MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_007384	ATC	2	6	2131178	2131183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_007384	AAT	2	6	2131229	2131234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_007384	GCA	2	6	2131256	2131261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_007384	TGA	2	6	2131285	2131290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_007384	CAAT	2	8	2131302	2131309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8506	NC_007384	CTTC	2	8	2131350	2131357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_007384	AGT	2	6	2131415	2131420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_007384	ACA	2	6	2131431	2131436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_007384	AAAC	2	8	2131466	2131473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8510	NC_007384	CAG	2	6	2131641	2131646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_007384	ACG	2	6	2131680	2131685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_007384	CTG	2	6	2131800	2131805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_007384	ACG	2	6	2131935	2131940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_007384	AAGT	2	8	2131945	2131952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_007384	GGA	2	6	2131967	2131972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_007384	ATC	2	6	2132205	2132210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_007384	A	6	6	2132333	2132338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_007384	TAA	2	6	2132371	2132376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_007384	AAT	2	6	2132528	2132533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_007384	TCAGC	2	10	2132547	2132556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8521	NC_007384	AGTA	2	8	2132584	2132591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_007384	TAA	2	6	2132671	2132676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_007384	ACA	2	6	2132688	2132693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_007384	GCG	2	6	2132720	2132725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_007384	ATA	2	6	2132820	2132825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_007384	CAG	2	6	2132863	2132868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_007384	GGC	2	6	2132894	2132899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_007384	AACG	2	8	2132908	2132915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_007384	CTC	2	6	2132953	2132958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_007384	TAA	2	6	2133211	2133216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_007384	TA	4	8	2133220	2133227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_007384	ACCA	2	8	2133230	2133237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_007384	CAA	2	6	2133323	2133328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_007384	TGG	2	6	2133636	2133641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_007384	TAA	2	6	2133709	2133714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_007384	CCT	2	6	2133990	2133995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_007384	TCG	2	6	2134014	2134019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_007384	AGC	2	6	2134124	2134129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_007384	GAT	2	6	2134145	2134150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_007384	CT	3	6	2134210	2134215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_007384	AGGTC	2	10	2134306	2134315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8542	NC_007384	CCA	2	6	2134406	2134411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_007384	GAAA	2	8	2134484	2134491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_007384	AAC	2	6	2134542	2134547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_007384	TGA	2	6	2134558	2134563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_007384	TCA	2	6	2134674	2134679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_007384	AACT	2	8	2134729	2134736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_007384	ACAGAC	2	12	2134822	2134833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_007384	CGC	2	6	2134903	2134908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_007384	T	6	6	2135875	2135880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_007384	TCA	2	6	2135986	2135991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_007384	GTT	2	6	2135996	2136001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_007384	GGC	2	6	2136045	2136050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_007384	CAA	2	6	2136074	2136079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_007384	T	7	7	2136122	2136128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_007384	TGT	2	6	2136143	2136148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_007384	ACA	2	6	2136309	2136314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_007384	TGG	2	6	2136368	2136373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_007384	TGG	2	6	2136397	2136402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_007384	CAG	2	6	2136409	2136414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_007384	AGTC	2	8	2136424	2136431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8562	NC_007384	TCA	2	6	2136447	2136452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_007384	AT	3	6	2136502	2136507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_007384	AGG	2	6	2136635	2136640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_007384	TCA	2	6	2136683	2136688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_007384	AGA	2	6	2136725	2136730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_007384	AAT	2	6	2136734	2136739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_007384	TAT	2	6	2136813	2136818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_007384	AAT	2	6	2136825	2136830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_007384	CGG	2	6	2136853	2136858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_007384	CCT	2	6	2136883	2136888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_007384	GCA	2	6	2136934	2136939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_007384	AGG	2	6	2136971	2136976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_007384	TGG	2	6	2137011	2137016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_007384	GCA	3	9	2137066	2137074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_007384	AGT	2	6	2137113	2137118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_007384	TCAA	2	8	2137187	2137194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8578	NC_007384	TAG	2	6	2137228	2137233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_007384	CT	3	6	2138514	2138519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8580	NC_007384	T	6	6	2138519	2138524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_007384	TC	3	6	2138550	2138555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_007384	AATA	2	8	2138566	2138573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_007384	TGA	2	6	2138659	2138664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_007384	TGA	2	6	2138684	2138689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_007384	CAC	2	6	2138690	2138695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8586	NC_007384	AT	3	6	2139231	2139236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_007384	CTG	2	6	2139245	2139250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_007384	CAT	2	6	2139267	2139272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_007384	CAA	2	6	2139365	2139370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_007384	ACTG	2	8	2139395	2139402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8591	NC_007384	ATAA	2	8	2139403	2139410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_007384	AATT	2	8	2139587	2139594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_007384	ACA	2	6	2139697	2139702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_007384	T	6	6	2139710	2139715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_007384	GTA	2	6	2139744	2139749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_007384	CAA	2	6	2139768	2139773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_007384	AATGC	2	10	2139816	2139825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8598	NC_007384	TCA	2	6	2139838	2139843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_007384	ACA	2	6	2139918	2139923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_007384	CGA	2	6	2140163	2140168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_007384	CGT	2	6	2140195	2140200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_007384	T	6	6	2140213	2140218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_007384	CCG	2	6	2140233	2140238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_007384	CGC	2	6	2140294	2140299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_007384	TCCG	2	8	2140329	2140336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8606	NC_007384	CGG	2	6	2140339	2140344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_007384	CGAC	2	8	2140366	2140373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_007384	GAT	2	6	2140408	2140413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_007384	TTC	2	6	2140440	2140445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_007384	GTG	2	6	2140465	2140470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_007384	CGG	2	6	2140519	2140524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_007384	GCG	2	6	2140538	2140543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_007384	A	6	6	2140574	2140579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_007384	ATG	2	6	2140658	2140663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_007384	TTCCT	2	10	2140701	2140710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8616	NC_007384	GTACTG	2	12	2140721	2140732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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8619	NC_007384	A	6	6	2140808	2140813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_007384	ATT	2	6	2140865	2140870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_007384	ATT	2	6	2140926	2140931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_007384	CG	3	6	2140953	2140958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_007384	CTTT	2	8	2141097	2141104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8624	NC_007384	TGC	2	6	2141119	2141124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_007384	ATG	2	6	2141144	2141149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_007384	CCT	2	6	2141194	2141199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_007384	GTG	2	6	2141217	2141222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_007384	TAT	2	6	2141934	2141939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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