MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007384	TTA	2	6	312206	312211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007384	TAA	2	6	312218	312223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007384	AAC	2	6	312231	312236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007384	CAA	2	6	312262	312267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_007384	CGA	2	6	312301	312306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007384	CGTT	2	8	312321	312328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_007384	AGC	2	6	314871	314876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007384	TAT	2	6	314911	314916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007384	TAA	2	6	314935	314940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007384	TCT	2	6	314969	314974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_007384	GTT	2	6	314999	315004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_007384	AGT	2	6	315036	315041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_007384	ATG	2	6	315153	315158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007384	CGT	2	6	315164	315169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_007384	ATG	2	6	315198	315203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_007384	AGA	2	6	315323	315328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007384	T	6	6	315392	315397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_007384	GTA	2	6	315485	315490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007384	GCA	2	6	315542	315547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007384	TAA	2	6	315556	315561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007384	AG	4	8	315627	315634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007384	GAA	2	6	315638	315643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_007384	AG	3	6	315674	315679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007384	TG	3	6	315755	315760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007384	ATTA	2	8	315838	315845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_007384	TAAA	2	8	315965	315972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007384	AAAT	2	8	315973	315980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_007384	TCCCT	2	10	316018	316027	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1029	NC_007384	C	6	6	316069	316074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1030	NC_007384	TC	3	6	316179	316184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_007384	CAC	2	6	316246	316251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_007384	ATA	2	6	316329	316334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007384	T	6	6	316401	316406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_007384	TG	3	6	316440	316445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_007384	T	6	6	316465	316470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_007384	TG	3	6	316479	316484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_007384	TGG	2	6	316488	316493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_007384	CAA	2	6	316551	316556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_007384	ACA	2	6	316601	316606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_007384	TCA	2	6	317416	317421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_007384	TCTG	2	8	317430	317437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_007384	TAA	2	6	317461	317466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007384	TTG	2	6	317514	317519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_007384	AGGA	2	8	317867	317874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_007384	AAAT	2	8	317927	317934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_007384	AAAC	2	8	317968	317975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_007384	CAA	2	6	317991	317996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_007384	GAA	2	6	318056	318061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_007384	T	6	6	318098	318103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_007384	AG	3	6	318126	318131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007384	ATT	2	6	318133	318138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007384	CA	4	8	318174	318181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_007384	CATT	2	8	318235	318242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_007384	CT	3	6	318254	318259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_007384	GTA	2	6	318272	318277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_007384	AT	3	6	318281	318286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_007384	ATT	2	6	318298	318303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007384	GTA	2	6	318327	318332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007384	GAT	2	6	318352	318357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007384	TAG	2	6	318502	318507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007384	CCTA	2	8	319688	319695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_007384	CCA	2	6	319711	319716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_007384	ATA	2	6	319739	319744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007384	TA	3	6	319755	319760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007384	G	6	6	319776	319781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007384	TGC	2	6	319821	319826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007384	ATG	2	6	319846	319851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_007384	CCT	2	6	319896	319901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_007384	GTG	2	6	319919	319924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_007384	TCCT	2	8	321658	321665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_007384	ACA	2	6	322012	322017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_007384	TTA	2	6	322066	322071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007384	CAGA	2	8	322095	322102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_007384	TGA	2	6	322111	322116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007384	GCC	2	6	322906	322911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_007384	CAG	2	6	322924	322929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_007384	CCA	2	6	322956	322961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_007384	CAG	2	6	323044	323049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_007384	CCAG	2	8	323104	323111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_007384	GCA	2	6	323133	323138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_007384	TCG	2	6	323150	323155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_007384	CTT	2	6	323199	323204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_007384	TGG	2	6	323223	323228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_007384	TCA	2	6	323253	323258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_007384	TCT	2	6	323259	323264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_007384	GTT	2	6	325896	325901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_007384	TTA	2	6	325986	325991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007384	TAAA	2	8	325999	326006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_007384	GCT	2	6	326030	326035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_007384	CAC	2	6	326060	326065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_007384	GCG	2	6	326069	326074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_007384	CTG	2	6	326076	326081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_007384	CCG	2	6	326108	326113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_007384	GGC	2	6	326201	326206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_007384	GCT	2	6	326210	326215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_007384	TGG	2	6	326278	326283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_007384	ACC	2	6	326292	326297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_007384	CTGG	2	8	326378	326385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_007384	GCC	2	6	326430	326435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_007384	TGA	2	6	326444	326449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_007384	GC	6	12	326493	326504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_007384	AGG	2	6	326542	326547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007384	AGA	2	6	326548	326553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_007384	AAC	2	6	326584	326589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_007384	GAA	2	6	326694	326699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_007384	TGG	2	6	326722	326727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007384	GCG	2	6	326740	326745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007384	AG	3	6	326811	326816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_007384	GTG	2	6	326827	326832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_007384	CTCA	2	8	327944	327951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_007384	TGT	2	6	327993	327998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_007384	CA	3	6	328025	328030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_007384	A	6	6	331178	331183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_007384	TTCTTT	2	12	331209	331220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1115	NC_007384	T	6	6	331224	331229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_007384	TAT	2	6	331304	331309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_007384	TAT	2	6	331336	331341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007384	CTG	2	6	331392	331397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_007384	ATT	2	6	331401	331406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_007384	TGC	2	6	331442	331447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_007384	ATG	2	6	331467	331472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_007384	CCT	2	6	331517	331522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_007384	GTG	2	6	331540	331545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_007384	TTAT	2	8	332208	332215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_007384	GTC	2	6	333162	333167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_007384	TGA	2	6	333177	333182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_007384	CA	3	6	333265	333270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_007384	ATG	2	6	333274	333279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007384	T	7	7	333289	333295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_007384	CA	3	6	333312	333317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_007384	T	6	6	333343	333348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_007384	TCCT	2	8	333400	333407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_007384	ACA	2	6	333754	333759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_007384	TTA	2	6	333808	333813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_007384	TGA	2	6	333853	333858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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