MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_007384	GGC	2	6	2656166	2656171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_007384	ATT	2	6	2656190	2656195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_007384	ACC	2	6	2656232	2656237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_007384	CG	3	6	2656284	2656289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10506	NC_007384	TGC	2	6	2656377	2656382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_007384	CTG	2	6	2656400	2656405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_007384	GCG	2	6	2656655	2656660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_007384	GGCG	2	8	2656674	2656681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10510	NC_007384	ATT	2	6	2656721	2656726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_007384	CTG	2	6	2656733	2656738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_007384	GGC	2	6	2656808	2656813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_007384	GCG	2	6	2656814	2656819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_007384	GTTT	2	8	2656824	2656831	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_007384	GTCTG	2	10	2656888	2656897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10516	NC_007384	TGA	2	6	2656911	2656916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_007384	TGG	2	6	2656968	2656973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_007384	CAC	2	6	2656996	2657001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10519	NC_007384	CAGT	2	8	2658354	2658361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_007384	CTGG	2	8	2658369	2658376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10521	NC_007384	ATC	2	6	2658383	2658388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_007384	TTG	2	6	2659342	2659347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_007384	T	6	6	2659364	2659369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_007384	CGG	3	9	2659372	2659380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_007384	TGAAA	2	10	2661010	2661019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_007384	CGT	2	6	2661045	2661050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_007384	CGATA	2	10	2661062	2661071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10528	NC_007384	TAT	2	6	2661087	2661092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10531	NC_007384	CGCC	2	8	2666094	2666101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10532	NC_007384	CCAG	2	8	2666142	2666149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10535	NC_007384	ATG	2	6	2666261	2666266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_007384	ATC	2	6	2666294	2666299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_007384	TGGT	2	8	2666333	2666340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10539	NC_007384	TCT	2	6	2666393	2666398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10541	NC_007384	GC	4	8	2666627	2666634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10542	NC_007384	TCG	2	6	2666636	2666641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_007384	GC	3	6	2666718	2666723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_007384	CGA	2	6	2666726	2666731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_007384	GTG	2	6	2666747	2666752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10549	NC_007384	TTC	2	6	2667017	2667022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10551	NC_007384	GTC	2	6	2667109	2667114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_007384	ATT	2	6	2667250	2667255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_007384	ACA	2	6	2667282	2667287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_007384	GCC	2	6	2667296	2667301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_007384	CGCC	2	8	2667330	2667337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10556	NC_007384	GTT	2	6	2670092	2670097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10558	NC_007384	GCG	2	6	2670212	2670217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_007384	GCATC	2	10	2670274	2670283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10560	NC_007384	GCG	2	6	2670312	2670317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10563	NC_007384	GA	3	6	2677979	2677984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_007384	ATAA	2	8	2678027	2678034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10610	NC_007384	TATCA	2	10	2699840	2699849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10611	NC_007384	A	6	6	2699851	2699856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_007384	GAT	2	6	2699863	2699868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10623	NC_007384	TCGTT	2	10	2706916	2706925	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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