MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_007384	CTGG	2	8	4580408	4580415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18002	NC_007384	CTG	2	6	4580471	4580476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_007384	TG	3	6	4580496	4580501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_007384	ATCA	2	8	4580534	4580541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18005	NC_007384	TGGA	2	8	4580664	4580671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_007384	TGA	2	6	4580692	4580697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_007384	CAG	2	6	4580711	4580716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_007384	CAT	2	6	4580719	4580724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_007384	TTTC	2	8	4580773	4580780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18010	NC_007384	ACC	2	6	4580825	4580830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18011	NC_007384	TCA	4	12	4580884	4580895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_007384	TGC	2	6	4580938	4580943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_007384	CAA	2	6	4580965	4580970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_007384	CTT	2	6	4581049	4581054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_007384	TG	3	6	4581055	4581060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_007384	CAG	2	6	4581074	4581079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_007384	CTAC	2	8	4581153	4581160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18018	NC_007384	AT	3	6	4581273	4581278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_007384	TTA	2	6	4581300	4581305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_007384	CAG	2	6	4581316	4581321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_007384	AAG	2	6	4581339	4581344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_007384	TTC	2	6	4581440	4581445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_007384	CGC	2	6	4581484	4581489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_007384	TAA	2	6	4581518	4581523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_007384	GTC	2	6	4581524	4581529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_007384	GC	3	6	4581571	4581576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18027	NC_007384	TTC	2	6	4581596	4581601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_007384	A	6	6	4581663	4581668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_007384	AGG	2	6	4581699	4581704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_007384	TAAT	2	8	4581723	4581730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_007384	AC	3	6	4581875	4581880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_007384	GCA	2	6	4581968	4581973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_007384	CAG	2	6	4581978	4581983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_007384	ACC	2	6	4582026	4582031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18035	NC_007384	TCA	2	6	4582040	4582045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_007384	TGA	2	6	4582049	4582054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_007384	ATC	2	6	4582057	4582062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_007384	CAGC	2	8	4582082	4582089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18039	NC_007384	TCCT	2	8	4582147	4582154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18040	NC_007384	ACA	2	6	4582501	4582506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_007384	TTA	2	6	4582555	4582560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_007384	CAGA	2	8	4582584	4582591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18043	NC_007384	TGA	2	6	4582600	4582605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_007384	CAGC	2	8	4584788	4584795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_007384	T	6	6	4584804	4584809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_007384	CGT	2	6	4584857	4584862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_007384	CCTG	2	8	4584877	4584884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18048	NC_007384	CAT	2	6	4584894	4584899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_007384	GCG	2	6	4584950	4584955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_007384	GCC	2	6	4585009	4585014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18051	NC_007384	AGA	2	6	4585020	4585025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_007384	ATAC	2	8	4585029	4585036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18053	NC_007384	TACT	2	8	4585139	4585146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18054	NC_007384	GCCA	2	8	4585268	4585275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18055	NC_007384	TCA	2	6	4585286	4585291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_007384	CCG	2	6	4585348	4585353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18057	NC_007384	CCG	2	6	4585403	4585408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18058	NC_007384	GAA	2	6	4585431	4585436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_007384	AGATA	2	10	4585444	4585453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_007384	TAA	2	6	4585498	4585503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_007384	TTG	2	6	4585566	4585571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_007384	T	6	6	4585576	4585581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_007384	ATAC	2	8	4585598	4585605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18064	NC_007384	AAT	2	6	4585623	4585628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_007384	ACC	2	6	4585656	4585661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18066	NC_007384	TAA	2	6	4585683	4585688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_007384	CAT	2	6	4585704	4585709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_007384	CAA	2	6	4585718	4585723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_007384	TCT	2	6	4585748	4585753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_007384	ATG	2	6	4585808	4585813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_007384	GACCA	2	10	4585828	4585837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18072	NC_007384	A	6	6	4585861	4585866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_007384	T	6	6	4585927	4585932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_007384	TAA	2	6	4586025	4586030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_007384	AAAT	2	8	4586043	4586050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_007384	CAA	3	9	4586090	4586098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18077	NC_007384	ACA	2	6	4586165	4586170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_007384	GCT	2	6	4586261	4586266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18079	NC_007384	TTCAT	2	10	4586282	4586291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18080	NC_007384	AT	3	6	4586410	4586415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_007384	GTT	2	6	4586425	4586430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_007384	TGT	2	6	4586451	4586456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_007384	TGC	2	6	4586473	4586478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_007384	GAT	2	6	4586564	4586569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_007384	TAA	2	6	4586584	4586589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_007384	AAT	2	6	4586631	4586636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_007384	TAA	2	6	4586659	4586664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_007384	CAC	2	6	4586667	4586672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18089	NC_007384	GGTT	2	8	4586720	4586727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_007384	TGA	2	6	4586787	4586792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_007384	CTA	2	6	4586832	4586837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_007384	TTG	2	6	4586857	4586862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_007384	TCA	2	6	4586924	4586929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_007384	TGT	2	6	4586931	4586936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_007384	CCA	2	6	4586988	4586993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18096	NC_007384	AG	3	6	4587016	4587021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_007384	TTTA	2	8	4587052	4587059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_007384	ACA	2	6	4587168	4587173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_007384	A	7	7	4587176	4587182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_007384	GGGA	2	8	4587266	4587273	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_007384	ATT	2	6	4587322	4587327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_007384	CTT	2	6	4587338	4587343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_007384	CATT	2	8	4587366	4587373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18106	NC_007384	GTT	2	6	4587659	4587664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18107	NC_007384	ATA	2	6	4587667	4587672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_007384	TTTA	2	8	4587742	4587749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18110	NC_007384	TCA	2	6	4587864	4587869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_007384	AAT	2	6	4587896	4587901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_007384	TCA	2	6	4588003	4588008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18113	NC_007384	TGA	2	6	4588055	4588060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_007384	CAA	2	6	4588075	4588080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_007384	GTCA	2	8	4588107	4588114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18116	NC_007384	CTT	2	6	4588448	4588453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18117	NC_007384	AG	4	8	4591121	4591128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_007384	ACGG	2	8	4591140	4591147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18119	NC_007384	CGG	2	6	4591163	4591168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18120	NC_007384	GAAA	2	8	4591169	4591176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_007384	CCTT	2	8	4592513	4592520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18122	NC_007384	T	6	6	4592522	4592527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_007384	A	6	6	4592573	4592578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_007384	CTT	2	6	4592598	4592603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_007384	TAC	2	6	4592610	4592615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18127	NC_007384	CGAC	2	8	4594134	4594141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18128	NC_007384	TGC	2	6	4594179	4594184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18129	NC_007384	ATT	2	6	4594239	4594244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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