MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006905	ATA	2	6	1138488	1138493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_006905	TTATT	2	10	1139055	1139064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_006905	T	6	6	1140878	1140883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_006905	TGT	2	6	1140888	1140893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_006905	G	6	6	1140898	1140903	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_006905	TTCTT	2	10	1140988	1140997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4007	NC_006905	A	6	6	1141007	1141012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_006905	A	6	6	1141539	1141544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_006905	T	6	6	1141560	1141565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_006905	ATC	2	6	1142647	1142652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_006905	A	7	7	1142823	1142829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_006905	CAT	2	6	1142845	1142850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_006905	GAT	2	6	1142863	1142868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_006905	A	8	8	1142918	1142925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_006905	A	8	8	1142956	1142963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_006905	AATC	2	8	1143498	1143505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_006905	AAAAAT	2	12	1143608	1143619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_006905	T	7	7	1146973	1146979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_006905	GCGG	2	8	1149106	1149113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_006905	CCCG	2	8	1149122	1149129	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4021	NC_006905	TGC	2	6	1149645	1149650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_006905	A	7	7	1149662	1149668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_006905	GC	3	6	1149671	1149676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_006905	TAA	2	6	1150383	1150388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_006905	TTC	2	6	1152731	1152736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_006905	GAA	2	6	1152771	1152776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4028	NC_006905	ACGG	2	8	1154818	1154825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_006905	A	6	6	1154835	1154840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_006905	CT	3	6	1155548	1155553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_006905	TAAT	2	8	1155565	1155572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_006905	AAT	2	6	1155580	1155585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_006905	CGTTTA	2	12	1155632	1155643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4037	NC_006905	GAA	2	6	1155815	1155820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_006905	TGC	2	6	1155831	1155836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_006905	T	6	6	1156060	1156065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_006905	A	6	6	1156111	1156116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_006905	CTT	2	6	1156843	1156848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_006905	ATT	2	6	1156870	1156875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_006905	AAT	2	6	1156886	1156891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_006905	CAA	2	6	1156945	1156950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_006905	TTAT	2	8	1156968	1156975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_006905	TTTA	2	8	1156996	1157003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_006905	CTT	2	6	1157032	1157037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_006905	CTT	2	6	1157946	1157951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_006905	AGTCA	2	10	1157982	1157991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_006905	AAT	2	6	1158005	1158010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_006905	A	7	7	1158011	1158017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_006905	TGAGTA	2	12	1158052	1158063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_006905	GAT	2	6	1158088	1158093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_006905	AAT	2	6	1158133	1158138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4056	NC_006905	CAA	2	6	1163785	1163790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_006905	AT	3	6	1163839	1163844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_006905	CGC	2	6	1164370	1164375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4062	NC_006905	TGG	2	6	1164483	1164488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_006905	CGC	2	6	1164513	1164518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4071	NC_006905	CGG	2	6	1166906	1166911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_006905	ATT	2	6	1167391	1167396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_006905	TTTA	2	8	1167474	1167481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_006905	AT	3	6	1167596	1167601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_006905	AGCGC	2	10	1173392	1173401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4100	NC_006905	TGT	2	6	1177720	1177725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_006905	TTAT	2	8	1177731	1177738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_006905	AG	3	6	1177809	1177814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_006905	GC	3	6	1179485	1179490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_006905	A	6	6	1179973	1179978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_006905	ATG	2	6	1179980	1179985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_006905	CGGC	2	8	1180054	1180061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_006905	GC	4	8	1180177	1180184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_006905	CAC	2	6	1180285	1180290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4119	NC_006905	GCA	2	6	1180380	1180385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4127	NC_006905	TTAAT	2	10	1180851	1180860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_006905	A	6	6	1180917	1180922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_006905	TTG	2	6	1201759	1201764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_006905	AAAG	2	8	1201880	1201887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_006905	ACACC	2	10	1201933	1201942	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4267	NC_006905	CAATC	2	10	1202141	1202150	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4268	NC_006905	A	6	6	1202192	1202197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_006905	CAC	2	6	1202223	1202228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4270	NC_006905	AACT	2	8	1202279	1202286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4271	NC_006905	AAC	2	6	1202311	1202316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4272	NC_006905	GAA	2	6	1202349	1202354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4277	NC_006905	TC	3	6	1202690	1202695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4278	NC_006905	AGCG	2	8	1202703	1202710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4282	NC_006905	T	7	7	1202799	1202805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_006905	GAA	2	6	1202872	1202877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_006905	TATT	2	8	1202984	1202991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_006905	GTTCT	2	10	1202992	1203001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4286	NC_006905	CGG	3	9	1203095	1203103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4292	NC_006905	ACT	2	6	1203320	1203325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4297	NC_006905	TTG	2	6	1203455	1203460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4303	NC_006905	GCGCT	2	10	1204711	1204720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4304	NC_006905	GCC	2	6	1204753	1204758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4333	NC_006905	A	8	8	1210882	1210889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4334	NC_006905	GT	3	6	1210894	1210899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4363	NC_006905	GGATC	2	10	1216407	1216416	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4385	NC_006905	TTCA	2	8	1228128	1228135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4387	NC_006905	TGT	2	6	1228149	1228154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_006905	ATT	2	6	1228158	1228163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4391	NC_006905	ACAT	2	8	1228225	1228232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4392	NC_006905	AT	4	8	1228520	1228527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_006905	AT	3	6	1228541	1228546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_006905	TAA	2	6	1229615	1229620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_006905	A	7	7	1229688	1229694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_006905	GC	3	6	1229703	1229708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4397	NC_006905	AGC	2	6	1230321	1230326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_006905	GGC	2	6	1230371	1230376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4399	NC_006905	GCC	2	6	1230388	1230393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4400	NC_006905	TCC	2	6	1231056	1231061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4401	NC_006905	GGA	2	6	1231089	1231094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_006905	TCT	2	6	1232352	1232357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4403	NC_006905	GCG	3	9	1232363	1232371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_006905	T	6	6	1232377	1232382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_006905	T	7	7	1232404	1232410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_006905	TCA	2	6	1232439	1232444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4407	NC_006905	GCA	2	6	1232452	1232457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4409	NC_006905	AGGA	2	8	1232540	1232547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_006905	CCG	2	6	1233904	1233909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4411	NC_006905	CTT	2	6	1234074	1234079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4412	NC_006905	TGG	2	6	1234144	1234149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4413	NC_006905	GGC	2	6	1234154	1234159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4414	NC_006905	A	9	9	1234162	1234170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_006905	CGC	2	6	1234205	1234210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4418	NC_006905	GCG	2	6	1234358	1234363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4419	NC_006905	GC	3	6	1234366	1234371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4420	NC_006905	CAT	2	6	1234426	1234431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4422	NC_006905	ACC	2	6	1234456	1234461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4423	NC_006905	CGG	2	6	1234515	1234520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4424	NC_006905	TGACG	2	10	1234527	1234536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4425	NC_006905	TCA	2	6	1234577	1234582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4426	NC_006905	ACG	2	6	1234603	1234608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4427	NC_006905	GC	3	6	1234634	1234639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4428	NC_006905	CGG	2	6	1234682	1234687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4429	NC_006905	CGT	2	6	1234713	1234718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4430	NC_006905	GTA	2	6	1234772	1234777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4431	NC_006905	AAT	2	6	1234807	1234812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_006905	TA	3	6	1234860	1234865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_006905	AAT	2	6	1234899	1234904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_006905	GCTG	2	8	1235073	1235080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4435	NC_006905	CAT	2	6	1237436	1237441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4436	NC_006905	AAGC	2	8	1238190	1238197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4437	NC_006905	AATA	2	8	1238206	1238213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_006905	CG	4	8	1238245	1238252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4439	NC_006905	GGA	2	6	1238292	1238297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4440	NC_006905	AGG	2	6	1239126	1239131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4441	NC_006905	AGTC	2	8	1239854	1239861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4442	NC_006905	GCC	2	6	1242649	1242654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4443	NC_006905	AAC	2	6	1245488	1245493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4444	NC_006905	T	7	7	1248156	1248162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_006905	T	7	7	1248224	1248230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4446	NC_006905	GTC	2	6	1248232	1248237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4447	NC_006905	CGTA	2	8	1248281	1248288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4448	NC_006905	A	6	6	1248366	1248371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4449	NC_006905	ATT	2	6	1251627	1251632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4450	NC_006905	GAC	2	6	1251641	1251646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4451	NC_006905	T	6	6	1252049	1252054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4452	NC_006905	TAA	2	6	1252077	1252082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4453	NC_006905	TG	3	6	1252147	1252152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4454	NC_006905	C	6	6	1252182	1252187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4455	NC_006905	CT	3	6	1253151	1253156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4456	NC_006905	ATA	2	6	1253191	1253196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4457	NC_006905	TTTTG	2	10	1253198	1253207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4458	NC_006905	GTT	2	6	1254157	1254162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4459	NC_006905	ACTGA	2	10	1254241	1254250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4463	NC_006905	ATT	2	6	1255256	1255261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4464	NC_006905	GC	3	6	1255322	1255327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4465	NC_006905	GAG	2	6	1255890	1255895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4467	NC_006905	CGA	2	6	1256201	1256206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4469	NC_006905	TA	3	6	1257342	1257347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4470	NC_006905	TTA	2	6	1260038	1260043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4471	NC_006905	TCCC	2	8	1260473	1260480	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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4477	NC_006905	TACAA	2	10	1262303	1262312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4478	NC_006905	TAA	2	6	1262317	1262322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4479	NC_006905	CAT	2	6	1262333	1262338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4481	NC_006905	GCC	2	6	1262373	1262378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4482	NC_006905	CTG	2	6	1262411	1262416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4484	NC_006905	TAAT	2	8	1267468	1267475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_006905	CAAA	2	8	1267602	1267609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4486	NC_006905	TATT	2	8	1267618	1267625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_006905	TGTCC	2	10	1267659	1267668	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4490	NC_006905	ATG	2	6	1269182	1269187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4495	NC_006905	T	7	7	1275618	1275624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_006905	TTG	2	6	1275748	1275753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_006905	TTAA	2	8	1275754	1275761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_006905	TTAA	2	8	1275780	1275787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_006905	A	6	6	1275832	1275837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_006905	GCT	2	6	1277141	1277146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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