MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 5987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007297	TAAA	2	8	221507	221514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007297	TTA	2	6	221545	221550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007297	CATA	2	8	221560	221567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_007297	TTTG	2	8	221623	221630	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007297	GAC	2	6	224275	224280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007297	AAC	2	6	224294	224299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_007297	CTAC	2	8	225177	225184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_007297	GTA	2	6	225267	225272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007297	A	6	6	225318	225323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007297	A	6	6	226839	226844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007297	AAAG	2	8	226871	226878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_007297	AGA	2	6	226890	226895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_007297	A	7	7	227796	227802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007297	GTTCA	2	10	227827	227836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_007297	T	7	7	227890	227896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_007297	A	7	7	227907	227913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007297	TCT	2	6	227977	227982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_007297	A	6	6	228008	228013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007297	TCA	2	6	228014	228019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007297	ATA	2	6	228162	228167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007297	TTA	2	6	228171	228176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007297	TAG	2	6	228177	228182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_007297	TGA	2	6	232604	232609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007297	ATG	2	6	232631	232636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007297	TTA	2	6	232668	232673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_007297	TAA	2	6	232738	232743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007297	A	7	7	232748	232754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_007297	TTA	2	6	236350	236355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_007297	TC	3	6	236382	236387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_007297	TTG	2	6	236414	236419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_007297	A	7	7	236472	236478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007297	CAAA	2	8	237417	237424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_007297	TAT	2	6	237474	237479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_007297	TAA	2	6	237513	237518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_007297	GAA	2	6	237564	237569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_007297	CA	3	6	237600	237605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_007297	TAT	2	6	237659	237664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007297	CAA	2	6	237671	237676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1042	NC_007297	A	6	6	239968	239973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007297	TGG	2	6	239993	239998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_007297	GTT	2	6	240094	240099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_007297	TAGG	2	8	240130	240137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007297	ATA	2	6	240153	240158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007297	AGG	2	6	240176	240181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_007297	TAA	2	6	241337	241342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_007297	T	7	7	241384	241390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_007297	AAT	2	6	244093	244098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1063	NC_007297	TAA	2	6	246133	246138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007297	GAG	2	6	247058	247063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007297	TAA	2	6	247100	247105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007297	TTCA	2	8	247906	247913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_007297	TA	3	6	250013	250018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_007297	AAAG	2	8	251333	251340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007297	GTA	2	6	254507	254512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_007297	GTCA	2	8	255919	255926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1074	NC_007297	T	7	7	257214	257220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007297	AGT	2	6	257265	257270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_007297	TTA	2	6	257308	257313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_007297	A	6	6	257333	257338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007297	TCATT	2	10	257409	257418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_007297	A	6	6	257483	257488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_007297	TTGTA	2	10	264032	264041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_007297	TTG	2	6	264080	264085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_007297	TGG	2	6	264499	264504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_007297	TAG	2	6	264506	264511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_007297	T	6	6	264632	264637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_007297	A	6	6	264668	264673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007297	A	7	7	264678	264684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_007297	A	7	7	264687	264693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_007297	TAA	2	6	264726	264731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007297	AAAT	2	8	264915	264922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_007297	GGC	2	6	264998	265003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_007297	ACCT	2	8	265089	265096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_007297	AG	3	6	265141	265146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_007297	CGA	2	6	265243	265248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007297	GCA	2	6	265317	265322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007297	CGC	2	6	265364	265369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_007297	GTGA	2	8	265370	265377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_007297	TGT	2	6	265403	265408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_007297	AGA	2	6	265412	265417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_007297	ATG	2	6	265418	265423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_007297	CCA	2	6	265439	265444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_007297	TAAC	2	8	265453	265460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_007297	CAG	2	6	265486	265491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_007297	AGCG	2	8	265541	265548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_007297	T	6	6	265556	265561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_007297	AT	3	6	265670	265675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_007297	GGA	2	6	265676	265681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_007297	CT	3	6	265701	265706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_007297	GAA	2	6	265940	265945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_007297	TCGTG	2	10	266037	266046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_007297	CAT	2	6	266096	266101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1129	NC_007297	GGA	2	6	266140	266145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_007297	ATC	2	6	266164	266169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_007297	AC	3	6	266191	266196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_007297	TGGT	2	8	266206	266213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_007297	CGC	2	6	266330	266335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_007297	AC	3	6	266360	266365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_007297	CAC	2	6	266375	266380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_007297	AGCC	2	8	266423	266430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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