MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006905	GCG	2	6	1055358	1055363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_006905	CAT	2	6	1055382	1055387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_006905	GTA	2	6	1055389	1055394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_006905	CGT	4	12	1055398	1055409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_006905	GCG	2	6	1055439	1055444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_006905	GGC	2	6	1055473	1055478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_006905	CCA	2	6	1055540	1055545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_006905	ATC	2	6	1055623	1055628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_006905	CAA	2	6	1055676	1055681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_006905	T	6	6	1055689	1055694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_006905	TGA	2	6	1058441	1058446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_006905	TCA	2	6	1060751	1060756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_006905	GGC	2	6	1060759	1060764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_006905	TTTTC	2	10	1060793	1060802	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_006905	ACG	2	6	1060837	1060842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_006905	ATT	2	6	1060846	1060851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_006905	AGT	2	6	1060854	1060859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_006905	T	6	6	1062546	1062551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_006905	GGA	2	6	1062563	1062568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_006905	AGCC	2	8	1062647	1062654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_006905	TCGC	2	8	1065491	1065498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_006905	T	7	7	1065521	1065527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_006905	ACG	2	6	1065558	1065563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_006905	ACG	2	6	1065594	1065599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_006905	GGC	2	6	1065602	1065607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_006905	CCA	2	6	1065673	1065678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_006905	CG	3	6	1065685	1065690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_006905	GGCG	2	8	1065716	1065723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_006905	GTG	2	6	1065768	1065773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_006905	GCGT	2	8	1065778	1065785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_006905	GCA	2	6	1065788	1065793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_006905	AACG	2	8	1065891	1065898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_006905	GC	3	6	1065903	1065908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_006905	GCTGA	2	10	1065921	1065930	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3535	NC_006905	ATC	2	6	1066017	1066022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_006905	CGT	2	6	1066026	1066031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_006905	GTA	2	6	1066051	1066056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_006905	CGG	2	6	1066088	1066093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_006905	ATT	2	6	1066126	1066131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_006905	GCG	2	6	1066147	1066152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_006905	GCG	2	6	1066179	1066184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_006905	GGC	2	6	1066280	1066285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_006905	GGCGTT	2	12	1066331	1066342	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3544	NC_006905	GGC	2	6	1066376	1066381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_006905	GGC	2	6	1066463	1066468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_006905	CAG	2	6	1066506	1066511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_006905	A	6	6	1066513	1066518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_006905	GTG	2	6	1066578	1066583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_006905	GCC	2	6	1066590	1066595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_006905	GCC	2	6	1066629	1066634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_006905	CAG	2	6	1066677	1066682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_006905	CG	4	8	1066702	1066709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_006905	GCC	2	6	1066788	1066793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_006905	CTG	2	6	1066842	1066847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_006905	A	6	6	1066858	1066863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_006905	TGG	2	6	1066912	1066917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_006905	GC	3	6	1066962	1066967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_006905	AGC	2	6	1067062	1067067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_006905	CTG	2	6	1067082	1067087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_006905	GTC	2	6	1067189	1067194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_006905	AGC	2	6	1067235	1067240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_006905	GCG	2	6	1067266	1067271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_006905	CTGG	2	8	1067281	1067288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_006905	GCG	2	6	1067325	1067330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_006905	CCAG	2	8	1067343	1067350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_006905	CGA	2	6	1067410	1067415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_006905	GC	3	6	1067421	1067426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_006905	TGA	2	6	1067440	1067445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_006905	AGCC	2	8	1067462	1067469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_006905	GCG	2	6	1067472	1067477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_006905	CTG	2	6	1067525	1067530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_006905	GAT	2	6	1067543	1067548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_006905	TCG	2	6	1067607	1067612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_006905	TGA	2	6	1067704	1067709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_006905	GGT	2	6	1067743	1067748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_006905	CG	3	6	1067810	1067815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_006905	GC	3	6	1067816	1067821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_006905	GCGTC	2	10	1068001	1068010	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3579	NC_006905	GC	4	8	1068019	1068026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_006905	CAG	3	9	1068050	1068058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_006905	TGC	2	6	1068108	1068113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_006905	GCG	2	6	1068194	1068199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_006905	GCA	2	6	1068208	1068213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_006905	GGT	2	6	1068244	1068249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_006905	AGA	2	6	1068292	1068297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_006905	GCA	2	6	1068310	1068315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_006905	CG	3	6	1068328	1068333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_006905	CAG	2	6	1068335	1068340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_006905	CGG	2	6	1068396	1068401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_006905	CCCGCG	2	12	1068474	1068485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_006905	A	6	6	1068563	1068568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_006905	GCT	2	6	1068571	1068576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_006905	CGT	2	6	1068875	1068880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_006905	CGG	2	6	1068897	1068902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_006905	GC	3	6	1068936	1068941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_006905	ATT	2	6	1069076	1069081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_006905	CGA	2	6	1069087	1069092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_006905	CAT	2	6	1069198	1069203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_006905	CCGTAT	2	12	1069231	1069242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_006905	CGTG	2	8	1069306	1069313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_006905	CAG	2	6	1069349	1069354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_006905	AGC	2	6	1069356	1069361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_006905	ACGC	2	8	1069453	1069460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_006905	GAG	2	6	1069475	1069480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_006905	CTG	2	6	1069481	1069486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_006905	GAAGTT	2	12	1069511	1069522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_006905	GGCT	2	8	1069538	1069545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_006905	GC	3	6	1069560	1069565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_006905	TGG	2	6	1069611	1069616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_006905	GC	3	6	1069637	1069642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_006905	CTG	2	6	1069676	1069681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_006905	GCG	2	6	1069694	1069699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_006905	TCA	2	6	1069761	1069766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_006905	CGC	2	6	1069768	1069773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_006905	ACG	2	6	1069802	1069807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_006905	CATGTT	2	12	1069844	1069855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3617	NC_006905	CGC	2	6	1070007	1070012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_006905	ACA	2	6	1070021	1070026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_006905	GCG	2	6	1070052	1070057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_006905	GCC	2	6	1070061	1070066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_006905	TC	3	6	1070086	1070091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_006905	CTT	2	6	1070114	1070119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_006905	TTAGG	2	10	1070124	1070133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_006905	TA	3	6	1070152	1070157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_006905	GAA	2	6	1072134	1072139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_006905	TGT	2	6	1072153	1072158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_006905	ACA	2	6	1072279	1072284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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