MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_007384	A	6	6	4353327	4353332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_007384	CAA	2	6	4353370	4353375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_007384	TC	3	6	4353424	4353429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17005	NC_007384	CTT	2	6	4355663	4355668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_007384	T	6	6	4356657	4356662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_007384	A	6	6	4357384	4357389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_007384	AAC	2	6	4357396	4357401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_007384	GCG	2	6	4357438	4357443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_007384	A	9	9	4357463	4357471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_007384	AT	3	6	4357481	4357486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_007384	GCG	2	6	4361580	4361585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_007384	TCG	2	6	4361645	4361650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_007384	CGCC	2	8	4361679	4361686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17015	NC_007384	TGA	2	6	4361767	4361772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_007384	AAAT	2	8	4361838	4361845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_007384	CT	3	6	4361866	4361871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17018	NC_007384	ATGTA	2	10	4361952	4361961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_007384	TCC	2	6	4362121	4362126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17020	NC_007384	AGC	2	6	4362163	4362168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_007384	ATT	2	6	4363274	4363279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_007384	GCA	2	6	4363322	4363327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_007384	CGAAAG	2	12	4363347	4363358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17024	NC_007384	ACTG	2	8	4363408	4363415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17025	NC_007384	TTC	2	6	4363587	4363592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17029	NC_007384	TGA	2	6	4363812	4363817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17042	NC_007384	CTG	2	6	4364311	4364316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_007384	TC	3	6	4364330	4364335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17046	NC_007384	GC	3	6	4364579	4364584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17047	NC_007384	CGG	2	6	4364625	4364630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17052	NC_007384	TG	3	6	4364890	4364895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_007384	CTG	2	6	4364950	4364955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17055	NC_007384	TGC	2	6	4364994	4364999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17059	NC_007384	GC	3	6	4365176	4365181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17060	NC_007384	TC	3	6	4365232	4365237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_007384	TTAA	2	8	4365349	4365356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17090	NC_007384	CATA	2	8	4372969	4372976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17091	NC_007384	GCATC	2	10	4373010	4373019	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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17101	NC_007384	TCAG	2	8	4377802	4377809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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17112	NC_007384	TGA	2	6	4382980	4382985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17118	NC_007384	A	8	8	4385824	4385831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_007384	TAT	2	6	4385857	4385862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_007384	CGC	2	6	4385873	4385878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17121	NC_007384	AAGCG	2	10	4385886	4385895	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17122	NC_007384	TG	3	6	4385927	4385932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_007384	GGC	2	6	4386081	4386086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17253	NC_007384	TG	3	6	4426221	4426226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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