MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007384	TTG	2	6	166722	166727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007384	TTC	2	6	166758	166763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_007384	CTG	2	6	166788	166793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007384	TCA	2	6	166855	166860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007384	GCA	2	6	166870	166875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007384	GAC	2	6	166953	166958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007384	ATCG	2	8	167087	167094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_007384	GCC	2	6	167196	167201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_007384	ACC	2	6	167217	167222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_007384	GA	3	6	167232	167237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007384	GAC	2	6	167243	167248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007384	TTA	2	6	167425	167430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007384	GTT	2	6	167483	167488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007384	CAC	2	6	168321	168326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_007384	AGG	2	6	168344	168349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007384	CAT	2	6	168394	168399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007384	GCA	2	6	168419	168424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007384	CAC	2	6	168426	168431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_007384	GTA	3	9	168454	168462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007384	AAAT	2	8	168472	168479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007384	ATC	2	6	168496	168501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007384	GCC	2	6	168514	168519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_007384	TTC	2	6	168607	168612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_007384	ATC	2	6	168655	168660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007384	GGC	2	6	168677	168682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_007384	ATGA	2	8	168751	168758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007384	TA	3	6	168907	168912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007384	AGC	2	6	169012	169017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_007384	TTC	2	6	169032	169037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007384	ACA	2	6	169077	169082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_007384	TTAT	2	8	169280	169287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007384	T	8	8	169346	169353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007384	TTCAAT	2	12	169356	169367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
534	NC_007384	TAA	2	6	169385	169390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007384	CGT	2	6	169418	169423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007384	CAA	2	6	169514	169519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007384	CAG	2	6	169548	169553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007384	GAT	2	6	169580	169585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007384	TTAA	2	8	170410	170417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007384	AAT	2	6	170425	170430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007384	ATT	2	6	170443	170448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007384	ATTC	2	8	170466	170473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_007384	ACT	2	6	171112	171117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_007384	GAA	2	6	171123	171128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007384	AAATT	2	10	171253	171262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007384	AAAT	2	8	171285	171292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007384	TAT	2	6	171352	171357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007384	TTA	2	6	171388	171393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007384	AG	3	6	171399	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007384	ATAA	2	8	171441	171448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007384	CAT	2	6	173346	173351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007384	A	7	7	173359	173365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007384	A	6	6	174290	174295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007384	TG	3	6	174916	174921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007384	TTAC	2	8	174967	174974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_007384	GGTT	2	8	178732	178739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007384	TCTCCC	2	12	178741	178752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_007384	GC	3	6	178782	178787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_007384	TCACCC	2	12	178792	178803	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_007384	GA	3	6	178850	178855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007384	TCT	3	9	178858	178866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007384	AGA	2	6	178877	178882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007384	CTTT	2	8	181532	181539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_007384	GTT	2	6	181547	181552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007384	TTATC	2	10	181615	181624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
566	NC_007384	TAA	2	6	181629	181634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007384	CGC	2	6	187719	187724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_007384	GCT	2	6	189058	189063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007384	GCT	2	6	189108	189113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_007384	ATT	3	9	190701	190709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007384	TGT	2	6	191100	191105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007384	TCT	2	6	191134	191139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_007384	CT	3	6	191138	191143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_007384	GATT	2	8	193388	193395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007384	A	8	8	193400	193407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007384	TCG	2	6	193418	193423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_007384	ATC	2	6	193494	193499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007384	TCG	2	6	193514	193519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_007384	CAA	2	6	193524	193529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007384	GCC	2	6	193560	193565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_007384	CAG	2	6	193599	193604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_007384	TTG	2	6	193705	193710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007384	CCG	2	6	193743	193748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_007384	AGC	2	6	193766	193771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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586	NC_007384	CTGA	2	8	193827	193834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_007384	GGC	2	6	193850	193855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_007384	ACGGG	2	10	193865	193874	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
589	NC_007384	GAA	2	6	193875	193880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_007384	GCG	2	6	193895	193900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007384	GTG	2	6	194027	194032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007384	TTA	2	6	194081	194086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007384	GAA	2	6	194094	194099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007384	CGA	2	6	194180	194185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_007384	TG	3	6	194196	194201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007384	TGC	2	6	194219	194224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_007384	ATG	2	6	194244	194249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007384	CCT	2	6	194294	194299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_007384	GTG	2	6	194317	194322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007384	AGC	2	6	195022	195027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_007384	ATC	2	6	195031	195036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007384	T	6	6	195150	195155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007384	TAAA	2	8	195178	195185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007384	CTGC	2	8	195222	195229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_007384	ATT	2	6	195257	195262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_007384	TA	3	6	195298	195303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007384	AGC	2	6	195346	195351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_007384	TTA	2	6	195405	195410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007384	ATT	2	6	195577	195582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007384	GCC	2	6	195589	195594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_007384	GACC	2	8	195620	195627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_007384	GAA	2	6	195757	195762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007384	TCA	2	6	197306	197311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_007384	TACGT	2	10	197337	197346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
617	NC_007384	GGA	2	6	197374	197379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_007384	GGC	2	6	198559	198564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007384	GCCC	2	8	199069	199076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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621	NC_007384	A	6	6	199137	199142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_007384	ATC	2	6	199985	199990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_007384	CGT	2	6	200019	200024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_007384	A	6	6	203605	203610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007384	AT	4	8	204461	204468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007384	CAA	2	6	204588	204593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007384	GC	3	6	204627	204632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_007384	AAC	2	6	204693	204698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007384	AC	4	8	204697	204704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_007384	TA	3	6	204777	204782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007384	GGC	2	6	205563	205568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_007384	GAGC	2	8	205614	205621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_007384	GCG	2	6	205637	205642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_007384	GTA	2	6	205677	205682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007384	GCC	2	6	206643	206648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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