MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007516	GA	3	6	533620	533625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007516	CAG	2	6	534123	534128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_007516	CAG	2	6	534138	534143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007516	GC	3	6	534336	534341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_007516	TCT	2	6	534342	534347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007516	TTGC	2	8	534350	534357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_007516	GCT	2	6	534528	534533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007516	A	7	7	534564	534570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007516	CTA	2	6	534626	534631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_007516	TTGTC	2	10	534730	534739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_007516	AAC	2	6	534849	534854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_007516	GCA	2	6	534885	534890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007516	GAGG	3	12	534914	534925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007516	GAA	2	6	534941	534946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_007516	AC	3	6	535015	535020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_007516	GTC	2	6	535118	535123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_007516	GAA	2	6	535131	535136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_007516	T	6	6	535203	535208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007516	A	7	7	535215	535221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_007516	TGAC	2	8	535296	535303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_007516	GAT	2	6	535318	535323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007516	CCA	2	6	535374	535379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_007516	TCA	2	6	535385	535390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_007516	GCA	2	6	535410	535415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007516	GTAG	2	8	535434	535441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_007516	GA	3	6	535462	535467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007516	GCT	2	6	537823	537828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_007516	TTC	2	6	537853	537858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_007516	ATA	2	6	537990	537995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_007516	A	6	6	537998	538003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_007516	CT	3	6	538044	538049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_007516	TAAG	2	8	538062	538069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007516	AAGG	2	8	538076	538083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_007516	CAG	2	6	538094	538099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007516	GCA	2	6	538133	538138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_007516	ACA	2	6	538306	538311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_007516	ACA	2	6	538375	538380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_007516	A	7	7	538466	538472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007516	ACT	2	6	538487	538492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_007516	A	6	6	538513	538518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_007516	TTG	2	6	538576	538581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_007516	TCA	2	6	538584	538589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_007516	CA	3	6	538606	538611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_007516	AGA	2	6	538612	538617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_007516	CTT	2	6	539640	539645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_007516	G	6	6	539748	539753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_007516	CAG	2	6	540198	540203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_007516	TTC	2	6	540211	540216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_007516	GCG	2	6	540233	540238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_007516	CGCT	2	8	540366	540373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_007516	C	6	6	540385	540390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1052	NC_007516	CGAC	2	8	541054	541061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_007516	GCT	2	6	541082	541087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_007516	GCA	2	6	541090	541095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_007516	GTT	2	6	541151	541156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_007516	TCAA	2	8	542027	542034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_007516	CCA	2	6	542045	542050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_007516	TCA	2	6	542056	542061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_007516	GCA	2	6	542081	542086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_007516	GTAG	2	8	542105	542112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007516	CAGG	2	8	542147	542154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_007516	GCCA	2	8	542162	542169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_007516	GCA	2	6	542170	542175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007516	CAG	2	6	542215	542220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_007516	GCG	2	6	542238	542243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_007516	TCA	2	6	542289	542294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007516	AGC	2	6	542348	542353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_007516	ATC	2	6	542370	542375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_007516	TCAT	2	8	542389	542396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_007516	TTC	2	6	542483	542488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_007516	ATG	2	6	542522	542527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_007516	AGA	2	6	542591	542596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007516	CAA	2	6	542600	542605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_007516	CAG	2	6	542651	542656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_007516	CAA	2	6	542764	542769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_007516	CCA	2	6	542818	542823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_007516	ATG	2	6	542825	542830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_007516	A	7	7	542855	542861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_007516	TCAA	2	8	543307	543314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_007516	AGTAA	2	10	543332	543341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007516	ACCAAA	2	12	544216	544227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_007516	TAC	2	6	544926	544931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_007516	C	6	6	545038	545043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1084	NC_007516	TAA	2	6	545061	545066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_007516	TAA	2	6	545163	545168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_007516	TCG	2	6	545901	545906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_007516	TGGC	2	8	545975	545982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_007516	AAC	2	6	546000	546005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_007516	CCAC	2	8	546077	546084	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1090	NC_007516	GGT	2	6	546088	546093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_007516	TTG	2	6	546114	546119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_007516	GCA	2	6	546128	546133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_007516	CTG	2	6	546175	546180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_007516	AAT	2	6	546216	546221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_007516	AAGC	2	8	546224	546231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_007516	CGG	2	6	546237	546242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_007516	CAT	3	9	546379	546387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007516	GTTC	2	8	546394	546401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_007516	GGT	2	6	546415	546420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007516	GCT	2	6	546430	546435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_007516	TTTC	2	8	546450	546457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_007516	AG	3	6	546603	546608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007516	TCA	2	6	546624	546629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_007516	CGTT	2	8	546729	546736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_007516	ACA	2	6	549589	549594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_007516	T	6	6	549630	549635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007516	CTT	2	6	549687	549692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007516	CCT	2	6	549696	549701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_007516	GCT	2	6	549827	549832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007516	TGC	2	6	549879	549884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_007516	GC	3	6	549923	549928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_007516	ACC	2	6	549941	549946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_007516	TGCT	2	8	550010	550017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_007516	GCT	2	6	550026	550031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_007516	TC	3	6	551293	551298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_007516	CTG	3	9	551414	551422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_007516	CGAC	2	8	551462	551469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_007516	GCT	2	6	551532	551537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_007516	AGGC	2	8	551541	551548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_007516	GCC	2	6	551567	551572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_007516	TGA	2	6	551578	551583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_007516	ATT	2	6	552333	552338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_007516	ACG	2	6	556668	556673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_007516	CGA	2	6	556680	556685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_007516	CTG	2	6	559647	559652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_007516	GC	3	6	559671	559676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_007516	CGTT	2	8	559702	559709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_007516	CGC	2	6	559711	559716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_007516	GAA	2	6	562872	562877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_007516	G	7	7	562880	562886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_007516	GAG	2	6	563740	563745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_007516	GAA	2	6	564539	564544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_007516	TGA	2	6	564548	564553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_007516	CTG	2	6	570266	570271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_007516	CCAT	2	8	573429	573436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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