MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007385	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007385	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007385	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007385	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007385	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007385	TAT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007385	GTAG	2	8	968	975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007385	AAT	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007385	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007385	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007385	AAG	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007385	ATG	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007385	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007385	TAG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007385	ATC	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007385	ATA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007385	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007385	CAT	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007385	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007385	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007385	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007385	T	6	6	2301	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007385	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007385	ATC	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007385	AATT	2	8	2345	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007385	AAAT	2	8	2362	2369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007385	AGG	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007385	CAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007385	GCAGAA	2	12	3250	3261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007385	TTA	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007385	TGC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007385	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007385	CAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007385	T	6	6	3584	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007385	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007385	TAG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007385	TAAG	2	8	4810	4817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007385	CAT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007385	TTG	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007385	AAATT	2	10	4890	4899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007385	TAAA	2	8	4907	4914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007385	T	6	6	4928	4933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007385	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007385	T	7	7	4969	4975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007385	TCC	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007385	T	7	7	5053	5059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007385	GAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007385	ATC	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007385	GGT	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007385	TTG	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007385	AGA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007385	CCT	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007385	AGG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007385	GAT	2	6	7324	7329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007385	GTG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007385	CAG	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007385	GGT	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007385	TCT	2	6	7626	7631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007385	AT	3	6	8375	8380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007385	ATTG	2	8	8389	8396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007385	ATC	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007385	ATGTA	2	10	8427	8436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007385	TCT	2	6	8451	8456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007385	TGG	2	6	8464	8469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007385	TGA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007385	ATC	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007385	ACC	3	9	9268	9276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007385	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007385	TTG	2	6	9358	9363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007385	AT	5	10	10001	10010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007385	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007385	CATT	2	8	10119	10126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007385	ACT	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007385	CTG	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007385	CCATT	2	10	10232	10241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007385	CCG	2	6	10247	10252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007385	TGA	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007385	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007385	CCA	2	6	10414	10419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007385	TCA	3	9	10422	10430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007385	CT	3	6	10491	10496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007385	AGC	2	6	10516	10521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007385	TAG	2	6	10544	10549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007385	ATC	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007385	ATTG	2	8	11895	11902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007385	T	6	6	11923	11928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007385	CAC	2	6	11980	11985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007385	CAT	2	6	12009	12014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007385	CTT	2	6	12707	12712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007385	GTCTG	2	10	12734	12743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007385	TCC	2	6	12746	12751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007385	AAT	2	6	12763	12768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007385	CAT	2	6	12772	12777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007385	GAT	2	6	13668	13673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007385	TTA	2	6	13749	13754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007385	AGC	2	6	13782	13787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007385	TGGTG	2	10	15433	15442	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007385	TTGA	2	8	15628	15635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007385	ATGAA	2	10	15656	15665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007385	TAT	2	6	15743	15748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007385	CAT	2	6	15788	15793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007385	CAC	2	6	15794	15799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007385	CAAC	2	8	15806	15813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007385	A	6	6	15817	15822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007385	TAG	2	6	15851	15856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007385	TTC	2	6	15865	15870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007385	ATT	2	6	15912	15917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007385	ACTA	2	8	15926	15933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007385	CTG	2	6	16434	16439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007385	ATC	2	6	16480	16485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007385	A	6	6	16512	16517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007385	GCA	2	6	16641	16646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007385	GCT	2	6	16693	16698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007385	TTA	2	6	16699	16704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007385	ATT	2	6	16775	16780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007385	AT	3	6	16797	16802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007385	T	7	7	16871	16877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007385	ATTAC	2	10	16901	16910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007385	T	8	8	16926	16933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007385	TC	3	6	17670	17675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007385	TG	3	6	17683	17688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007385	AAAC	2	8	17710	17717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007385	TAC	2	6	17737	17742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007385	ACGA	2	8	17764	17771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007385	A	6	6	17794	17799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007385	CAT	2	6	17899	17904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007385	GAC	2	6	18001	18006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007385	CAT	2	6	18518	18523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007385	ATGA	2	8	18525	18532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007385	T	6	6	18583	18588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007385	CT	3	6	18593	18598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007385	AG	3	6	18604	18609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007385	CAT	2	6	18636	18641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007385	AAT	2	6	18697	18702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007385	AAGT	2	8	19386	19393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007385	AT	3	6	19398	19403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007385	TTG	2	6	19408	19413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007385	TAACG	2	10	19588	19597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007385	AAC	2	6	19650	19655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007385	CGAGT	2	10	19690	19699	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007385	GA	3	6	19706	19711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007385	GCT	2	6	19725	19730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007385	GTA	2	6	19790	19795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007385	TCAG	2	8	19859	19866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007385	TGT	2	6	21118	21123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007385	TCC	2	6	21143	21148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_007385	A	6	6	21186	21191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007385	TCT	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007385	ATA	2	6	21247	21252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007385	A	6	6	21252	21257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007385	CGG	2	6	21646	21651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007385	GCA	2	6	21725	21730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_007385	TGG	2	6	22902	22907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007385	GTCAG	2	10	22931	22940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_007385	C	6	6	24249	24254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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163	NC_007385	CGG	2	6	25697	25702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_007385	CAGA	2	8	25839	25846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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173	NC_007385	TGG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_007385	TAA	2	6	26594	26599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_007385	T	8	8	28883	28890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_007385	TCT	2	6	31098	31103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_007385	TA	4	8	44650	44657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_007385	ATTA	2	8	44704	44711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_007385	AT	3	6	46201	46206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_007385	C	6	6	46355	46360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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284	NC_007385	AT	3	6	46470	46475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007385	GTG	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007385	GTCTG	2	10	48230	48239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_007385	AAT	2	6	48259	48264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_007385	TCA	2	6	48877	48882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007385	TCTG	2	8	48891	48898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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