MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305

Total Repeats: 10629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_007350	ACA	2	6	2485543	2485548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_007350	TTA	2	6	2485560	2485565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_007350	CTT	2	6	2485610	2485615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_007350	AT	3	6	2485637	2485642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_007350	CAT	2	6	2485653	2485658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_007350	ATG	2	6	2485666	2485671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_007350	AT	3	6	2485694	2485699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_007350	AAAT	2	8	2485729	2485736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_007350	TCAA	2	8	2485762	2485769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10510	NC_007350	TA	3	6	2485827	2485832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_007350	A	6	6	2487756	2487761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_007350	A	6	6	2487766	2487771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_007350	GAT	2	6	2488866	2488871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_007350	TTTA	2	8	2488922	2488929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_007350	TA	3	6	2488986	2488991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_007350	GGGA	2	8	2489028	2489035	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_007350	ATCA	2	8	2489419	2489426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10518	NC_007350	AGA	2	6	2489442	2489447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_007350	ATTA	2	8	2489456	2489463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_007350	AGG	2	6	2489464	2489469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_007350	ATCATA	2	12	2490432	2490443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10522	NC_007350	AGTTGA	2	12	2490445	2490456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_007350	TTA	2	6	2490495	2490500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_007350	TATT	2	8	2490624	2490631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_007350	TAT	2	6	2495418	2495423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_007350	TTTA	2	8	2498627	2498634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_007350	ATGTAA	2	12	2498680	2498691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_007350	ATT	2	6	2498712	2498717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_007350	CAT	2	6	2498823	2498828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_007350	TCA	2	6	2498840	2498845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_007350	TTA	2	6	2498854	2498859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_007350	TGA	2	6	2498864	2498869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_007350	T	7	7	2498885	2498891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_007350	ATTAT	2	10	2498909	2498918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_007350	ATTA	2	8	2498941	2498948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_007350	T	6	6	2498949	2498954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_007350	TA	3	6	2498981	2498986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_007350	AGG	2	6	2499036	2499041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_007350	ATTG	2	8	2499481	2499488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_007350	TA	3	6	2499493	2499498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_007350	T	7	7	2499850	2499856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_007350	AT	3	6	2500684	2500689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_007350	TA	3	6	2500710	2500715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_007350	A	7	7	2500821	2500827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_007350	TAA	2	6	2500848	2500853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_007350	TAC	2	6	2500855	2500860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_007350	ATTTT	2	10	2500972	2500981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_007350	AAAC	2	8	2502441	2502448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10549	NC_007350	GAA	2	6	2502494	2502499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_007350	AT	3	6	2502524	2502529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_007350	CACC	2	8	2502551	2502558	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10552	NC_007350	T	7	7	2502573	2502579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_007350	TACT	2	8	2502631	2502638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_007350	T	6	6	2502638	2502643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_007350	ATA	2	6	2502661	2502666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_007350	ATA	2	6	2502676	2502681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_007350	T	6	6	2502702	2502707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_007350	ATG	2	6	2503582	2503587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_007350	T	6	6	2503649	2503654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_007350	CCTTG	2	10	2503668	2503677	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10561	NC_007350	GTAG	2	8	2503683	2503690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_007350	A	6	6	2503762	2503767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_007350	ATTC	2	8	2503774	2503781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10564	NC_007350	TAAT	2	8	2503784	2503791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_007350	TAA	2	6	2503816	2503821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_007350	TTTGA	2	10	2503826	2503835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_007350	T	6	6	2503860	2503865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_007350	ATTT	2	8	2503903	2503910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_007350	A	7	7	2503918	2503924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_007350	CCT	2	6	2504316	2504321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_007350	ATAA	2	8	2504495	2504502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_007350	TA	3	6	2504643	2504648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_007350	ATT	3	9	2504659	2504667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_007350	ACT	2	6	2504934	2504939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_007350	T	6	6	2504953	2504958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_007350	TATTTA	2	12	2504980	2504991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_007350	AAT	2	6	2505015	2505020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_007350	TCC	2	6	2505068	2505073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_007350	TAT	2	6	2505108	2505113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_007350	TAC	2	6	2505116	2505121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_007350	TAT	2	6	2506667	2506672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_007350	ATT	3	9	2506673	2506681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_007350	AAAT	2	8	2506698	2506705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_007350	A	6	6	2506716	2506721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_007350	ATA	2	6	2506735	2506740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_007350	TA	3	6	2506772	2506777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_007350	TA	3	6	2506802	2506807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_007350	CTA	2	6	2506811	2506816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_007350	ATATTT	2	12	2506837	2506848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_007350	ATG	2	6	2506879	2506884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_007350	T	6	6	2506956	2506961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_007350	CCT	2	6	2507087	2507092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10593	NC_007350	CCG	2	6	2507094	2507099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_007350	CGCC	2	8	2507107	2507114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10595	NC_007350	TAT	3	9	2507132	2507140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_007350	ACC	2	6	2507141	2507146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_007350	TAC	2	6	2507218	2507223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_007350	ATA	2	6	2507275	2507280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_007350	AAG	2	6	2507283	2507288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_007350	GTTGT	2	10	2507298	2507307	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_007350	CTT	2	6	2507312	2507317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_007350	AT	3	6	2507323	2507328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_007350	TATCT	2	10	2507367	2507376	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10604	NC_007350	CCT	2	6	2508146	2508151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10605	NC_007350	TTACG	2	10	2508173	2508182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10606	NC_007350	ATC	2	6	2508224	2508229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_007350	ATG	2	6	2508838	2508843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_007350	CAT	2	6	2508882	2508887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_007350	TGT	2	6	2508916	2508921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_007350	TAATA	2	10	2508996	2509005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_007350	T	6	6	2510544	2510549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_007350	TTA	2	6	2510581	2510586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_007350	TTAA	2	8	2510591	2510598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_007350	TA	4	8	2510607	2510614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_007350	A	6	6	2510622	2510627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_007350	AATT	2	8	2511530	2511537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_007350	TCC	2	6	2514157	2514162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10618	NC_007350	CCT	2	6	2515557	2515562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_007350	TCT	2	6	2515689	2515694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_007350	TCAC	2	8	2516059	2516066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_007350	ATTC	2	8	2516116	2516123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10622	NC_007350	TAG	2	6	2516139	2516144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_007350	A	8	8	2516185	2516192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_007350	TGA	2	6	2516199	2516204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_007350	TAT	2	6	2516387	2516392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_007350	TTA	2	6	2516440	2516445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_007350	AT	3	6	2516531	2516536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_007350	CAT	2	6	2516543	2516548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10629	NC_007350	TAT	2	6	2516559	2516564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.