MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007384	AAT	2	6	3731527	3731532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_007384	AGGC	2	8	3731552	3731559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14503	NC_007384	T	7	7	3731615	3731621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_007384	GCCA	3	12	3731791	3731802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_007384	GAT	2	6	3731813	3731818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_007384	GC	3	6	3731867	3731872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14507	NC_007384	ATA	2	6	3731920	3731925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_007384	TCA	2	6	3731930	3731935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_007384	AAT	2	6	3732009	3732014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_007384	CAC	2	6	3732045	3732050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14511	NC_007384	CAGC	2	8	3732074	3732081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14512	NC_007384	ACAT	2	8	3732208	3732215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14513	NC_007384	TGC	2	6	3732368	3732373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_007384	A	6	6	3732391	3732396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_007384	ATC	2	6	3732460	3732465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_007384	CCGGAA	2	12	3732479	3732490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_007384	CACC	2	8	3732491	3732498	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14518	NC_007384	CTC	2	6	3733933	3733938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14519	NC_007384	CAGC	2	8	3733957	3733964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14520	NC_007384	GGCT	2	8	3733976	3733983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14521	NC_007384	TCG	2	6	3735663	3735668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_007384	TGG	2	6	3735712	3735717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_007384	TTA	2	6	3735744	3735749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_007384	A	6	6	3735757	3735762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_007384	GTT	2	6	3735809	3735814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_007384	CGC	2	6	3735845	3735850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14527	NC_007384	ATTG	2	8	3735921	3735928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_007384	T	6	6	3735956	3735961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_007384	ATG	2	6	3735962	3735967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_007384	GCA	2	6	3735990	3735995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_007384	CAC	2	6	3736026	3736031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14532	NC_007384	GAA	2	6	3736039	3736044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_007384	ATA	2	6	3737491	3737496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_007384	TAT	2	6	3737532	3737537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_007384	T	6	6	3737618	3737623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_007384	AAAT	2	8	3737633	3737640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_007384	A	7	7	3739092	3739098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_007384	TTA	2	6	3739118	3739123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_007384	AAT	2	6	3739129	3739134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_007384	AT	3	6	3739133	3739138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_007384	AT	3	6	3739166	3739171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_007384	TTA	2	6	3739185	3739190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_007384	ATT	2	6	3739225	3739230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_007384	TGCT	2	8	3739231	3739238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14545	NC_007384	TAT	2	6	3739272	3739277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_007384	CA	3	6	3739306	3739311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14547	NC_007384	ATC	2	6	3739314	3739319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_007384	ATTT	2	8	3739341	3739348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_007384	ATCA	2	8	3739349	3739356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14550	NC_007384	GCG	2	6	3739372	3739377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_007384	ATTA	2	8	3739384	3739391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_007384	A	8	8	3740266	3740273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_007384	TAA	2	6	3740319	3740324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_007384	T	7	7	3740410	3740416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_007384	AT	3	6	3740445	3740450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_007384	TGC	2	6	3740454	3740459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_007384	TTA	2	6	3740466	3740471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_007384	ACT	2	6	3740492	3740497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_007384	T	6	6	3740533	3740538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_007384	TGAAAT	2	12	3740576	3740587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_007384	TGA	2	6	3741406	3741411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_007384	AGG	2	6	3741472	3741477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_007384	ATT	2	6	3741499	3741504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_007384	TGA	2	6	3741560	3741565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_007384	GTT	2	6	3741633	3741638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_007384	GTG	2	6	3741641	3741646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_007384	T	6	6	3746036	3746041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_007384	GC	3	6	3746047	3746052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14569	NC_007384	GAG	2	6	3746053	3746058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_007384	A	8	8	3746153	3746160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_007384	TGG	2	6	3746215	3746220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_007384	GCCA	2	8	3746309	3746316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14573	NC_007384	ATT	2	6	3746915	3746920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_007384	GTT	2	6	3746939	3746944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_007384	AT	3	6	3747039	3747044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_007384	TAAG	2	8	3747051	3747058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_007384	GTT	2	6	3747066	3747071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_007384	GAA	2	6	3747157	3747162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_007384	CTTT	2	8	3747242	3747249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14580	NC_007384	TA	3	6	3747301	3747306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_007384	A	7	7	3747354	3747360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_007384	A	7	7	3747510	3747516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_007384	AAT	2	6	3747540	3747545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_007384	ATT	2	6	3747558	3747563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_007384	ACA	2	6	3747588	3747593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14593	NC_007384	AT	3	6	3748911	3748916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_007384	TGC	2	6	3749309	3749314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_007384	TG	3	6	3749983	3749988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_007384	ACAGG	2	10	3750607	3750616	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14597	NC_007384	TAA	3	9	3750622	3750630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_007384	ATG	2	6	3750666	3750671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_007384	GCATCT	2	12	3750686	3750697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14601	NC_007384	ATA	2	6	3751447	3751452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_007384	TTG	2	6	3751460	3751465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_007384	TGC	2	6	3751470	3751475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_007384	ATG	2	6	3751495	3751500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_007384	CCT	2	6	3751545	3751550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14606	NC_007384	GTG	2	6	3751568	3751573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_007384	CCT	2	6	3752231	3752236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14608	NC_007384	AAT	2	6	3752271	3752276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_007384	TAA	2	6	3752287	3752292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_007384	TAT	2	6	3752305	3752310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_007384	TATTTC	2	12	3752353	3752364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14612	NC_007384	GT	3	6	3752417	3752422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_007384	T	7	7	3752427	3752433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_007384	GA	3	6	3752511	3752516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_007384	ATT	2	6	3752624	3752629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14617	NC_007384	TCT	2	6	3753592	3753597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_007384	AC	3	6	3753598	3753603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14619	NC_007384	A	7	7	3753684	3753690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_007384	AAC	2	6	3753722	3753727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_007384	TTA	2	6	3753754	3753759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_007384	GT	3	6	3753772	3753777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_007384	T	8	8	3753785	3753792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_007384	TAA	2	6	3755129	3755134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_007384	TGT	2	6	3755164	3755169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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