MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 5136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007604	CTG	2	6	1548199	1548204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_007604	AGGGG	2	10	1548481	1548490	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_007604	GCT	2	6	1548541	1548546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_007604	A	6	6	1548559	1548564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_007604	ATTTG	2	10	1548589	1548598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_007604	CTAAG	2	10	1549157	1549166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_007604	GTAA	2	8	1553093	1553100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_007604	A	6	6	1553099	1553104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_007604	CTA	2	6	1553220	1553225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_007604	AGTA	2	8	1553226	1553233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_007604	AAGA	2	8	1553303	1553310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_007604	GAG	2	6	1553314	1553319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007604	AGC	2	6	1553320	1553325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007604	CT	3	6	1554753	1554758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_007604	GAC	2	6	1554789	1554794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_007604	AAG	2	6	1554813	1554818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_007604	CCT	2	6	1555980	1555985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_007604	CTGAG	2	10	1555997	1556006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3019	NC_007604	AGCG	3	12	1556066	1556077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_007604	GA	3	6	1556088	1556093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_007604	CT	3	6	1556560	1556565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_007604	AATC	2	8	1556632	1556639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_007604	AAC	2	6	1556738	1556743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_007604	ATAAA	2	10	1556748	1556757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_007604	TGTT	2	8	1556780	1556787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_007604	T	6	6	1556818	1556823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_007604	AGT	2	6	1556844	1556849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_007604	A	6	6	1556874	1556879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007604	T	6	6	1556962	1556967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_007604	CTGG	2	8	1557087	1557094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_007604	TAA	2	6	1557226	1557231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_007604	ACC	2	6	1557270	1557275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_007604	GCT	2	6	1558349	1558354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_007604	TCT	2	6	1558420	1558425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_007604	GTG	2	6	1558476	1558481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_007604	ACTGCT	2	12	1559298	1559309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_007604	TTG	2	6	1561257	1561262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007604	G	6	6	1561461	1561466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_007604	CCG	2	6	1561937	1561942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_007604	CCTC	2	8	1563441	1563448	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3041	NC_007604	GCA	2	6	1564742	1564747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_007604	CAG	2	6	1565383	1565388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_007604	AGC	2	6	1566295	1566300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_007604	AAG	2	6	1568321	1568326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_007604	CAGCC	2	10	1568363	1568372	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3046	NC_007604	TGC	2	6	1568398	1568403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_007604	GAT	2	6	1568407	1568412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_007604	TGGC	2	8	1568436	1568443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_007604	GA	3	6	1568536	1568541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_007604	CAC	2	6	1568592	1568597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_007604	CAG	2	6	1570949	1570954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_007604	CAG	2	6	1572290	1572295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_007604	GGC	2	6	1572387	1572392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_007604	CAG	2	6	1572417	1572422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_007604	ACA	2	6	1572463	1572468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_007604	CTCA	2	8	1572841	1572848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_007604	GAG	2	6	1573719	1573724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_007604	GCG	2	6	1577082	1577087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_007604	ATCG	2	8	1577088	1577095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_007604	GCAA	2	8	1577123	1577130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_007604	GCC	2	6	1579038	1579043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_007604	TTGTC	2	10	1579063	1579072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_007604	CGGTG	2	10	1583062	1583071	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_007604	GATC	2	8	1583274	1583281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_007604	CTTT	2	8	1583350	1583357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_007604	CT	3	6	1583359	1583364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_007604	ATT	2	6	1585245	1585250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_007604	T	7	7	1585266	1585272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_007604	TCTGGC	2	12	1586117	1586128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_007604	TGG	2	6	1586215	1586220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_007604	AGG	2	6	1589178	1589183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_007604	TAG	2	6	1590749	1590754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3074	NC_007604	GTT	2	6	1593120	1593125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_007604	ATTA	2	8	1593142	1593149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_007604	GCA	2	6	1593192	1593197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_007604	CGG	2	6	1596640	1596645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_007604	TAG	2	6	1596646	1596651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_007604	GGT	2	6	1597422	1597427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_007604	CT	3	6	1597435	1597440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_007604	AAG	2	6	1597825	1597830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_007604	TGTT	2	8	1599193	1599200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_007604	GGGTA	2	10	1599203	1599212	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_007604	TTG	2	6	1599251	1599256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_007604	TAA	2	6	1599259	1599264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_007604	CT	3	6	1599336	1599341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_007604	GAGT	2	8	1600388	1600395	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_007604	AAT	2	6	1600414	1600419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_007604	ACG	2	6	1600445	1600450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_007604	CTT	2	6	1600489	1600494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_007604	ATC	2	6	1603008	1603013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_007604	TAA	2	6	1603451	1603456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_007604	TGA	2	6	1603517	1603522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007604	TAG	2	6	1603540	1603545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_007604	ACT	2	6	1603550	1603555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_007604	AC	3	6	1603556	1603561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_007604	TGT	2	6	1603601	1603606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_007604	GCT	2	6	1603693	1603698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_007604	ATTG	2	8	1603779	1603786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_007604	GCTT	2	8	1603865	1603872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_007604	AG	3	6	1603879	1603884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_007604	TTG	2	6	1603899	1603904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_007604	GTCT	2	8	1603921	1603928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_007604	GAAC	2	8	1603964	1603971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_007604	CCT	2	6	1604078	1604083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_007604	GT	3	6	1604094	1604099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_007604	CTT	2	6	1604146	1604151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_007604	CTA	2	6	1604157	1604162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_007604	GAT	2	6	1604169	1604174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_007604	CA	3	6	1604283	1604288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_007604	TGA	2	6	1605639	1605644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_007604	AAAC	2	8	1605653	1605660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_007604	ATT	2	6	1605678	1605683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_007604	TGC	2	6	1605694	1605699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_007604	GT	3	6	1605702	1605707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_007604	AGA	2	6	1605852	1605857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_007604	AAT	2	6	1605862	1605867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_007604	ATC	2	6	1606014	1606019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_007604	CAT	2	6	1606070	1606075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_007604	ATC	2	6	1606700	1606705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_007604	GCC	2	6	1606726	1606731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_007604	AGC	2	6	1608011	1608016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_007604	ATCC	2	8	1608831	1608838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_007604	TC	3	6	1608877	1608882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_007604	A	6	6	1608907	1608912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_007604	A	6	6	1609050	1609055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_007604	CAG	2	6	1609108	1609113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_007604	CTG	2	6	1609169	1609174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_007604	TC	3	6	1609196	1609201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_007604	TTC	2	6	1609216	1609221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3245	NC_007604	TCTT	2	8	1638652	1638659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3249	NC_007604	TCAT	2	8	1640231	1640238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3250	NC_007604	CAT	2	6	1642051	1642056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_007604	CAG	2	6	1642093	1642098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_007604	TGAG	2	8	1642125	1642132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_007604	GAT	2	6	1642136	1642141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_007604	CAG	2	6	1643082	1643087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_007604	AGT	2	6	1643096	1643101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_007604	GA	3	6	1643125	1643130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3261	NC_007604	A	6	6	1643398	1643403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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