MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_007384	AAT	2	6	4229769	4229774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_007384	AAC	2	6	4229811	4229816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_007384	TCCAGT	2	12	4229867	4229878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_007384	TTTCAG	2	12	4229915	4229926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16505	NC_007384	TGG	2	6	4229948	4229953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_007384	TCT	2	6	4229987	4229992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_007384	GAT	2	6	4230103	4230108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_007384	CA	3	6	4230145	4230150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16509	NC_007384	CAG	2	6	4230170	4230175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_007384	AGC	2	6	4230226	4230231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_007384	AGGA	2	8	4230264	4230271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_007384	CTG	2	6	4230279	4230284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16513	NC_007384	CGC	2	6	4230286	4230291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_007384	GTT	2	6	4230302	4230307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_007384	TGC	2	6	4230322	4230327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_007384	CTC	2	6	4230389	4230394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16517	NC_007384	AAG	2	6	4230396	4230401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_007384	A	6	6	4230421	4230426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_007384	CCAA	2	8	4231394	4231401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16520	NC_007384	G	6	6	4231464	4231469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_007384	ATC	2	6	4231503	4231508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16522	NC_007384	CAA	2	6	4231552	4231557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_007384	GTC	2	6	4231593	4231598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16524	NC_007384	ACC	2	6	4231613	4231618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16525	NC_007384	CTC	2	6	4231654	4231659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16526	NC_007384	CAG	2	6	4231780	4231785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_007384	C	6	6	4231794	4231799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16528	NC_007384	CTG	2	6	4231807	4231812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_007384	CAG	2	6	4231852	4231857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16530	NC_007384	TA	3	6	4232003	4232008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_007384	TAA	2	6	4232010	4232015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_007384	TGAT	2	8	4232061	4232068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_007384	GC	3	6	4232080	4232085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16534	NC_007384	TGT	2	6	4232098	4232103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_007384	AAC	2	6	4232157	4232162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16536	NC_007384	TAA	2	6	4232185	4232190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_007384	TCAA	2	8	4232208	4232215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16538	NC_007384	AG	3	6	4232273	4232278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_007384	TCA	3	9	4232295	4232303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16540	NC_007384	TTG	2	6	4232366	4232371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_007384	ATA	2	6	4232394	4232399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_007384	TTG	2	6	4232453	4232458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_007384	T	8	8	4232459	4232466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_007384	TTTA	2	8	4232470	4232477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_007384	TGA	2	6	4232488	4232493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_007384	GAT	2	6	4232552	4232557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_007384	TAAT	2	8	4232561	4232568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_007384	ATA	2	6	4232581	4232586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_007384	TGTT	2	8	4232592	4232599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_007384	TATGAC	2	12	4232656	4232667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16551	NC_007384	CAAT	2	8	4232709	4232716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16552	NC_007384	ATT	2	6	4232725	4232730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_007384	T	6	6	4232729	4232734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_007384	GCA	2	6	4232749	4232754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16555	NC_007384	CGT	2	6	4233535	4233540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16556	NC_007384	GCA	2	6	4233576	4233581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16557	NC_007384	TTG	2	6	4233596	4233601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_007384	TGT	2	6	4233602	4233607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_007384	CAA	2	6	4233669	4233674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_007384	TGG	2	6	4233752	4233757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_007384	TGA	2	6	4233788	4233793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_007384	A	6	6	4233802	4233807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_007384	CTT	2	6	4233838	4233843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_007384	GAG	2	6	4233863	4233868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_007384	TTCTC	2	10	4234637	4234646	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16566	NC_007384	GTT	2	6	4234756	4234761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_007384	AGG	2	6	4234767	4234772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_007384	T	6	6	4236276	4236281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_007384	T	6	6	4239311	4239316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_007384	TATT	2	8	4243944	4243951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16573	NC_007384	GT	3	6	4248276	4248281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_007384	A	7	7	4248394	4248400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16575	NC_007384	A	6	6	4252419	4252424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_007384	ATT	2	6	4252439	4252444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16581	NC_007384	TAT	2	6	4252598	4252603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_007384	CGC	2	6	4252614	4252619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16583	NC_007384	TG	3	6	4252668	4252673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_007384	GGC	2	6	4252822	4252827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16590	NC_007384	GCA	2	6	4253135	4253140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16596	NC_007384	GGA	2	6	4253494	4253499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16598	NC_007384	GAA	2	6	4253757	4253762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_007384	TGC	2	6	4253833	4253838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16600	NC_007384	GTC	2	6	4253845	4253850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16601	NC_007384	TTG	2	6	4253906	4253911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_007384	CCGG	2	8	4253920	4253927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16603	NC_007384	GGA	2	6	4253958	4253963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16607	NC_007384	AC	3	6	4254178	4254183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16608	NC_007384	GTAG	2	8	4254219	4254226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16609	NC_007384	CCT	2	6	4254319	4254324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16610	NC_007384	AAG	2	6	4254332	4254337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16611	NC_007384	CA	3	6	4254354	4254359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16612	NC_007384	CGG	2	6	4254450	4254455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16613	NC_007384	AAC	2	6	4254603	4254608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16614	NC_007384	GTT	2	6	4254613	4254618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16616	NC_007384	GAT	2	6	4254646	4254651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16618	NC_007384	AGC	2	6	4254942	4254947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16619	NC_007384	GT	5	10	4254963	4254972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16620	NC_007384	GC	3	6	4254993	4254998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16621	NC_007384	G	6	6	4255086	4255091	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16622	NC_007384	TCC	2	6	4255096	4255101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16623	NC_007384	CTGA	2	8	4255116	4255123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16624	NC_007384	GTAC	2	8	4255200	4255207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16625	NC_007384	GGA	2	6	4255405	4255410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_007384	AC	3	6	4255623	4255628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16628	NC_007384	AAC	2	6	4255660	4255665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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