MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_007384	ATA	2	6	1933309	1933314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_007384	CCCG	2	8	1933347	1933354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7503	NC_007384	ATC	2	6	1933456	1933461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_007384	TCG	2	6	1933474	1933479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_007384	GGC	2	6	1933484	1933489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_007384	GGC	2	6	1933494	1933499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_007384	CGCCCT	2	12	1933529	1933540	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7508	NC_007384	AAT	2	6	1933554	1933559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_007384	GCTTC	2	10	1933571	1933580	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7510	NC_007384	AT	3	6	1933735	1933740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_007384	GAA	2	6	1933842	1933847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_007384	TGC	2	6	1933960	1933965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_007384	CCG	2	6	1933970	1933975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7514	NC_007384	GCG	2	6	1934023	1934028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_007384	GAA	2	6	1934088	1934093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_007384	GAC	2	6	1934132	1934137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_007384	TTG	2	6	1934152	1934157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_007384	CCG	2	6	1936876	1936881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7519	NC_007384	CAG	2	6	1936882	1936887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_007384	TAA	2	6	1936900	1936905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_007384	GAT	2	6	1936957	1936962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_007384	AT	3	6	1936999	1937004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_007384	T	6	6	1938538	1938543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_007384	GTT	2	6	1940057	1940062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_007384	GGC	2	6	1940140	1940145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_007384	GAT	2	6	1940188	1940193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_007384	GAT	2	6	1940197	1940202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_007384	GAGG	2	8	1940219	1940226	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_007384	CCT	2	6	1940240	1940245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7530	NC_007384	ACTG	2	8	1940249	1940256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7531	NC_007384	GCG	2	6	1941743	1941748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_007384	CCTG	2	8	1941755	1941762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_007384	CGCGC	2	10	1941770	1941779	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7534	NC_007384	ATC	2	6	1941821	1941826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_007384	CGC	2	6	1942162	1942167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7536	NC_007384	CTC	2	6	1942233	1942238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7537	NC_007384	GTT	2	6	1942244	1942249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_007384	AGTTAT	2	12	1942255	1942266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_007384	ACCA	2	8	1942320	1942327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7540	NC_007384	TCC	2	6	1947715	1947720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7541	NC_007384	CCGA	2	8	1948140	1948147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7542	NC_007384	TGT	2	6	1948158	1948163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_007384	TGTT	2	8	1948255	1948262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_007384	TAA	2	6	1948403	1948408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_007384	ACG	2	6	1948438	1948443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7547	NC_007384	CAA	2	6	1948474	1948479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_007384	GCG	2	6	1949305	1949310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_007384	GCC	2	6	1949315	1949320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7550	NC_007384	AAC	2	6	1949431	1949436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_007384	TGA	2	6	1949561	1949566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_007384	CCTT	2	8	1949581	1949588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_007384	GC	3	6	1949604	1949609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7554	NC_007384	GCG	2	6	1949713	1949718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_007384	ACT	2	6	1949734	1949739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7557	NC_007384	TCC	2	6	1949775	1949780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7558	NC_007384	TAT	2	6	1949846	1949851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_007384	TG	3	6	1949904	1949909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_007384	TGA	2	6	1950044	1950049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_007384	AGC	2	6	1950066	1950071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_007384	CAG	2	6	1950115	1950120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_007384	CT	4	8	1950144	1950151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7564	NC_007384	GTT	2	6	1950182	1950187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_007384	ATA	2	6	1950217	1950222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_007384	GCG	2	6	1950228	1950233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_007384	GC	3	6	1950241	1950246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_007384	GCC	2	6	1950273	1950278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7569	NC_007384	TCA	2	6	1950288	1950293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7571	NC_007384	GCC	2	6	1950428	1950433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_007384	ATC	2	6	1950463	1950468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7574	NC_007384	CTG	2	6	1950485	1950490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7576	NC_007384	CAGA	2	8	1950565	1950572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7579	NC_007384	T	6	6	1952629	1952634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_007384	AAAT	2	8	1952681	1952688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_007384	AT	3	6	1952687	1952692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_007384	A	7	7	1952693	1952699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_007384	GCC	2	6	1952711	1952716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7586	NC_007384	GGA	2	6	1952776	1952781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7595	NC_007384	AC	3	6	1953082	1953087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7598	NC_007384	T	6	6	1953315	1953320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_007384	CTGTTT	2	12	1953378	1953389	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7601	NC_007384	T	7	7	1953435	1953441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_007384	CGC	2	6	1953473	1953478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7603	NC_007384	ACG	2	6	1953636	1953641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7605	NC_007384	TTA	2	6	1953668	1953673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7609	NC_007384	GAAG	2	8	1953946	1953953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_007384	CTGG	2	8	1954015	1954022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7611	NC_007384	TGGCG	2	10	1954088	1954097	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7612	NC_007384	AG	3	6	1954390	1954395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_007384	ATG	2	6	1954410	1954415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_007384	CTGT	2	8	1954424	1954431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7615	NC_007384	CAA	2	6	1954436	1954441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_007384	GAT	2	6	1954472	1954477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_007384	GC	3	6	1954511	1954516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7618	NC_007384	CGAT	2	8	1954521	1954528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7619	NC_007384	AAC	2	6	1954569	1954574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_007384	TCG	2	6	1954602	1954607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7622	NC_007384	T	6	6	1954672	1954677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_007384	TTTG	2	8	1954711	1954718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_007384	CCG	2	6	1954731	1954736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7625	NC_007384	GC	3	6	1954771	1954776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7626	NC_007384	AT	4	8	1954789	1954796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_007384	TA	3	6	1954819	1954824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_007384	GAT	2	6	1954836	1954841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_007384	ATT	2	6	1954889	1954894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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