MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 6133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007296	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007296	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007296	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007296	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007296	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007296	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007296	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007296	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007296	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007296	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007296	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007296	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007296	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007296	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007296	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007296	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007296	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007296	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007296	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007296	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007296	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007296	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007296	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007296	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007296	A	6	6	8829	8834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007296	A	6	6	14758	14763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007296	T	6	6	14789	14794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007296	T	8	8	14869	14876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007296	TTA	2	6	14879	14884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007296	A	6	6	14940	14945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007296	AAT	2	6	14965	14970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007296	AGA	2	6	14971	14976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007296	AGA	2	6	14979	14984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007296	ATA	2	6	16480	16485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007296	ACATT	2	10	16493	16502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007296	AGT	2	6	16530	16535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007296	TACT	2	8	16548	16555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007296	GATA	2	8	16665	16672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007296	A	6	6	16681	16686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007296	A	7	7	16764	16770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007296	TAA	2	6	16803	16808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007296	AAAT	2	8	16992	16999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007296	AG	3	6	17043	17048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007296	GGC	2	6	17075	17080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007296	ACCT	2	8	17166	17173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007296	AG	3	6	17218	17223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007296	CGA	2	6	17320	17325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007296	GCA	2	6	17394	17399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007296	CGC	2	6	17441	17446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007296	GTGA	2	8	17447	17454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007296	TGT	2	6	17480	17485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007296	AGA	2	6	17489	17494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007296	ATG	2	6	17495	17500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007296	CCA	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007296	TAAC	2	8	17530	17537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007296	CAG	2	6	17563	17568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007296	AGCG	2	8	17618	17625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007296	T	6	6	17633	17638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007296	AT	3	6	17747	17752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007296	GGA	2	6	17753	17758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007296	CT	3	6	17778	17783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007296	GAA	2	6	18017	18022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007296	GGT	2	6	18091	18096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007296	GTC	2	6	18105	18110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007296	TCGTG	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007296	CAT	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007296	TAA	2	6	18208	18213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007296	GGA	2	6	18217	18222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007296	ATC	2	6	18241	18246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007296	AC	3	6	18268	18273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007296	TGGT	2	8	18283	18290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007296	CGC	2	6	18407	18412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007296	AC	3	6	18437	18442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007296	CAC	2	6	18452	18457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007296	AGCC	2	8	18500	18507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007296	GAT	2	6	18523	18528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007296	CCT	2	6	18579	18584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007296	AGG	2	6	18678	18683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007296	CTA	2	6	18724	18729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007296	TG	3	6	18792	18797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007296	AGCG	2	8	18846	18853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007296	TA	3	6	18867	18872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007296	TAA	2	6	18972	18977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007296	A	7	7	18990	18996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007296	TAA	2	6	19003	19008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007296	GTTAA	2	10	19010	19019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007296	GAA	2	6	19056	19061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007296	ACG	2	6	19073	19078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007296	GTAA	2	8	19096	19103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007296	ACTA	2	8	19138	19145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007296	GAAG	2	8	19178	19185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007296	TAG	2	6	19244	19249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007296	GCGA	2	8	19252	19259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007296	AGG	2	6	19266	19271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007296	AGA	2	6	19332	19337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007296	AG	3	6	19360	19365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007296	GGA	2	6	19448	19453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007296	CT	3	6	19474	19479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007296	GGGAG	2	10	19529	19538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007296	ACA	2	6	19566	19571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007296	ATG	2	6	19633	19638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007296	TGT	2	6	19703	19708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007296	GGA	2	6	19766	19771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007296	TC	3	6	19852	19857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007296	ATC	2	6	19973	19978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007296	ACC	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007296	AGC	2	6	20111	20116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007296	ATTC	2	8	20118	20125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007296	TG	3	6	20242	20247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007296	AAG	2	6	20248	20253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007296	GAG	2	6	20263	20268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007296	GA	3	6	20393	20398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007296	TA	3	6	20447	20452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007296	CTAA	2	8	20474	20481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007296	TAG	2	6	20576	20581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007296	GA	3	6	20689	20694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007296	CT	3	6	20804	20809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007296	GAT	2	6	20822	20827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007296	AGG	2	6	20867	20872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007296	CGG	2	6	20913	20918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007296	GA	3	6	21011	21016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007296	TAGG	2	8	21129	21136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007296	GTT	2	6	21173	21178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007296	TAC	2	6	21183	21188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007296	CCT	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007296	TTGG	2	8	21312	21319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007296	AATC	2	8	21321	21328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007296	GGT	2	6	21407	21412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007296	TCG	2	6	21522	21527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007296	CGT	2	6	21602	21607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007296	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007296	C	6	6	21778	21783	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_007296	GA	3	6	21826	21831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007296	AGTGTA	2	12	21853	21864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007296	ACTAAT	2	12	21881	21892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007296	CAG	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007296	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007296	AC	3	6	22119	22124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007296	AGT	2	6	22300	22305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007296	T	6	6	22310	22315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007296	CGT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007296	GAG	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007296	T	6	6	22748	22753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007296	CTC	2	6	22819	22824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007296	AGA	2	6	22916	22921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007296	AAAT	2	8	22993	23000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007296	AG	3	6	23044	23049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007296	GGC	2	6	23076	23081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007296	ACCT	2	8	23167	23174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007296	AG	3	6	23219	23224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007296	CGA	2	6	23321	23326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007296	GCA	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007296	CGC	2	6	23442	23447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_007296	GTGA	2	8	23448	23455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007296	TGT	2	6	23481	23486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_007296	CCA	2	6	23517	23522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_007296	T	6	6	23634	23639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_007296	GGA	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_007296	TAA	2	6	24209	24214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_007296	CGC	2	6	24408	24413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_007296	CAC	2	6	24453	24458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_007296	AGCG	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_007296	TA	3	6	24868	24873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_007296	TAA	2	6	24973	24978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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