8	1838680	1838687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_007604	GA	3	6	1838697	1838702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_007604	TCA	2	6	1838740	1838745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3602	NC_007604	TGCG	2	8	1839647	1839654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_007604	GCT	2	6	1840671	1840676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_007604	TCG	2	6	1840709	1840714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_007604	AGAA	2	8	1840720	1840727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_007604	ATC	2	6	1840736	1840741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_007604	AGA	2	6	1843886	1843891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_007604	GCT	2	6	1845751	1845756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_007604	AAC	2	6	1847390	1847395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_007604	AAAG	2	8	1847402	1847409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007604	ATCA	2	8	1847439	1847446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_007604	AAG	2	6	1847761	1847766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_007604	CGG	2	6	1849137	1849142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_007604	TGC	2	6	1849144	1849149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_007604	GGGC	2	8	1852204	1852211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_007604	TGAT	2	8	1852246	1852253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_007604	TTG	2	6	1852303	1852308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3620	NC_007604	AG	3	6	1852455	1852460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_007604	CA	3	6	1852505	1852510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_007604	GGC	2	6	1854730	1854735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_007604	CGC	2	6	1854783	1854788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_007604	CGAT	2	8	1854842	1854849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_007604	GGCC	2	8	1854875	1854882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_007604	TTG	2	6	1854968	1854973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_007604	ATT	2	6	1854976	1854981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_007604	C	6	6	1859935	1859940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3629	NC_007604	TCGGT	2	10	1859946	1859955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3631	NC_007604	CAG	2	6	1861815	1861820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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