MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 5987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007297	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007297	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007297	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007297	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007297	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007297	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007297	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007297	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007297	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007297	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007297	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007297	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007297	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007297	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007297	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007297	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007297	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007297	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007297	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007297	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007297	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007297	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007297	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007297	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007297	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007297	A	6	6	8829	8834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007297	A	6	6	14758	14763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007297	T	6	6	14789	14794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007297	T	7	7	14869	14875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007297	TTA	2	6	14878	14883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007297	AAT	2	6	14963	14968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007297	AGA	2	6	14969	14974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007297	AGA	2	6	14977	14982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007297	ACTA	2	8	15028	15035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007297	TAG	2	6	15045	15050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007297	ATA	2	6	16478	16483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007297	ACATT	2	10	16491	16500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007297	AGT	2	6	16528	16533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007297	TACT	2	8	16546	16553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007297	AT	3	6	16659	16664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007297	A	6	6	16678	16683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007297	A	7	7	16761	16767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007297	TAA	2	6	16800	16805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007297	AAAT	2	8	16989	16996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007297	AG	3	6	17040	17045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007297	GGC	2	6	17072	17077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007297	ACCT	2	8	17163	17170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007297	AG	3	6	17215	17220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007297	CGA	2	6	17317	17322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007297	GCA	2	6	17391	17396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007297	CGC	2	6	17438	17443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007297	GTGA	2	8	17444	17451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007297	TGT	2	6	17477	17482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007297	AGA	2	6	17486	17491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007297	ATG	2	6	17492	17497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007297	CCA	2	6	17513	17518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007297	TAAC	2	8	17527	17534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007297	CAG	2	6	17560	17565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007297	AGCG	2	8	17615	17622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007297	T	6	6	17630	17635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007297	AT	3	6	17744	17749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007297	GGA	2	6	17750	17755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007297	CT	3	6	17775	17780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007297	GAA	2	6	18014	18019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007297	GGT	2	6	18088	18093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007297	GTC	2	6	18102	18107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007297	TCGTG	2	10	18111	18120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007297	CAT	2	6	18170	18175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007297	TAA	2	6	18205	18210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007297	GGA	2	6	18214	18219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007297	ATC	2	6	18238	18243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007297	AC	3	6	18265	18270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007297	TGGT	2	8	18280	18287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007297	CGC	2	6	18404	18409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007297	AC	3	6	18434	18439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007297	CAC	2	6	18449	18454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007297	AGCC	2	8	18497	18504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007297	GAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007297	CCT	2	6	18576	18581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007297	AGG	2	6	18675	18680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007297	CTA	2	6	18721	18726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007297	TG	3	6	18789	18794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007297	AGCG	2	8	18843	18850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007297	TA	3	6	18864	18869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007297	TAA	2	6	18969	18974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007297	A	7	7	18987	18993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007297	TAA	2	6	19000	19005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007297	GTTAA	2	10	19007	19016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007297	GAA	2	6	19053	19058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007297	ACG	2	6	19070	19075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007297	GTAA	2	8	19093	19100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007297	ACTA	2	8	19135	19142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007297	GAAG	2	8	19175	19182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007297	TAG	2	6	19241	19246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007297	GCGA	2	8	19249	19256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007297	AGG	2	6	19263	19268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007297	AGA	2	6	19329	19334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007297	AG	3	6	19357	19362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007297	GGA	2	6	19445	19450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007297	CT	3	6	19471	19476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007297	GGGAG	2	10	19526	19535	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007297	ACA	2	6	19563	19568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007297	ATG	2	6	19630	19635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007297	TGT	2	6	19700	19705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007297	GGA	2	6	19763	19768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007297	TC	3	6	19849	19854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007297	ATC	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007297	ACC	2	6	20028	20033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007297	AGC	2	6	20108	20113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007297	ATTC	2	8	20115	20122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007297	TG	3	6	20239	20244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007297	AAG	2	6	20245	20250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007297	GAG	2	6	20260	20265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007297	GA	3	6	20390	20395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007297	TA	3	6	20444	20449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007297	CTAA	2	8	20471	20478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007297	TAG	2	6	20573	20578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007297	GA	3	6	20686	20691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007297	CT	3	6	20801	20806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007297	GAT	2	6	20819	20824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007297	AGG	2	6	20864	20869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007297	CGG	2	6	20910	20915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007297	GA	3	6	21008	21013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007297	TAGG	2	8	21126	21133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007297	GTT	2	6	21170	21175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007297	TAC	2	6	21180	21185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007297	CCT	2	6	21268	21273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007297	TTGG	2	8	21309	21316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007297	AATC	2	8	21318	21325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007297	GGT	2	6	21404	21409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007297	TCG	2	6	21519	21524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007297	CGT	2	6	21599	21604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007297	AGGGA	2	10	21737	21746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007297	C	6	6	21775	21780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_007297	GA	3	6	21823	21828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007297	AGTGTA	2	12	21850	21861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007297	ACTAAT	2	12	21878	21889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_007297	CAG	2	6	22040	22045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007297	GCTTA	2	10	22103	22112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007297	AC	3	6	22116	22121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007297	AGT	2	6	22297	22302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007297	T	6	6	22307	22312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007297	CGT	2	6	22637	22642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007297	GAG	2	6	22651	22656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007297	T	6	6	22745	22750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007297	CTC	2	6	22816	22821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_007297	AGA	2	6	22913	22918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007297	AAAT	2	8	22990	22997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007297	AG	3	6	23041	23046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007297	GGC	2	6	23073	23078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007297	ACCT	2	8	23164	23171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007297	AG	3	6	23216	23221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007297	CGA	2	6	23318	23323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007297	GCA	2	6	23392	23397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007297	CGC	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_007297	GTGA	2	8	23445	23452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007297	TGT	2	6	23478	23483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007297	AGA	2	6	23487	23492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007297	ATG	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007297	CCA	2	6	23514	23519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_007297	TAAC	2	8	23528	23535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_007297	CAG	2	6	23561	23566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_007297	GGA	2	6	23751	23756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_007297	GAA	2	6	24015	24020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_007297	CAT	2	6	24171	24176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_007297	TGGT	2	8	24281	24288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_007297	AC	3	6	24435	24440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_007297	CAC	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_007297	GAT	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_007297	CCT	2	6	24577	24582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_007297	TG	3	6	24790	24795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007297	AGCG	2	8	24844	24851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_007297	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007297	TAA	2	6	24970	24975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_007297	TAA	2	6	25001	25006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_007297	GTTAA	2	10	25008	25017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_007297	GAAG	2	8	25176	25183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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