MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006905	A	6	6	4312520	4312525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_006905	CG	3	6	4312570	4312575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15003	NC_006905	CTG	2	6	4312583	4312588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_006905	AGCGCC	2	12	4312593	4312604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_006905	AGC	2	6	4312635	4312640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_006905	GCG	2	6	4312659	4312664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_006905	A	6	6	4315972	4315977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_006905	GAC	2	6	4315997	4316002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_006905	GCC	2	6	4316023	4316028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_006905	GCA	3	9	4316036	4316044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_006905	ACTT	2	8	4316181	4316188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15012	NC_006905	GCC	2	6	4316217	4316222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15013	NC_006905	GCT	2	6	4316839	4316844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_006905	AAT	2	6	4316860	4316865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_006905	AAC	2	6	4316869	4316874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_006905	C	6	6	4320153	4320158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15017	NC_006905	A	7	7	4320182	4320188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_006905	GCC	2	6	4321280	4321285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15019	NC_006905	GC	3	6	4324758	4324763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_006905	ATC	2	6	4326073	4326078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_006905	TCG	2	6	4326091	4326096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_006905	GCG	2	6	4326097	4326102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_006905	TCG	2	6	4326115	4326120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_006905	CAGCGG	2	12	4326161	4326172	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_006905	GAA	2	6	4326195	4326200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_006905	CAG	2	6	4326370	4326375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_006905	CAG	2	6	4326471	4326476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_006905	GCC	2	6	4326477	4326482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15029	NC_006905	CTT	2	6	4326579	4326584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_006905	GAT	2	6	4326601	4326606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_006905	GAT	2	6	4326628	4326633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_006905	GAT	2	6	4326673	4326678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_006905	GCC	2	6	4326679	4326684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15034	NC_006905	GGTCG	2	10	4326694	4326703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15035	NC_006905	CGC	2	6	4326753	4326758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_006905	GGCT	2	8	4326787	4326794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_006905	CA	3	6	4326808	4326813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15038	NC_006905	TGT	3	9	4326840	4326848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_006905	TGT	2	6	4326872	4326877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_006905	CTT	2	6	4326894	4326899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_006905	TCT	2	6	4326908	4326913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_006905	CTG	2	6	4326928	4326933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_006905	CTT	2	6	4326964	4326969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_006905	CGG	2	6	4327005	4327010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_006905	CTT	2	6	4327011	4327016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_006905	TGC	2	6	4327044	4327049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_006905	AGT	2	6	4327053	4327058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_006905	GGC	2	6	4327078	4327083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_006905	GT	3	6	4327085	4327090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_006905	CATC	2	8	4327149	4327156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_006905	TAA	2	6	4327161	4327166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_006905	CGT	2	6	4327170	4327175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_006905	GCT	2	6	4327180	4327185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_006905	CAC	2	6	4327189	4327194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15055	NC_006905	TTC	2	6	4327214	4327219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_006905	GCA	2	6	4327220	4327225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_006905	GCC	2	6	4327243	4327248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_006905	AGC	2	6	4327281	4327286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_006905	TGC	2	6	4327355	4327360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_006905	CGA	2	6	4327385	4327390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_006905	GCC	2	6	4327399	4327404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_006905	TCCA	2	8	4327435	4327442	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15063	NC_006905	C	6	6	4327517	4327522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15064	NC_006905	CAG	2	6	4327528	4327533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15067	NC_006905	GAC	2	6	4327617	4327622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_006905	GTT	2	6	4327623	4327628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15070	NC_006905	GCG	2	6	4327726	4327731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15072	NC_006905	CAG	2	6	4327942	4327947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15074	NC_006905	CA	3	6	4327997	4328002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15075	NC_006905	GCCG	2	8	4328007	4328014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_006905	TG	3	6	4328139	4328144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15089	NC_006905	CAG	2	6	4328772	4328777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15093	NC_006905	GAA	2	6	4329226	4329231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15100	NC_006905	CGT	2	6	4329546	4329551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_006905	AC	3	6	4329647	4329652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15102	NC_006905	GTAG	2	8	4329688	4329695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15104	NC_006905	AAG	2	6	4329801	4329806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_006905	CA	3	6	4329823	4329828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_006905	TGA	2	6	4329836	4329841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15108	NC_006905	TG	3	6	4329969	4329974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_006905	AAC	2	6	4330072	4330077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_006905	GTT	2	6	4330082	4330087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_006905	TC	3	6	4330094	4330099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15112	NC_006905	GCG	2	6	4330392	4330397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15114	NC_006905	TG	3	6	4330433	4330438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_006905	GC	3	6	4330460	4330465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15116	NC_006905	G	6	6	4330553	4330558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15119	NC_006905	GTAC	2	8	4330667	4330674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15120	NC_006905	TG	3	6	4330699	4330704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_006905	GGA	2	6	4330874	4330879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_006905	AC	3	6	4331092	4331097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_006905	CGTC	2	8	4331110	4331117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15124	NC_006905	AAC	2	6	4331129	4331134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15127	NC_006905	AAAG	2	8	4331233	4331240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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