MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007516	TGGT	2	8	414372	414379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007516	T	7	7	414424	414430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007516	TC	3	6	415067	415072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_007516	A	6	6	418504	418509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007516	AGG	2	6	419171	419176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007516	GTT	3	9	420247	420255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007516	GAA	2	6	422532	422537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007516	AATT	2	8	422538	422545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007516	T	9	9	422567	422575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007516	GA	3	6	422904	422909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007516	CTG	2	6	423003	423008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007516	CCA	2	6	423038	423043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007516	CTT	2	6	423060	423065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007516	CGG	2	6	423079	423084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007516	G	6	6	424257	424262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007516	C	6	6	424273	424278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
517	NC_007516	T	7	7	424279	424285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007516	ATC	2	6	424311	424316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_007516	TCA	2	6	424347	424352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_007516	T	7	7	424361	424367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007516	CGG	2	6	424836	424841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007516	TTG	2	6	424860	424865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007516	TCTT	2	8	424893	424900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_007516	CTA	2	6	424936	424941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007516	AGA	2	6	424961	424966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007516	CTG	2	6	424999	425004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007516	TG	3	6	425090	425095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007516	T	6	6	425169	425174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007516	AGA	2	6	425185	425190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007516	TTC	2	6	426642	426647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_007516	TGT	2	6	427699	427704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007516	ATTG	2	8	427767	427774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007516	TTAG	2	8	427776	427783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007516	GCA	2	6	428726	428731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007516	CATT	2	8	428760	428767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_007516	GTG	2	6	429711	429716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007516	AAC	2	6	429758	429763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007516	GTT	2	6	429774	429779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007516	T	6	6	429963	429968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007516	A	6	6	430020	430025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007516	CA	3	6	430027	430032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007516	AGA	2	6	430548	430553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007516	AGG	2	6	431209	431214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007516	AC	3	6	431223	431228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_007516	GT	3	6	431256	431261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007516	CAAC	2	8	431265	431272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_007516	TCA	2	6	432514	432519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_007516	AGC	2	6	432568	432573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007516	TGA	2	6	432585	432590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007516	TCT	2	6	432614	432619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_007516	TGA	2	6	432652	432657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007516	TCT	2	6	432676	432681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007516	CTG	2	6	433367	433372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_007516	TGA	2	6	433417	433422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007516	GCT	3	9	433548	433556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007516	TCC	2	6	433575	433580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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558	NC_007516	GAA	2	6	433644	433649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_007516	CAA	2	6	435113	435118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_007516	CTGAG	2	10	435153	435162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
561	NC_007516	CAT	2	6	435190	435195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007516	CAT	2	6	435214	435219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_007516	TGA	2	6	435238	435243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007516	TGT	2	6	435259	435264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007516	TGG	2	6	435289	435294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007516	TTTTG	2	10	435323	435332	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007516	TGAG	2	8	436181	436188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_007516	GCA	2	6	436216	436221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007516	TCAA	2	8	438893	438900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_007516	CT	3	6	440511	440516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_007516	A	6	6	440522	440527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007516	GC	3	6	443191	443196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_007516	CT	3	6	443235	443240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_007516	GTG	2	6	443277	443282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007516	CAG	2	6	443285	443290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_007516	GC	3	6	443733	443738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_007516	GT	3	6	443837	443842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007516	G	6	6	443847	443852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_007516	AAG	2	6	444146	444151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_007516	TTA	2	6	444532	444537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_007516	GCG	2	6	446664	446669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007516	CGG	2	6	446691	446696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_007516	GGAT	2	8	446713	446720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007516	C	6	6	447219	447224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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619	NC_007516	CAA	2	6	449511	449516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_007516	CAAA	2	8	449521	449528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_007516	GTG	3	9	449531	449539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007516	A	6	6	449593	449598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_007516	TGA	2	6	449731	449736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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626	NC_007516	GGC	2	6	449763	449768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007516	GA	3	6	449800	449805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_007516	GAC	2	6	450131	450136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007516	GCAG	2	8	450143	450150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_007516	TGC	2	6	450174	450179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_007516	CTG	2	6	451026	451031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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634	NC_007516	CCA	2	6	451084	451089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_007516	GCT	2	6	451096	451101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_007516	G	6	6	451165	451170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_007516	CTC	2	6	451226	451231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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912	NC_007516	GCT	2	6	523440	523445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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922	NC_007516	TGT	2	6	524270	524275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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944	NC_007516	ACA	2	6	525415	525420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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947	NC_007516	GCT	2	6	525629	525634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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997	NC_007516	A	6	6	532921	532926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
998	NC_007516	GCC	2	6	532930	532935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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