MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 9993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	AGC	2	6	2	7	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007168	T	7	7	26	32	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007168	CATT	2	8	46	53	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007168	TCA	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007168	ATT	2	6	123	128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007168	TGT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007168	AGTT	2	8	153	160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007168	T	6	6	159	164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007168	ATA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007168	ATT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007168	AAC	2	6	245	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007168	TC	3	6	271	276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007168	GTC	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007168	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007168	ATTT	2	8	332	339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007168	TA	3	6	348	353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007168	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007168	TTA	2	6	404	409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007168	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007168	ATT	2	6	438	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007168	AGA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007168	ACA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007168	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007168	AAG	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007168	AAT	2	6	1952	1957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007168	CTA	3	9	2096	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007168	TA	3	6	2124	2129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007168	TA	4	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007168	ACG	2	6	3323	3328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007168	TTTAAA	2	12	3358	3369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007168	ATA	2	6	3424	3429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007168	ATC	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007168	TTAAAA	2	12	3452	3463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007168	CTA	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007168	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007168	AT	3	6	3639	3644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007168	ATT	2	6	3670	3675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007168	AGG	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007168	AAT	2	6	9780	9785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007168	ACA	2	6	9794	9799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007168	CAA	2	6	9813	9818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007168	TCT	2	6	10633	10638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007168	TGT	2	6	10659	10664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007168	CCCT	2	8	10685	10692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_007168	TA	4	8	10749	10756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007168	AACT	2	8	10802	10809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007168	TGTT	2	8	10834	10841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007168	TAT	2	6	10900	10905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007168	ATT	2	6	10910	10915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007168	AATG	2	8	10920	10927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007168	ATT	2	6	10983	10988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007168	TAA	2	6	11038	11043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007168	AATT	2	8	11074	11081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007168	AG	3	6	11084	11089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007168	ATTG	2	8	11113	11120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007168	CTAC	2	8	11131	11138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007168	AAC	2	6	11146	11151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007168	TAA	2	6	11155	11160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007168	T	7	7	11262	11268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007168	AAATT	2	10	11292	11301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007168	TTAG	2	8	12622	12629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007168	AAG	2	6	12631	12636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007168	AAAT	2	8	12646	12653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007168	GTA	2	6	12678	12683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007168	T	7	7	12726	12732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007168	AT	3	6	12755	12760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007168	TAA	2	6	12793	12798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007168	TAA	2	6	12826	12831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007168	A	6	6	12895	12900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007168	AGT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007168	CA	3	6	12959	12964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007168	TGT	2	6	12978	12983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007168	TAA	2	6	13041	13046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007168	AGG	2	6	13053	13058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007168	CAA	2	6	14102	14107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007168	ATAAA	2	10	14137	14146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007168	A	6	6	14209	14214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007168	TTA	2	6	14216	14221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007168	CTA	2	6	14283	14288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007168	TAA	2	6	14339	14344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007168	T	6	6	14359	14364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007168	AGG	2	6	14372	14377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007168	T	6	6	18865	18870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007168	ACT	2	6	18887	18892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007168	AAT	2	6	18974	18979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007168	TGTTT	2	10	20499	20508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007168	TAAA	2	8	20548	20555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007168	TAT	2	6	20572	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007168	GAA	2	6	22019	22024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007168	TTG	2	6	22110	22115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007168	CAT	2	6	22280	22285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007168	T	9	9	22318	22326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007168	TTA	2	6	22384	22389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007168	A	6	6	22402	22407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007168	A	7	7	22420	22426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007168	A	6	6	22441	22446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007168	TGTCT	2	10	22447	22456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007168	ATCT	2	8	22479	22486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007168	CGG	2	6	22537	22542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007168	GCCT	2	8	22606	22613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007168	T	7	7	22679	22685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007168	TAC	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007168	A	6	6	22745	22750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007168	A	6	6	22753	22758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007168	ATT	2	6	22831	22836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007168	CTA	2	6	22861	22866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007168	ATC	2	6	22881	22886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007168	TAA	2	6	22893	22898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007168	ATT	2	6	22993	22998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007168	TA	3	6	23048	23053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007168	TTA	2	6	23077	23082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007168	AAT	2	6	23130	23135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007168	GAA	2	6	27837	27842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007168	ATG	2	6	27988	27993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007168	T	7	7	28013	28019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007168	ACGA	2	8	28906	28913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007168	GTT	2	6	28944	28949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007168	T	7	7	28948	28954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007168	TAA	2	6	28974	28979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007168	ATT	2	6	28995	29000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007168	TAA	2	6	29015	29020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007168	AATA	2	8	29043	29050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007168	ACTT	2	8	29057	29064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007168	TGAA	2	8	29082	29089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007168	AC	3	6	29112	29117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007168	ATT	2	6	29130	29135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007168	AT	3	6	29151	29156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007168	T	6	6	29185	29190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007168	GGA	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007168	A	6	6	29786	29791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007168	TATAA	2	10	29801	29810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007168	AAGG	2	8	29811	29818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007168	AAG	2	6	30026	30031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007168	AGG	2	6	30042	30047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007168	ATT	2	6	30052	30057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007168	A	7	7	30087	30093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007168	AGA	2	6	30807	30812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007168	ATTA	2	8	31859	31866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007168	TATTT	2	10	31903	31912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007168	AT	4	8	31954	31961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007168	CTTT	2	8	32036	32043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007168	T	7	7	32058	32064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007168	A	6	6	32218	32223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007168	TA	3	6	32230	32235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007168	TAA	2	6	32274	32279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007168	GCT	2	6	32296	32301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007168	TTG	2	6	32340	32345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007168	ATT	3	9	32352	32360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007168	GAT	2	6	32650	32655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007168	TAC	2	6	32708	32713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007168	TTA	2	6	32715	32720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007168	AT	3	6	32721	32726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007168	T	8	8	32726	32733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007168	A	6	6	32804	32809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007168	TGA	2	6	32998	33003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007168	CTTT	2	8	34347	34354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_007168	T	6	6	34352	34357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007168	TTTG	2	8	34360	34367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007168	TAA	2	6	34373	34378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_007168	T	6	6	34433	34438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007168	TCA	2	6	34441	34446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_007168	AAT	2	6	34666	34671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_007168	AAG	2	6	34774	34779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_007168	GTTA	2	8	34843	34850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_007168	A	7	7	116943	116949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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