MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007384	CAA	2	6	2544851	2544856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_007384	TTTC	2	8	2544859	2544866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_007384	GCG	2	6	2544901	2544906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_007384	T	6	6	2544939	2544944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_007384	TTC	2	6	2544947	2544952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_007384	AAAT	2	8	2545078	2545085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_007384	GAT	2	6	2545126	2545131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_007384	GCAG	2	8	2545156	2545163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_007384	AT	3	6	2545180	2545185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_007384	CAG	2	6	2545221	2545226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_007384	A	6	6	2548369	2548374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_007384	CGG	2	6	2548387	2548392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_007384	A	6	6	2548963	2548968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_007384	CTC	2	6	2560814	2560819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_007384	AG	3	6	2560823	2560828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_007384	A	7	7	2561878	2561884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_007384	A	7	7	2561891	2561897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_007384	CA	3	6	2561900	2561905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_007384	GGC	2	6	2561906	2561911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_007384	TGA	2	6	2561918	2561923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_007384	CTTT	2	8	2567897	2567904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_007384	TAAA	2	8	2567918	2567925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_007384	GAA	3	9	2567942	2567950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_007384	CG	3	6	2567995	2568000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_007384	ATA	2	6	2568049	2568054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_007384	ATC	2	6	2568058	2568063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_007384	AAT	2	6	2568104	2568109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_007384	AAC	2	6	2568161	2568166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_007384	GAA	2	6	2568218	2568223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_007384	AAC	3	9	2568236	2568244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_007384	GCC	2	6	2568343	2568348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_007384	A	6	6	2568364	2568369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_007384	CAAA	2	8	2568385	2568392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_007384	TTC	2	6	2568927	2568932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_007384	ATG	2	6	2568957	2568962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_007384	ATT	2	6	2569003	2569008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_007384	CGA	2	6	2569073	2569078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_007384	ATG	2	6	2570423	2570428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_007384	AGTTA	2	10	2570468	2570477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_007384	GCT	2	6	2570555	2570560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_007384	CTG	2	6	2570602	2570607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_007384	AAC	2	6	2570612	2570617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_007384	CCA	2	6	2570663	2570668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_007384	T	6	6	2570678	2570683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_007384	AGG	2	6	2570694	2570699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_007384	GTT	2	6	2570748	2570753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_007384	TGG	2	6	2570773	2570778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_007384	TGC	2	6	2571177	2571182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_007384	TCTT	2	8	2571211	2571218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10050	NC_007384	AGT	2	6	2571290	2571295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_007384	CAA	2	6	2571359	2571364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_007384	GATTCA	2	12	2571484	2571495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10053	NC_007384	TTGA	2	8	2571561	2571568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_007384	A	6	6	2571703	2571708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_007384	A	7	7	2571782	2571788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_007384	TAC	2	6	2572997	2573002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_007384	A	6	6	2573069	2573074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_007384	CGG	2	6	2573092	2573097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_007384	TG	3	6	2573106	2573111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_007384	TGC	2	6	2573152	2573157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_007384	ATG	2	6	2573177	2573182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_007384	CCT	2	6	2573227	2573232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_007384	GTG	2	6	2573250	2573255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_007384	T	6	6	2573919	2573924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_007384	ACGT	2	8	2573925	2573932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_007384	CAA	2	6	2574005	2574010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_007384	CAA	2	6	2574016	2574021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_007384	ATTT	2	8	2574116	2574123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_007384	A	6	6	2574159	2574164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_007384	AAT	2	6	2574227	2574232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_007384	CAT	2	6	2574267	2574272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10073	NC_007384	AAT	2	6	2574278	2574283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_007384	A	7	7	2574289	2574295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_007384	TA	3	6	2575487	2575492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_007384	TA	3	6	2575503	2575508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_007384	TAA	2	6	2575548	2575553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_007384	CAA	2	6	2576009	2576014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_007384	TGA	2	6	2577517	2577522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10082	NC_007384	CAA	2	6	2577719	2577724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_007384	AT	3	6	2577740	2577745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_007384	AAGA	2	8	2577756	2577763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_007384	AT	3	6	2577773	2577778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_007384	CAAC	2	8	2577780	2577787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10087	NC_007384	ATT	2	6	2577806	2577811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_007384	TGG	3	9	2577824	2577832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_007384	TTAA	2	8	2578005	2578012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_007384	TCA	2	6	2578035	2578040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_007384	A	6	6	2578083	2578088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_007384	TAC	2	6	2578099	2578104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_007384	GTG	2	6	2578124	2578129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_007384	TCCC	2	8	2578196	2578203	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10099	NC_007384	A	6	6	2578204	2578209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_007384	AC	3	6	2578213	2578218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_007384	TA	3	6	2578249	2578254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_007384	ATT	2	6	2578273	2578278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_007384	ATT	2	6	2578287	2578292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_007384	AACATC	2	12	2578311	2578322	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10108	NC_007384	TAT	2	6	2578602	2578607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_007384	CTT	2	6	2578608	2578613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_007384	TGC	2	6	2578628	2578633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10112	NC_007384	CCT	2	6	2578703	2578708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_007384	GTG	2	6	2578726	2578731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_007384	TGT	2	6	2578914	2578919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_007384	TGT	2	6	2580121	2580126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_007384	T	6	6	2581635	2581640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_007384	AGGT	2	8	2581647	2581654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_007384	GTT	2	6	2582922	2582927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_007384	ATA	3	9	2582958	2582966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_007384	TAA	2	6	2582986	2582991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_007384	TCAT	2	8	2583010	2583017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10122	NC_007384	GTC	2	6	2583078	2583083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10124	NC_007384	TG	3	6	2583184	2583189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_007384	TCA	2	6	2583222	2583227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_007384	TGC	2	6	2583293	2583298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_007384	GATT	2	8	2583384	2583391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_007384	T	6	6	2583401	2583406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_007384	ATG	2	6	2583586	2583591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_007384	ACGT	2	8	2612043	2612050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10259	NC_007384	CAT	2	6	2612098	2612103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10260	NC_007384	CGG	2	6	2612146	2612151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_007384	CGG	2	6	2612257	2612262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10262	NC_007384	TGT	2	6	2612265	2612270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_007384	TGC	2	6	2612404	2612409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_007384	ATG	2	6	2612429	2612434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_007384	CCT	2	6	2612479	2612484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10266	NC_007384	GTG	2	6	2612502	2612507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_007384	CG	3	6	2613211	2613216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10268	NC_007384	CAA	2	6	2613244	2613249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10269	NC_007384	ATC	2	6	2613452	2613457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10270	NC_007384	ATG	2	6	2613468	2613473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_007384	ATTC	2	8	2613494	2613501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10272	NC_007384	TAC	2	6	2613557	2613562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10273	NC_007384	CGGT	2	8	2613603	2613610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10274	NC_007384	ATC	2	6	2613620	2613625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10275	NC_007384	AGC	2	6	2613654	2613659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10276	NC_007384	GCAAA	2	10	2613697	2613706	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10277	NC_007384	A	6	6	2613854	2613859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10278	NC_007384	TGA	2	6	2613937	2613942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10280	NC_007384	CTG	2	6	2613968	2613973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10281	NC_007384	TGG	2	6	2613984	2613989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10282	NC_007384	CTG	2	6	2614163	2614168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10291	NC_007384	TCT	2	6	2616376	2616381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10292	NC_007384	CCG	2	6	2616497	2616502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10295	NC_007384	TGC	2	6	2616634	2616639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10297	NC_007384	GCG	2	6	2616677	2616682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10299	NC_007384	TTA	2	6	2616694	2616699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10306	NC_007384	CG	3	6	2617017	2617022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10327	NC_007384	CGCGC	2	10	2618189	2618198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10328	NC_007384	AAAT	2	8	2619591	2619598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10329	NC_007384	CGT	2	6	2619635	2619640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10330	NC_007384	GC	3	6	2619746	2619751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10331	NC_007384	CGT	2	6	2619754	2619759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10333	NC_007384	GCC	2	6	2619801	2619806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10334	NC_007384	CTG	2	6	2619952	2619957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10337	NC_007384	CGCT	2	8	2620086	2620093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10344	NC_007384	TGATT	2	10	2620315	2620324	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10362	NC_007384	ACA	2	6	2626833	2626838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10363	NC_007384	GT	4	8	2626896	2626903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10364	NC_007384	CATA	2	8	2628184	2628191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10365	NC_007384	A	6	6	2628191	2628196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_007384	T	6	6	2628217	2628222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10371	NC_007384	GCT	2	6	2628532	2628537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10372	NC_007384	TGT	2	6	2628541	2628546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10373	NC_007384	TGC	2	6	2628550	2628555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10376	NC_007384	GCA	2	6	2628664	2628669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10377	NC_007384	T	6	6	2628707	2628712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10378	NC_007384	GT	3	6	2628722	2628727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10379	NC_007384	GCCA	2	8	2628729	2628736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10380	NC_007384	CAA	2	6	2628740	2628745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10381	NC_007384	CG	3	6	2628771	2628776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_007384	GCC	2	6	2628827	2628832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10383	NC_007384	CG	3	6	2628846	2628851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10384	NC_007384	TCA	2	6	2628858	2628863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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