MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007384	TCC	2	6	3186266	3186271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_007384	GAA	2	6	3186306	3186311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_007384	CG	3	6	3186359	3186364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_007384	AGA	2	6	3186413	3186418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_007384	CAA	2	6	3186539	3186544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_007384	GCA	2	6	3186615	3186620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_007384	TC	4	8	3186623	3186630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_007384	GGT	2	6	3186666	3186671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_007384	CTG	2	6	3186738	3186743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_007384	GGC	2	6	3186750	3186755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_007384	GCA	2	6	3186846	3186851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_007384	AGA	2	6	3186893	3186898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_007384	AGA	2	6	3186914	3186919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_007384	CTGC	2	8	3186958	3186965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_007384	CAAG	2	8	3186971	3186978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12516	NC_007384	CAACG	2	10	3187044	3187053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12517	NC_007384	A	6	6	3187149	3187154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_007384	CCG	2	6	3187204	3187209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_007384	CGG	2	6	3187252	3187257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_007384	GCA	2	6	3187263	3187268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_007384	GGC	2	6	3187329	3187334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_007384	GTG	2	6	3187335	3187340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_007384	TCA	2	6	3189545	3189550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_007384	TCTG	2	8	3189559	3189566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_007384	TAA	2	6	3189590	3189595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_007384	TTG	2	6	3189643	3189648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_007384	AGGA	2	8	3189996	3190003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_007384	ATT	2	6	3190052	3190057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_007384	TTG	2	6	3190104	3190109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_007384	GCT	2	6	3190137	3190142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_007384	A	6	6	3190168	3190173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_007384	GGCG	2	8	3190234	3190241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12533	NC_007384	ACA	2	6	3190284	3190289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_007384	GCG	2	6	3190364	3190369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_007384	CGT	2	6	3190409	3190414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_007384	GAA	2	6	3190451	3190456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_007384	ACG	2	6	3190464	3190469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_007384	AAT	2	6	3190490	3190495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_007384	GTC	2	6	3190566	3190571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_007384	CAG	2	6	3190640	3190645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_007384	CTGA	2	8	3190727	3190734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12542	NC_007384	TCC	2	6	3190769	3190774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_007384	GCT	2	6	3190781	3190786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_007384	CG	3	6	3190795	3190800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_007384	CCA	2	6	3190843	3190848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12546	NC_007384	AAC	2	6	3190865	3190870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_007384	CGCT	2	8	3190963	3190970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_007384	CAA	2	6	3190993	3190998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_007384	GT	3	6	3190999	3191004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_007384	CAG	2	6	3191188	3191193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_007384	AAC	2	6	3191285	3191290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_007384	ACC	2	6	3191293	3191298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_007384	CAT	2	6	3191320	3191325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_007384	CCA	2	6	3191335	3191340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_007384	CAT	3	9	3191342	3191350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_007384	CTG	2	6	3191354	3191359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_007384	CAT	2	6	3196750	3196755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_007384	CAA	2	6	3197081	3197086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_007384	GGT	2	6	3197123	3197128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_007384	CTA	2	6	3200734	3200739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_007384	TCT	2	6	3200767	3200772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_007384	AT	3	6	3200799	3200804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_007384	ATT	2	6	3200850	3200855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_007384	ATT	2	6	3200879	3200884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_007384	T	6	6	3202629	3202634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_007384	CTG	2	6	3202654	3202659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_007384	CT	4	8	3202670	3202677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12568	NC_007384	AT	3	6	3202728	3202733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_007384	T	6	6	3202742	3202747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_007384	ATG	2	6	3202839	3202844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_007384	TCA	2	6	3205099	3205104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_007384	TCT	2	6	3205181	3205186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_007384	CCGC	2	8	3205336	3205343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12574	NC_007384	CG	3	6	3205350	3205355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12575	NC_007384	CCG	2	6	3205376	3205381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12576	NC_007384	ATATCA	2	12	3205393	3205404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12578	NC_007384	AAAC	2	8	3205421	3205428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12579	NC_007384	ACG	2	6	3205439	3205444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_007384	CGA	2	6	3205450	3205455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_007384	CCG	2	6	3205456	3205461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12582	NC_007384	CAGC	2	8	3205512	3205519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12583	NC_007384	GAT	2	6	3205590	3205595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_007384	ATAC	2	8	3205632	3205639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12585	NC_007384	CGG	2	6	3205738	3205743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_007384	TTC	2	6	3205764	3205769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12590	NC_007384	CTT	2	6	3205979	3205984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_007384	CGT	2	6	3206003	3206008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12593	NC_007384	T	6	6	3206158	3206163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_007384	AGA	2	6	3206168	3206173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_007384	CAG	2	6	3209637	3209642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_007384	CTT	2	6	3210931	3210936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_007384	CAA	2	6	3210983	3210988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_007384	T	7	7	3211002	3211008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_007384	AAAT	2	8	3213037	3213044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_007384	TTG	2	6	3214933	3214938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_007384	AATT	2	8	3215724	3215731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_007384	CT	3	6	3218884	3218889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12603	NC_007384	AG	3	6	3218898	3218903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_007384	AGA	2	6	3218947	3218952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_007384	A	6	6	3219367	3219372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_007384	CAC	2	6	3220523	3220528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_007384	ACC	2	6	3220590	3220595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12608	NC_007384	ATC	2	6	3220627	3220632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_007384	A	6	6	3220649	3220654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_007384	A	6	6	3220675	3220680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_007384	A	6	6	3220683	3220688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_007384	TA	3	6	3220701	3220706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_007384	GAT	2	6	3220709	3220714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_007384	A	7	7	3220756	3220762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_007384	A	6	6	3220767	3220772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_007384	A	6	6	3220782	3220787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_007384	A	6	6	3220862	3220867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_007384	CAG	2	6	3220902	3220907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_007384	T	6	6	3224660	3224665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_007384	TCG	2	6	3225255	3225260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_007384	GGA	2	6	3225267	3225272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_007384	TGG	2	6	3225303	3225308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_007384	TCT	2	6	3225327	3225332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_007384	CAG	2	6	3225401	3225406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_007384	GTCC	2	8	3225879	3225886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12626	NC_007384	CGA	2	6	3225904	3225909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_007384	GCG	2	6	3225949	3225954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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