MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007516	CGGC	2	8	1603205	1603212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_007516	A	6	6	1603329	1603334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_007516	ATA	2	6	1603418	1603423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_007516	CAC	2	6	1603838	1603843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_007516	GCA	2	6	1604133	1604138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_007516	T	7	7	1604509	1604515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_007516	ATA	2	6	1604549	1604554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_007516	GAG	2	6	1604629	1604634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_007516	AGA	2	6	1604657	1604662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_007516	TCT	2	6	1604701	1604706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_007516	AGA	2	6	1604756	1604761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_007516	GAGT	2	8	1604793	1604800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_007516	CACT	2	8	1604802	1604809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_007516	ATC	2	6	1605727	1605732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_007516	ACA	2	6	1605758	1605763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_007516	TGT	2	6	1605808	1605813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_007516	CCATG	2	10	1605822	1605831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4518	NC_007516	CA	3	6	1605975	1605980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_007516	TGA	2	6	1606028	1606033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_007516	CTG	2	6	1606078	1606083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_007516	TCA	2	6	1606393	1606398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_007516	CTCA	2	8	1606432	1606439	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_007516	CTT	2	6	1606493	1606498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_007516	GTC	2	6	1606538	1606543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_007516	TCAG	2	8	1606545	1606552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_007516	TTCG	2	8	1606720	1606727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_007516	TGA	2	6	1606764	1606769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_007516	CGA	2	6	1606874	1606879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_007516	CAA	2	6	1606880	1606885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_007516	GATG	2	8	1607021	1607028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_007516	ACT	2	6	1607100	1607105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_007516	AG	3	6	1607178	1607183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_007516	AG	3	6	1607192	1607197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_007516	CCA	2	6	1607600	1607605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_007516	ACC	2	6	1607609	1607614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_007516	GT	3	6	1607627	1607632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_007516	TC	3	6	1607649	1607654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_007516	AGAC	2	8	1607685	1607692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_007516	GTC	2	6	1607740	1607745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_007516	CAG	2	6	1607767	1607772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_007516	ACA	2	6	1607896	1607901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_007516	AGA	2	6	1607973	1607978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_007516	GCA	2	6	1607992	1607997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_007516	AGC	2	6	1608033	1608038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_007516	AAG	2	6	1608592	1608597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_007516	AATTC	2	10	1608607	1608616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4547	NC_007516	TCC	2	6	1608656	1608661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_007516	AGT	2	6	1608669	1608674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_007516	TGA	2	6	1608720	1608725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_007516	TCA	2	6	1608737	1608742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_007516	TGGT	2	8	1609201	1609208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_007516	AAT	2	6	1609223	1609228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_007516	GTT	2	6	1609256	1609261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_007516	TGCT	2	8	1609272	1609279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_007516	GTG	2	6	1609352	1609357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_007516	GCCT	2	8	1609394	1609401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_007516	TGA	2	6	1609410	1609415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_007516	CCT	2	6	1609660	1609665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_007516	GCA	2	6	1609737	1609742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_007516	AAGA	2	8	1609748	1609755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_007516	TGGGC	2	10	1609792	1609801	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4562	NC_007516	CTT	2	6	1609868	1609873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_007516	AGG	2	6	1609876	1609881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_007516	GTCA	2	8	1609883	1609890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_007516	TC	3	6	1610105	1610110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_007516	GAT	2	6	1610111	1610116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_007516	GTT	2	6	1610132	1610137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_007516	AGG	2	6	1610156	1610161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_007516	TCT	2	6	1610184	1610189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_007516	TTC	2	6	1610231	1610236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_007516	TGC	2	6	1610278	1610283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_007516	GCCT	2	8	1610291	1610298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_007516	CT	3	6	1612184	1612189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_007516	CAC	2	6	1612270	1612275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_007516	CAC	2	6	1612279	1612284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_007516	C	6	6	1612337	1612342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4577	NC_007516	TGTT	2	8	1612369	1612376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_007516	GCC	2	6	1612402	1612407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_007516	GTG	2	6	1612430	1612435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_007516	GA	3	6	1612451	1612456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_007516	AAC	2	6	1612484	1612489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_007516	GATC	2	8	1612491	1612498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_007516	CCA	2	6	1612572	1612577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_007516	GCC	2	6	1612805	1612810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_007516	GCT	2	6	1612848	1612853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_007516	ACA	2	6	1612889	1612894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_007516	AGCG	2	8	1612944	1612951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_007516	GGC	2	6	1613015	1613020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_007516	GTT	2	6	1613037	1613042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_007516	CAG	2	6	1613058	1613063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_007516	GCGT	2	8	1613111	1613118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_007516	GGA	2	6	1613127	1613132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_007516	GA	3	6	1613131	1613136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_007516	CCA	2	6	1613168	1613173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_007516	GCC	2	6	1613182	1613187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_007516	CGA	2	6	1613198	1613203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_007516	CCTT	2	8	1613250	1613257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_007516	AGG	2	6	1613270	1613275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_007516	TGT	2	6	1613320	1613325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_007516	CAC	2	6	1613342	1613347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_007516	GACG	2	8	1613376	1613383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_007516	AC	3	6	1613401	1613406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_007516	AGCCAA	3	18	1613440	1613457	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_007516	CAT	2	6	1613521	1613526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_007516	CGA	2	6	1613560	1613565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_007516	T	6	6	1613584	1613589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_007516	CTG	2	6	1613607	1613612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_007516	GCA	2	6	1614181	1614186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_007516	AAC	2	6	1616455	1616460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_007516	CGG	2	6	1616466	1616471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_007516	GAG	2	6	1616583	1616588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_007516	CG	3	6	1617358	1617363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_007516	TTC	2	6	1619001	1619006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_007516	AGAA	2	8	1619008	1619015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_007516	AGC	2	6	1619053	1619058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_007516	TCG	2	6	1620317	1620322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_007516	AAG	2	6	1620348	1620353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_007516	G	6	6	1620360	1620365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_007516	GGCA	2	8	1620367	1620374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_007516	CCG	2	6	1620378	1620383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_007516	CAG	2	6	1622187	1622192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_007516	TGA	2	6	1622264	1622269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_007516	C	7	7	1622281	1622287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4624	NC_007516	GTT	2	6	1622290	1622295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_007516	GCAAC	2	10	1622412	1622421	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4626	NC_007516	CTT	2	6	1623061	1623066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_007516	GCA	2	6	1623119	1623124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_007516	CTC	2	6	1623159	1623164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_007516	GTCT	2	8	1623200	1623207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_007516	AGC	2	6	1623214	1623219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_007516	CAG	2	6	1624805	1624810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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