MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_007384	AGG	2	6	2023571	2023576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_007384	TA	3	6	2023657	2023662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_007384	TA	3	6	2023667	2023672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_007384	TA	3	6	2023679	2023684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_007384	GA	3	6	2023702	2023707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_007384	TA	3	6	2023760	2023765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_007384	CTA	2	6	2023844	2023849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_007384	TTCA	2	8	2023918	2023925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_007384	GATCAG	2	12	2024013	2024024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8010	NC_007384	CAT	2	6	2024081	2024086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_007384	TCA	2	6	2025291	2025296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_007384	TCTG	2	8	2025305	2025312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_007384	TAA	2	6	2025336	2025341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_007384	TTG	2	6	2025389	2025394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_007384	AGGA	2	8	2025742	2025749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_007384	ATA	2	6	2025815	2025820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_007384	ATG	2	6	2025842	2025847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_007384	GCTC	2	8	2025889	2025896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_007384	CTA	2	6	2025927	2025932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_007384	ATGT	2	8	2025957	2025964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_007384	TGTT	2	8	2027365	2027372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_007384	ACT	2	6	2027506	2027511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_007384	ACCCCC	2	12	2027538	2027549	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
8024	NC_007384	T	6	6	2035110	2035115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_007384	CTG	2	6	2035195	2035200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_007384	TTTA	2	8	2035238	2035245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_007384	ATT	2	6	2035307	2035312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_007384	ATT	2	6	2035338	2035343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_007384	AACA	2	8	2035484	2035491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_007384	TCAAT	2	10	2035496	2035505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8031	NC_007384	AGT	2	6	2035553	2035558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_007384	AAT	2	6	2035568	2035573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_007384	ATT	3	9	2035584	2035592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_007384	ATT	2	6	2035640	2035645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_007384	ATG	2	6	2035665	2035670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_007384	ATG	2	6	2035684	2035689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_007384	GAG	2	6	2035692	2035697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_007384	TAAC	2	8	2035719	2035726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_007384	GAA	2	6	2035737	2035742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_007384	CTTTTG	2	12	2035758	2035769	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8041	NC_007384	AAT	2	6	2035794	2035799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_007384	CCT	2	6	2036584	2036589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_007384	ACT	2	6	2036591	2036596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_007384	CCA	2	6	2036652	2036657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_007384	TAC	2	6	2036663	2036668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_007384	TTA	2	6	2036672	2036677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_007384	ATTTG	2	10	2036731	2036740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_007384	ATA	2	6	2036807	2036812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_007384	AGTG	2	8	2036845	2036852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_007384	ATC	2	6	2036892	2036897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_007384	GAT	2	6	2036929	2036934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_007384	A	6	6	2036940	2036945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_007384	T	7	7	2041128	2041134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_007384	TCA	2	6	2041178	2041183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_007384	CGA	2	6	2041190	2041195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_007384	GCG	2	6	2041278	2041283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_007384	A	6	6	2041286	2041291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_007384	TA	3	6	2041305	2041310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_007384	GAA	2	6	2041316	2041321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_007384	ACT	2	6	2042179	2042184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_007384	TCA	2	6	2042293	2042298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_007384	AGA	2	6	2042337	2042342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_007384	GTC	2	6	2042350	2042355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_007384	TGC	2	6	2042413	2042418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_007384	ATC	2	6	2042422	2042427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_007384	GGC	2	6	2042488	2042493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_007384	TAT	2	6	2042559	2042564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_007384	CAA	2	6	2042570	2042575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_007384	ACC	2	6	2042576	2042581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_007384	TAC	2	6	2042600	2042605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_007384	GCG	2	6	2043056	2043061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_007384	T	6	6	2043065	2043070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_007384	TAA	2	6	2043092	2043097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_007384	A	7	7	2043109	2043115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_007384	AGG	2	6	2044167	2044172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_007384	CGA	2	6	2044211	2044216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_007384	ACC	2	6	2044221	2044226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_007384	TC	3	6	2045290	2045295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_007384	ATT	2	6	2046390	2046395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_007384	ACGGT	2	10	2046862	2046871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8081	NC_007384	CAA	2	6	2046886	2046891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_007384	GCG	2	6	2047835	2047840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_007384	ATG	2	6	2047852	2047857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_007384	GTG	2	6	2047905	2047910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_007384	CAC	2	6	2047984	2047989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_007384	GA	3	6	2048098	2048103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_007384	GC	3	6	2048136	2048141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_007384	CAC	2	6	2048163	2048168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_007384	AAT	2	6	2048182	2048187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_007384	CAC	2	6	2048224	2048229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_007384	TCC	2	6	2048249	2048254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_007384	AAGCG	2	10	2048269	2048278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8093	NC_007384	A	7	7	2048310	2048316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_007384	CCG	2	6	2048319	2048324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_007384	CCA	2	6	2055182	2055187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_007384	ATA	2	6	2055327	2055332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_007384	TGT	2	6	2055339	2055344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_007384	A	7	7	2055360	2055366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_007384	CAT	2	6	2055373	2055378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_007384	GATAA	2	10	2056876	2056885	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_007384	GAAG	2	8	2057123	2057130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_007384	CAT	2	6	2060850	2060855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_007384	TTA	2	6	2060858	2060863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_007384	GCC	2	6	2060921	2060926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_007384	TAAA	2	8	2060935	2060942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_007384	TAA	2	6	2060992	2060997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_007384	AGA	2	6	2061118	2061123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_007384	CAA	2	6	2062677	2062682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_007384	AAAC	2	8	2062741	2062748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_007384	A	6	6	2062789	2062794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_007384	CCTA	2	8	2062856	2062863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_007384	T	6	6	2062864	2062869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_007384	TCC	2	6	2064019	2064024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_007384	GATAA	2	10	2064044	2064053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_007384	TAC	2	6	2064078	2064083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_007384	TGAAG	2	10	2064194	2064203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_007384	GTA	2	6	2064216	2064221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_007384	TGG	2	6	2064277	2064282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_007384	ACA	2	6	2064333	2064338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_007384	GCC	2	6	2064378	2064383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_007384	TTG	2	6	2064384	2064389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_007384	ACA	2	6	2064395	2064400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_007384	GGC	2	6	2064402	2064407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_007384	GCA	2	6	2064453	2064458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_007384	ATT	2	6	2064474	2064479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_007384	TGG	2	6	2064498	2064503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_007384	CAT	2	6	2064646	2064651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_007384	TGAAG	2	10	2064727	2064736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_007384	CTAA	2	8	2117458	2117465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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