MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007384	CAC	2	6	3340076	3340081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_007384	AAC	2	6	3340204	3340209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_007384	TATT	2	8	3340224	3340231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_007384	ACTA	2	8	3340263	3340270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_007384	GCC	2	6	3340353	3340358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_007384	AAC	2	6	3340429	3340434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_007384	TAT	2	6	3340437	3340442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_007384	TCC	2	6	3340458	3340463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_007384	GAA	2	6	3340525	3340530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_007384	TA	3	6	3340546	3340551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_007384	AG	3	6	3340592	3340597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_007384	T	6	6	3341554	3341559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_007384	CTT	2	6	3341579	3341584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_007384	GAG	2	6	3341586	3341591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_007384	GGC	2	6	3341649	3341654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_007384	AAC	2	6	3341673	3341678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_007384	CGG	2	6	3341687	3341692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_007384	CAG	2	6	3341696	3341701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_007384	CTTC	2	8	3341707	3341714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_007384	CTGG	2	8	3341742	3341749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_007384	CTG	2	6	3341805	3341810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_007384	TG	3	6	3341830	3341835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_007384	ATCA	2	8	3341868	3341875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_007384	ATAC	2	8	3341978	3341985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_007384	TACT	2	8	3342003	3342010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_007384	CAG	2	6	3342018	3342023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_007384	ATT	2	6	3342032	3342037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_007384	A	6	6	3342075	3342080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_007384	GAA	2	6	3342118	3342123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_007384	AAT	2	6	3342256	3342261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_007384	ATG	2	6	3342290	3342295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_007384	ATA	2	6	3342338	3342343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_007384	GTC	2	6	3342353	3342358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_007384	TC	3	6	3342363	3342368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_007384	TTA	2	6	3342390	3342395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_007384	TTCA	2	8	3342420	3342427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_007384	AGA	2	6	3342507	3342512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_007384	CG	3	6	3342532	3342537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_007384	TCAG	2	8	3342571	3342578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13040	NC_007384	AAC	2	6	3342588	3342593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_007384	CAC	3	9	3342654	3342662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_007384	CACC	2	8	3342750	3342757	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13043	NC_007384	GGC	2	6	3342816	3342821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_007384	ACTT	2	8	3342857	3342864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13045	NC_007384	ACC	2	6	3342896	3342901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_007384	AGC	2	6	3342906	3342911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_007384	ACC	2	6	3342918	3342923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_007384	AATT	2	8	3342954	3342961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_007384	CTA	2	6	3345922	3345927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_007384	TCC	2	6	3346196	3346201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_007384	AT	3	6	3346290	3346295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_007384	A	6	6	3346326	3346331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_007384	A	6	6	3346339	3346344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_007384	TTA	3	9	3346375	3346383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_007384	TTA	2	6	3347088	3347093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_007384	T	6	6	3348815	3348820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_007384	TCA	2	6	3348932	3348937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_007384	ATG	2	6	3349013	3349018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_007384	TCA	2	6	3349026	3349031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_007384	TGT	2	6	3349041	3349046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_007384	TTA	2	6	3349066	3349071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_007384	G	6	6	3349085	3349090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_007384	TCC	2	6	3349096	3349101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_007384	CTTTA	2	10	3349115	3349124	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13065	NC_007384	A	8	8	3349130	3349137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_007384	AAG	2	6	3349146	3349151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_007384	T	6	6	3349191	3349196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_007384	TCA	2	6	3349308	3349313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_007384	ATG	2	6	3349389	3349394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_007384	TCA	2	6	3349402	3349407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_007384	GTTGT	2	10	3349413	3349422	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_007384	AAC	2	6	3349447	3349452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_007384	GAA	2	6	3349465	3349470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_007384	TCC	2	6	3349472	3349477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_007384	CTTTA	2	10	3349491	3349500	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13076	NC_007384	A	6	6	3349506	3349511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_007384	GCCT	2	8	3349527	3349534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_007384	GA	3	6	3351013	3351018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_007384	GC	3	6	3351029	3351034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_007384	ATA	2	6	3351036	3351041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_007384	T	6	6	3355273	3355278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_007384	ACT	2	6	3355414	3355419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_007384	CTT	2	6	3356081	3356086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_007384	TTA	3	9	3356099	3356107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_007384	GAT	2	6	3356130	3356135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_007384	CACCCC	2	12	3357470	3357481	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13087	NC_007384	ATT	2	6	3358376	3358381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_007384	ACT	2	6	3358402	3358407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_007384	CCTG	2	8	3358826	3358833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_007384	TAT	2	6	3358874	3358879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_007384	TGG	2	6	3359547	3359552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_007384	GCC	2	6	3359607	3359612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_007384	TGC	2	6	3359641	3359646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_007384	GCA	2	6	3359758	3359763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_007384	CGC	2	6	3359803	3359808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_007384	GGA	2	6	3359813	3359818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_007384	T	6	6	3359843	3359848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_007384	GAC	2	6	3359917	3359922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_007384	TGC	2	6	3359972	3359977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_007384	ATA	2	6	3359980	3359985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_007384	ATA	2	6	3360017	3360022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_007384	TGGC	2	8	3360145	3360152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13103	NC_007384	CAAAAC	2	12	3360169	3360180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_007384	ATC	2	6	3360195	3360200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_007384	AAC	2	6	3360280	3360285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_007384	TCAG	2	8	3360297	3360304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_007384	CGC	2	6	3360310	3360315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13108	NC_007384	GAGCG	2	10	3360316	3360325	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13109	NC_007384	CAG	2	6	3360329	3360334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_007384	GTT	2	6	3360336	3360341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_007384	CGC	2	6	3360404	3360409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_007384	GCG	2	6	3360411	3360416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_007384	ATTC	2	8	3360560	3360567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_007384	A	6	6	3360616	3360621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_007384	TTA	2	6	3364794	3364799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_007384	CTC	2	6	3364869	3364874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13117	NC_007384	AGC	3	9	3364919	3364927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_007384	AGTTGT	2	12	3365260	3365271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_007384	AT	3	6	3367151	3367156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_007384	AAC	2	6	3367188	3367193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_007384	CGC	2	6	3369143	3369148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13123	NC_007384	CAG	2	6	3371329	3371334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_007384	CCA	2	6	3371338	3371343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_007384	CTTTTT	2	12	3371376	3371387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13126	NC_007384	AT	3	6	3371388	3371393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_007384	AT	3	6	3372189	3372194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13129	NC_007384	AATGAT	2	12	3372211	3372222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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