MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007384	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007384	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007384	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007384	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007384	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007384	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007384	T	9	9	302	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007384	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007384	T	6	6	5071	5076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007384	GAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007384	AAC	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007384	CGT	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007384	AT	3	6	5613	5618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007384	CGC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007384	A	7	7	6496	6502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007384	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007384	GCC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007384	GTT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007384	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007384	ATC	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007384	CGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007384	TGCCGC	2	12	7108	7119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007384	TGC	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007384	ATG	2	6	7227	7232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007384	CCT	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007384	GTG	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007384	CGC	2	6	7981	7986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007384	GCC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007384	GCCA	2	8	8004	8011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007384	TTA	2	6	8061	8066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007384	CAG	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007384	AAT	2	6	8185	8190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007384	CG	3	6	8330	8335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007384	TCC	2	6	8352	8357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007384	CGG	2	6	8477	8482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007384	CG	3	6	8522	8527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007384	CAA	2	6	8656	8661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007384	TAA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007384	A	6	6	8722	8727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007384	GCAT	2	8	8732	8739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007384	AAG	2	6	8795	8800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007384	TA	3	6	8801	8806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007384	GGCG	2	8	8863	8870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007384	CGG	2	6	8927	8932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007384	CGT	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007384	ATC	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007384	CTGT	2	8	10016	10023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007384	C	6	6	10676	10681	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_007384	G	6	6	10686	10691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007384	ATC	3	9	11283	11291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007384	GAAT	2	8	11292	11299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007384	AAT	2	6	11305	11310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007384	AGT	2	6	11324	11329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007384	ATA	2	6	11346	11351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007384	GAAAAT	2	12	11389	11400	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007384	CTG	2	6	12613	12618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007384	AGA	2	6	12625	12630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007384	TCTTT	2	10	12644	12653	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007384	TTA	2	6	12654	12659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007384	T	6	6	12663	12668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007384	ATTC	2	8	12688	12695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007384	A	6	6	12768	12773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007384	TGA	2	6	12791	12796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007384	TAG	2	6	12816	12821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007384	AGTG	2	8	12830	12837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007384	A	7	7	12845	12851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007384	ATG	2	6	12907	12912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007384	AT	3	6	12918	12923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007384	A	6	6	14937	14942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007384	CCG	2	6	16166	16171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007384	CGC	2	6	16480	16485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007384	TAT	2	6	16486	16491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007384	CT	3	6	16496	16501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007384	CGCCT	2	10	16539	16548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_007384	T	6	6	16564	16569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007384	ATT	2	6	16579	16584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007384	ATT	2	6	16611	16616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007384	GAC	2	6	16617	16622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007384	ATT	2	6	16630	16635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007384	ATTA	2	8	16677	16684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007384	TAAT	2	8	16695	16702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007384	CCG	2	6	16950	16955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007384	TGT	2	6	17880	17885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007384	GTG	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007384	A	6	6	20473	20478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007384	GAT	2	6	20512	20517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007384	GA	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007384	TAA	2	6	23434	23439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007384	GAC	2	6	23446	23451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007384	A	6	6	23484	23489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007384	GTC	2	6	23508	23513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007384	T	6	6	23557	23562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007384	CGG	2	6	23563	23568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007384	TA	3	6	23600	23605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007384	GTT	2	6	23614	23619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007384	TAA	2	6	23684	23689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007384	ATG	2	6	24534	24539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007384	CCT	2	6	24584	24589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007384	GTG	2	6	24607	24612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007384	TAT	2	6	25668	25673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007384	ATT	2	6	25711	25716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007384	TAC	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007384	GTT	2	6	25837	25842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007384	ATT	2	6	25843	25848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007384	T	6	6	25865	25870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007384	TGA	2	6	25889	25894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007384	CTT	2	6	25927	25932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007384	AAG	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007384	CAT	2	6	25952	25957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007384	T	6	6	26000	26005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007384	TAA	2	6	26023	26028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007384	TCA	2	6	26029	26034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007384	CTTT	2	8	26061	26068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007384	A	6	6	27225	27230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007384	TC	3	6	27279	27284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007384	A	7	7	27299	27305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007384	TGA	2	6	27306	27311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007384	A	6	6	27347	27352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007384	TCA	2	6	27354	27359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007384	TATT	2	8	27424	27431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007384	CAT	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007384	CTA	2	6	27442	27447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007384	TGA	2	6	27513	27518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007384	TTAAT	2	10	27526	27535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007384	ACT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007384	TTG	2	6	27618	27623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007384	ATT	2	6	27627	27632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007384	TAA	2	6	27642	27647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007384	GT	3	6	27893	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007384	TC	3	6	27899	27904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007384	CAT	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007384	AGC	2	6	27917	27922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007384	A	8	8	27929	27936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007384	CTT	2	6	28308	28313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007384	GATGC	2	10	32880	32889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007384	TGC	2	6	32916	32921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007384	CGC	2	6	32949	32954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007384	AGC	2	6	34400	34405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007384	T	6	6	34442	34447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007384	TCAT	2	8	35399	35406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007384	TCCC	2	8	35429	35436	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_007384	TGGC	2	8	35470	35477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007384	ATTTA	2	10	36396	36405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007384	TCT	2	6	36495	36500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007384	TGT	2	6	36506	36511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007384	TCT	2	6	36571	36576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007384	TGC	2	6	36577	36582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_007384	CAC	2	6	42120	42125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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422	NC_007384	GTAAG	2	10	151736	151745	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_007384	AAT	2	6	156856	156861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007384	CGCCAT	2	12	156872	156883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
433	NC_007384	TAA	2	6	156898	156903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_007384	TGC	2	6	156957	156962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_007384	GA	3	6	157016	157021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_007384	TGC	2	6	159163	159168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_007384	TGC	2	6	159379	159384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_007384	GTG	2	6	159477	159482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_007384	CAG	2	6	160396	160401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_007384	GTT	2	6	160528	160533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_007384	TGC	2	6	160548	160553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_007384	CTC	2	6	160615	160620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_007384	AAG	2	6	160622	160627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_007384	GTTA	2	8	161831	161838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_007384	TAA	2	6	161870	161875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_007384	AAT	2	6	161907	161912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_007384	ACC	3	9	162008	162016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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476	NC_007384	TTG	2	6	162103	162108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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